Euphorbia caput-medusae latent virus

Basic Information

Genus Capulavirus
NCBI Assembly GCF_001654365.1
Isolate South Africa: Western Cape, Darling
Release date 2016/6/2
Submitter Bernardo,P., Muhire,B., Francois,S., Deshoux,M., Hartnady,P., Farkas,K., Kraberger,S., Filloux,D., Fernandez,E., Galzi,S., Ferdinand,R., Granier,M., Marais,A., Monge Blasco,P., Candresse,T., Escriu,F., Varsani,A., Harkins,G.W., Martin,D.P., Roumagnac,P., Frilander,M.J., Monge,P., Peterschmitt,M., Laine,A.L.
Host
Vector
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Genomic Organization

JBrowse

Genome

NC_030238
TAATATTACCGGTTTCGCTGTGGGCCCCACTCACGCTTTTGTCGGCCGCAATTATTGACTGGTCAAAAAGTATTTATGTGACGTGGCATTATATATACCATAAGCAGTGATCTGGATGAGGATCTGAATGTTCTCGAAGAGGTCATTGGGACATCCTAGTACTGTTTATGGAATATTGTGCCTCCTTAATTTTTTGGTGGCAGAATATTTTATTAATTTTTATTTTTTCATTTATTATTTTTATAAATGGAAAAACGTTTCTACTTCTCAGAAGAACTTCCGGATACGTACGGGAAGTTACAGGGCTTCTGCACAGAATACTTCTTGGGCTTGATGATAGAGAAGGCCCAAGAACTGGGCCTCTTTCAAGAGGCCTACAGATACCGTACTCTGAGACAGGCCTTCAGACAATCTCAGAGGAGGAAAGATAAATGGGCCATAAAAGTGGCCCAATTTAACGGAGATTTGACGGCGGCTATAAATAGCGGCCGATTGTTTGGGCTCGAGGCCCAAAAATATTTAGATTACAAATCCCAAGTTGAGAATGGTGACTACAAGATCGGGACGCAATTACCAGGCCCTGGTCCCAACATGGGCCCGAAAGAAGAGAAGGTCCACCCTAGCCCGGAGTACAATAGTTGGGCCGATTAGAAGGCCCAATTACCAGTACAAGACCAGATACACTCCTCATAGGCCTCAACACAAGATTCACTCTCTTAGCCAGACCCGGGTTGTTAGCGGATCTGATAATGGTTATGGGTGGCATGTATCGGGTGTTAATATAGGATCCGGTTTCGAAGACAGACACAGTGACAAGATTAAGATAATTAATCTTAAGTTTATGATGCAGTTAAAGACTTCAGATGCCGGTCAACAGGCATCTTGTTACCATAATTTGTATATGTTTTTAGTTAAAGATAATTCTGGTGGAGCCCAAGTTCCCAAGTTTAATTCAATAGTAATGATGGATAATTCAAATCCAGCTACTGCAGAGGTTGACCACGATAGTAAAGACCGATTTACTATTGTACGGAGATGGAAGTTTAGCTTTAAGGGTAATTCATCTAAAAACGGCACCGCATACGACTGTGCTCGTAATTTAATTGATTTTAATAGAAATGTTAAAATCAATTCTGTTAGCGAGTTTAAATCCGCTACGGATGGTTCATATGCAAATACACAGAAGAATGCATGGGTTCTGTATATTGTACCACAGATATACGATTGTACTGTAGACGGACATGTAAAAATAAAATACGTATCTATTGTGTAATATATTAGCACGAGAGTGTAATTAATAAAAAGGGTCTTTTATTTCAATATTTAGCACATTATGTGTACTCCATTCGTACATTTCAGAATTAGCTAGAGCAATCCTATAGGATTGATCGGGATTGCACAATATAATTGTTGGAATCCCTCCTTTAATCCTAGTTTTTTTACGGTATTTTTCATTTACCGTAAAATCTTTCTGACAGCCTAGTAATTCTTTTTTACAAGGTAAATACTGGAACGGAATATCATCAATTACATTATACAAAGCAAATACATCATAATTACTAAAGTCAACCCCTCCACAGTAATAGTTGTGTCTTCCAAGGCTTCTGGCCCACGCAGTCTTGCCTGTCTTGGAGGGTCCCTCGATTATTAATGTGATTGGTCGATCAGGTTTCTGGTCCTGAGTCATTAATAATTATTGGTTCATCAATATTATTAATTAATTCATCATTAATAAATTCAGTTGTTAAATCATGGGCCCATCTAATATCCTCAATAGTCAAATCGGCCCCTAATAATTGAATTGCATGGGCACTTACTGTGAAGAGATTTGTCTCGGCCCATTGTTGAATGGGCTCGGGGATGCGAGGAAAATTGACAAATCTGGGTTCGAACACAGTAATGGGCTCGGGCCATTTACTGTTTGCTGCATACTCCAGATTTCTGAGTTGAGTGGCCCAGACATATGGTTGCTCATGTTGGACTCTGGCGAGGAATTCGGACTTGGATGTGGATTCAGTGAGGATGGAGGCCCAAATTGTATCCCTTGTCTTCTTAGGGCTTCTTCTACTTGCCCTAAGTATTCCTCGTTCCTCAAATTGTCCTCCCTTGGCAATATAGTCTGCCACATCTGCATCTCTTCTTGGGACCTGGCAATTGGGGTGGTATGTGGCCACTCCATTTGGGTCCTTGATGTCGAAGAACCGTTGGTTGGTTGTGTTGAGCCTCTTGTCCATCTGGACAAGGCAGTGAAGGTGTGGCTCACCGTCTTGGTGATTCTCCGTACATACCCTAGCATATGTAGGGTTAAAATTATTTAATAGTTGATATAAATAATCAATTAAAAAAATAGGAAGAAGAGGGCATTTTGGGTAAGTCAGAAAAATAGACTTACCTTGTAAGCGGAATGTGTTGTTGGGTTGACGAGGCATATTTTCAAAATGACCAAAAGGGTAAAAAATTGCTTATAGAGAAGAGTTTTTGGAAAACTTTATCTATTACAGGTTGAGGTGAGCAGGTGAGCAGCGAGCAGCGGATTTAAATAATATATTTGAACGGCTGAGATGATGCCACGTGGCATCATCTTATGAAGTTGCTTTATTAAAAGCAGAAAGAATCTTTTGACTACTTTTTTGTCGGTGGCGTATAAAATACGCGTCACGTGGTTGGTCCTCAGCGAAACCGA

Gene Information

NCBI Accession YP_009255243.1
Location 128-334
Protein Name V2
Coding Region ATGTTCTCGAAGAGGTCATTGGGACATCCTAGTACTGTTTATGGAATATTGTGCCTCCTTAATTTTTTGGTGGCAGAATATTTTATTAATTTTTATTTTTTCATTTATTATTTTTATAAATGGAAAAACGTTTCTACTTCTCAGAAGAACTTCCGGATACGTACGGGAAGTTACAGGGCTTCTGCACAGAATACTTCTTGGGCTTGA
Protein Sequence MFSKRSLGHPSTVYGILCLLNFLVAEYFINFYFFIYYFYKWKNVSTSQKNFRIRTGSYRASAQNTSWA

NCBI Accession YP_009255244.1
Location 168-431
Protein Name V4
Coding Region ATGGAATATTGTGCCTCCTTAATTTTTTGGTGGCAGAATATTTTATTAATTTTTATTTTTTCATTTATTATTTTTATAAATGGAAAAACGTTTCTACTTCTCAGAAGAACTTCCGGATACGTACGGGAAGTTACAGGGCTTCTGCACAGAATACTTCTTGGGCTTGATGATAGAGAAGGCCCAAGAACTGGGCCTCTTTCAAGAGGCCTACAGATACCGTACTCTGAGACAGGCCTTCAGACAATCTCAGAGGAGGAAAGATAA
Protein Sequence MEYCASLIFWWQNILLIFIFSFIIFINGKTFLLLRRTSGYVREVTGLLHRILLGLDDREGPRTGPLSRGLQIPYSETGLQTISEEER

NCBI Accession YP_009255245.1
Location 247-651
Protein Name V3
Coding Region ATGGAAAAACGTTTCTACTTCTCAGAAGAACTTCCGGATACGTACGGGAAGTTACAGGGCTTCTGCACAGAATACTTCTTGGGCTTGATGATAGAGAAGGCCCAAGAACTGGGCCTCTTTCAAGAGGCCTACAGATACCGTACTCTGAGACAGGCCTTCAGACAATCTCAGAGGAGGAAAGATAAATGGGCCATAAAAGTGGCCCAATTTAACGGAGATTTGACGGCGGCTATAAATAGCGGCCGATTGTTTGGGCTCGAGGCCCAAAAATATTTAGATTACAAATCCCAAGTTGAGAATGGTGACTACAAGATCGGGACGCAATTACCAGGCCCTGGTCCCAACATGGGCCCGAAAGAAGAGAAGGTCCACCCTAGCCCGGAGTACAATAGTTGGGCCGATTAG
Protein Sequence MEKRFYFSEELPDTYGKLQGFCTEYFLGLMIEKAQELGLFQEAYRYRTLRQAFRQSQRRKDKWAIKVAQFNGDLTAAINSGRLFGLEAQKYLDYKSQVENGDYKIGTQLPGPGPNMGPKEEKVHPSPEYNSWAD

NCBI Accession YP_009255246.1
Location 545-1273
Protein Name coat protein
Coding Region ATGGTGACTACAAGATCGGGACGCAATTACCAGGCCCTGGTCCCAACATGGGCCCGAAAGAAGAGAAGGTCCACCCTAGCCCGGAGTACAATAGTTGGGCCGATTAGAAGGCCCAATTACCAGTACAAGACCAGATACACTCCTCATAGGCCTCAACACAAGATTCACTCTCTTAGCCAGACCCGGGTTGTTAGCGGATCTGATAATGGTTATGGGTGGCATGTATCGGGTGTTAATATAGGATCCGGTTTCGAAGACAGACACAGTGACAAGATTAAGATAATTAATCTTAAGTTTATGATGCAGTTAAAGACTTCAGATGCCGGTCAACAGGCATCTTGTTACCATAATTTGTATATGTTTTTAGTTAAAGATAATTCTGGTGGAGCCCAAGTTCCCAAGTTTAATTCAATAGTAATGATGGATAATTCAAATCCAGCTACTGCAGAGGTTGACCACGATAGTAAAGACCGATTTACTATTGTACGGAGATGGAAGTTTAGCTTTAAGGGTAATTCATCTAAAAACGGCACCGCATACGACTGTGCTCGTAATTTAATTGATTTTAATAGAAATGTTAAAATCAATTCTGTTAGCGAGTTTAAATCCGCTACGGATGGTTCATATGCAAATACACAGAAGAATGCATGGGTTCTGTATATTGTACCACAGATATACGATTGTACTGTAGACGGACATGTAAAAATAAAATACGTATCTATTGTGTAA
Protein Sequence MVTTRSGRNYQALVPTWARKKRRSTLARSTIVGPIRRPNYQYKTRYTPHRPQHKIHSLSQTRVVSGSDNGYGWHVSGVNIGSGFEDRHSDKIKIINLKFMMQLKTSDAGQQASCYHNLYMFLVKDNSGGAQVPKFNSIVMMDNSNPATAEVDHDSKDRFTIVRRWKFSFKGNSSKNGTAYDCARNLIDFNRNVKINSVSEFKSATDGSYANTQKNAWVLYIVPQIYDCTVDGHVKIKYVSIV

NCBI Accession YP_009255247.1
Location 1295-1678,1818-2429
Protein Name replication-associated protein
Coding Region ATGCCTCGTCAACCCAACAACACATTCCGCTTACAAGGTAAGTCTATTTTTCTGACTTACCCAAAATGCCCTCTTCTTCCTATTTTTTTAATTGATTATTTATATCAACTATTAAATAATTTTAACCCTACATATGCTAGGGTATGTACGGAGAATCACCAAGACGGTGAGCCACACCTTCACTGCCTTGTCCAGATGGACAAGAGGCTCAACACAACCAACCAACGGTTCTTCGACATCAAGGACCCAAATGGAGTGGCCACATACCACCCCAATTGCCAGGTCCCAAGAAGAGATGCAGATGTGGCAGACTATATTGCCAAGGGAGGACAATTTGAGGAACGAGGAATACTTAGGGCAAGTAGAAGAAGCCCTAAGAAGACAAGGGATACAATTTGGGCCTCCATCCTCACTGAATCCACATCCAAGTCCGAATTCCTCGCCAGAGTCCAACATGAGCAACCATATGTCTGGGCCACTCAACTCAGAAATCTGGAGTATGCAGCAAACAGTAAATGGCCCGAGCCCATTACTGTGTTCGAACCCAGATTTGTCAATTTTCCTCGCATCCCCGAGCCCATTCAACAATGGGCCGAGACAAATCTCTTCACAGACCAGAAACCTGATCGACCAATCACATTAATAATCGAGGGACCCTCCAAGACAGGCAAGACTGCGTGGGCCAGAAGCCTTGGAAGACACAACTATTACTGTGGAGGGGTTGACTTTAGTAATTATGATGTATTTGCTTTGTATAATGTAATTGATGATATTCCGTTCCAGTATTTACCTTGTAAAAAAGAATTACTAGGCTGTCAGAAAGATTTTACGGTAAATGAAAAATACCGTAAAAAAACTAGGATTAAAGGAGGGATTCCAACAATTATATTGTGCAATCCCGATCAATCCTATAGGATTGCTCTAGCTAATTCTGAAATGTACGAATGGAGTACACATAATGTGCTAAATATTGAAATAAAAGACCCTTTTTATTAA
Protein Sequence MPRQPNNTFRLQGKSIFLTYPKCPLLPIFLIDYLYQLLNNFNPTYARVCTENHQDGEPHLHCLVQMDKRLNTTNQRFFDIKDPNGVATYHPNCQVPRRDADVADYIAKGGQFEERGILRASRRSPKKTRDTIWASILTESTSKSEFLARVQHEQPYVWATQLRNLEYAANSKWPEPITVFEPRFVNFPRIPEPIQQWAETNLFTDQKPDRPITLIIEGPSKTGKTAWARSLGRHNYYCGGVDFSNYDVFALYNVIDDIPFQYLPCKKELLGCQKDFTVNEKYRKKTRIKGGIPTIILCNPDQSYRIALANSEMYEWSTHNVLNIEIKDPFY

NCBI Accession YP_009255248.1
Location 1665-2429
Protein Name RepA
Coding Region ATGCCTCGTCAACCCAACAACACATTCCGCTTACAAGGTAAGTCTATTTTTCTGACTTACCCAAAATGCCCTCTTCTTCCTATTTTTTTAATTGATTATTTATATCAACTATTAAATAATTTTAACCCTACATATGCTAGGGTATGTACGGAGAATCACCAAGACGGTGAGCCACACCTTCACTGCCTTGTCCAGATGGACAAGAGGCTCAACACAACCAACCAACGGTTCTTCGACATCAAGGACCCAAATGGAGTGGCCACATACCACCCCAATTGCCAGGTCCCAAGAAGAGATGCAGATGTGGCAGACTATATTGCCAAGGGAGGACAATTTGAGGAACGAGGAATACTTAGGGCAAGTAGAAGAAGCCCTAAGAAGACAAGGGATACAATTTGGGCCTCCATCCTCACTGAATCCACATCCAAGTCCGAATTCCTCGCCAGAGTCCAACATGAGCAACCATATGTCTGGGCCACTCAACTCAGAAATCTGGAGTATGCAGCAAACAGTAAATGGCCCGAGCCCATTACTGTGTTCGAACCCAGATTTGTCAATTTTCCTCGCATCCCCGAGCCCATTCAACAATGGGCCGAGACAAATCTCTTCACAGTAAGTGCCCATGCAATTCAATTATTAGGGGCCGATTTGACTATTGAGGATATTAGATGGGCCCATGATTTAACAACTGAATTTATTAATGATGAATTAATTAATAATATTGATGAACCAATAATTATTAATGACTCAGGACCAGAAACCTGA
Protein Sequence MPRQPNNTFRLQGKSIFLTYPKCPLLPIFLIDYLYQLLNNFNPTYARVCTENHQDGEPHLHCLVQMDKRLNTTNQRFFDIKDPNGVATYHPNCQVPRRDADVADYIAKGGQFEERGILRASRRSPKKTRDTIWASILTESTSKSEFLARVQHEQPYVWATQLRNLEYAANSKWPEPITVFEPRFVNFPRIPEPIQQWAETNLFTVSAHAIQLLGADLTIEDIRWAHDLTTEFINDELINNIDEPIIINDSGPET

NCBI Accession YP_009255249.1
Location 1814-2296
Protein Name C3
Coding Region ATGCTAGGGTATGTACGGAGAATCACCAAGACGGTGAGCCACACCTTCACTGCCTTGTCCAGATGGACAAGAGGCTCAACACAACCAACCAACGGTTCTTCGACATCAAGGACCCAAATGGAGTGGCCACATACCACCCCAATTGCCAGGTCCCAAGAAGAGATGCAGATGTGGCAGACTATATTGCCAAGGGAGGACAATTTGAGGAACGAGGAATACTTAGGGCAAGTAGAAGAAGCCCTAAGAAGACAAGGGATACAATTTGGGCCTCCATCCTCACTGAATCCACATCCAAGTCCGAATTCCTCGCCAGAGTCCAACATGAGCAACCATATGTCTGGGCCACTCAACTCAGAAATCTGGAGTATGCAGCAAACAGTAAATGGCCCGAGCCCATTACTGTGTTCGAACCCAGATTTGTCAATTTTCCTCGCATCCCCGAGCCCATTCAACAATGGGCCGAGACAAATCTCTTCACAGTAA
Protein Sequence MLGYVRRITKTVSHTFTALSRWTRGSTQPTNGSSTSRTQMEWPHTTPIARSQEEMQMWQTILPREDNLRNEEYLGQVEEALRRQGIQFGPPSSLNPHPSPNSSPESNMSNHMSGPLNSEIWSMQQTVNGPSPLLCSNPDLSIFLASPSPFNNGPRQISSQ