Juncus maritimus geminivirus 1
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Genomic Organization
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Genome
TAATATTACCGGATGGCCGTTTTTTCTTTAGGCGGCCAATGAGAAGGAGACACGTAGAGGAGATAGATATTGCGTAGTGGGCCCCACATGTCTTGAAGGGTGCTAGTGGGGTTCTTATTGTTTTTTAAATACTTAGCCCCCAAGTTTGTATTTTTATGGCGGATAAATTCTGTAATTACCTAGATAAAAGACAAGTGGAGCCTGCGGAGTTACTGCCCTTAATTACCAGGTGGATCGTTGAGAAGGGTTCTGCTCAGCAGTTCATTGATTGGATCAATGGATTACAGCGGGAGGAAAAGGAGATATTCAGGGCCCTCAACGCCTGTTCAGATAGCAAAGAGGATGATGACGATCCGGAAGAGGTTCAACTCAGGGTCGGTCCGTCGAGCTCTGTTCCAAAGCCCATATTACAGGCCCAATCTGATGGGCTTCAGGAGGAGGTCCAAATCCATATTTCCTGACAAGGGCTATCATGATGACGAGGACCATTGGGGTGATTTCTCCAGCTCTGCTGGTGTTACTAATTATGTCTCTATGCCCTATTTGGGCCAGGCCAAGAATCAGAGGCATACTAACAAGATCAAGATATGGTCTATATCTGCAAATGGGGCCTTACATATCAAGACCGCTGGGGCTAATCCAGACACTATTATTGCAACTGTGTTCCTTATGTGGGCTCATAATCCCAATGGTGGTTCTAACCCTCCTGCCTTTAATGATGTATTTACTACTAGTACGAACATGGATGACCAGCACAATCCTTCTTGTGCCAAGATCAAGCATCCTATGCTTGCCTATTATAAGTGTCTTGCTAGGAAGCACATTGTTCTGATCCCTTACACCAATTATTGTGCAGGAGAAAACCGTGCTCTTTTTAATATTAATATTAAGTTTAGGGGTAGGAATGCCAAGTACGTAGAGTTTGGGGAGTCCTCCAGTGGTGGATCATATTCAGACATTAAGTCTGGTGGTCTTTTTTATTATGTCAGGTATTATAGTCCTGATCCTGCTGCTAGATTGGAGGGAGACTGGAATTGTAGGGTAATATATTATCATTAATAAATGTTGAACATTACAATATTTCTTTGCTCCTCAATGTTTACAATCCATAAACATTTTGCAATTAATTTATTAATTGCTCTAATCATAAGGTTAATTGAAATTACACCGCAAGAATCTAAGAAAGACATTAAATGAAACCTAATCCTATGTTCTAAAGATTTCTTCCCAAAGCTCTTCAAGGTCGTCCAGATCTTGAATGTTATCCAGCATTTGTGAAGTCCCAGTGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGAACTTGACTGTGACCTGGAATCCTTTGTTGAATGTTGGGAAGATGTCCCAATCCTTGTCTATGTTGACATTGATTGGGTTCTTCAGTTCGTCGAACCATATCCCGGAATTGGCCTGGTGTGCAGTGATTGTATCCCCTGTGCGAGAATCCATGTTCGCAGTCTGGGTGTCTGTATATGATGCACTGACACGGACAGTTTATCCGCTTTCTTCTCTTGGGTGCTTTGGCCTTTTTATGTATGAGTTTCTGTGGAGGAATTTGAATTTGAACTGAAGAGGGGGGAGGTGAGCTGTACGAAGACCGCATTTTTAATTGTCCAGTTTTTCAGGCCCTCGTTTTCCTCTTTATCAAGATATTGTTGATAAGAGGACCCCACCCCTGGATTGCAGAGCACGATTGTGGAGATGCTGCCTTTAATTTGAATTGGTTTTCCATACTTTAAGTTGGATTGCCAATCAGACTGGGCCCCAATAAATTCTTTCCAGTGCTTTAGGTATTGCGGATTGACGTCATCAATGATGTTGTACTCAGCATCATTGGAAAACACTTTACTGTTGAGATCAATGTGCCCGGCAAGGTAGTTGTGCTTGCCCAGCGATCTTGCCCACATAGTCTTCCCTGTTCTTGAGTCACCTTCTATTATAATACTATTATATCTTAATGGCCGCGCAGCGGCACTAACTCCAAAATATCCATCAGCCCACTCTTGCATCTCTTCTGGAACATTATTGAATGAAGAGAGGGGAAACGGAGGAGTCCATAAAGGGATCTCTGGAGCAAAAATCCTATCTAAATTACTGCTTAAATTATGAAATTGTAAAACATAATCCTTAGGGGCTAATTCCCTTATGACTCTAAGAGCCTCTGACTTACTGCCTGTGTTAATTGCTGAGGCGTAAGCGTCGTTGGCTGATTGTTGACCTCCCCTTGCTGATCGGCCGTCGATCTGGAATTCTCCCCAGTCGGCGAATTGACCGTCCTTCTCGATATAGTTCTTGACGTCAGAGCTTGATTTAGCTCCCTGAATGTTGCAATGGAAATGTGCTGACCTGCTTGGGGATATGAGGTCGAAGAATCTTGGATTCGTGCGCTTGTATTTCCCCTCGAATTGCACCAGGGCATGCAAGTGAGGAGACCCATCCTCGTGCTGTTCTTGACACACCCTGATGAATTTCTTATTAACTGGGGTTTGTAGGTATTTTAGTTGGGAAAGTGTTTCGTCGATTGATAATGAGCATTGGGGATAAGTGAGGAAATAGTTTTTGGCATATATTTGGAAACGTTTGGGAGGAGCCATGTTTTACAAAATTGCCCTTGGGTACCAATTGAGCCGCTCTCATAACTCTCTAGGTATCGGTATATCGGTAACCAATTTATATGAGAGCCTCTAATCTCAAATAGATATCATCAGCACACGTGGCGGCCATCCGTA
Gene Information
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NCBI Accession
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AUT11864.1
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Location
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156-461 |
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Protein Name
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movement protein |
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Coding Region
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ATGGCGGATAAATTCTGTAATTACCTAGATAAAAGACAAGTGGAGCCTGCGGAGTTACTGCCCTTAATTACCAGGTGGATCGTTGAGAAGGGTTCTGCTCAGCAGTTCATTGATTGGATCAATGGATTACAGCGGGAGGAAAAGGAGATATTCAGGGCCCTCAACGCCTGTTCAGATAGCAAAGAGGATGATGACGATCCGGAAGAGGTTCAACTCAGGGTCGGTCCGTCGAGCTCTGTTCCAAAGCCCATATTACAGGCCCAATCTGATGGGCTTCAGGAGGAGGTCCAAATCCATATTTCCTGA |
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Protein Sequence
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MADKFCNYLDKRQVEPAELLPLITRWIVEKGSAQQFIDWINGLQREEKEIFRALNACSDSKEDDDDPEEVQLRVGPSSSVPKPILQAQSDGLQEEVQIHIS |
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NCBI Accession
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AUT11865.1
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Location
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277-1059 |
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Protein Name
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capsid protein |
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Coding Region
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ATGGATTACAGCGGGAGGAAAAGGAGATATTCAGGGCCCTCAACGCCTGTTCAGATAGCAAAGAGGATGATGACGATCCGGAAGAGGTTCAACTCAGGGTCGGTCCGTCGAGCTCTGTTCCAAAGCCCATATTACAGGCCCAATCTGATGGGCTTCAGGAGGAGGTCCAAATCCATATTTCCTGACAAGGGCTATCATGATGACGAGGACCATTGGGGTGATTTCTCCAGCTCTGCTGGTGTTACTAATTATGTCTCTATGCCCTATTTGGGCCAGGCCAAGAATCAGAGGCATACTAACAAGATCAAGATATGGTCTATATCTGCAAATGGGGCCTTACATATCAAGACCGCTGGGGCTAATCCAGACACTATTATTGCAACTGTGTTCCTTATGTGGGCTCATAATCCCAATGGTGGTTCTAACCCTCCTGCCTTTAATGATGTATTTACTACTAGTACGAACATGGATGACCAGCACAATCCTTCTTGTGCCAAGATCAAGCATCCTATGCTTGCCTATTATAAGTGTCTTGCTAGGAAGCACATTGTTCTGATCCCTTACACCAATTATTGTGCAGGAGAAAACCGTGCTCTTTTTAATATTAATATTAAGTTTAGGGGTAGGAATGCCAAGTACGTAGAGTTTGGGGAGTCCTCCAGTGGTGGATCATATTCAGACATTAAGTCTGGTGGTCTTTTTTATTATGTCAGGTATTATAGTCCTGATCCTGCTGCTAGATTGGAGGGAGACTGGAATTGTAGGGTAATATATTATCATTAA |
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Protein Sequence
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MDYSGRKRRYSGPSTPVQIAKRMMTIRKRFNSGSVRRALFQSPYYRPNLMGFRRRSKSIFPDKGYHDDEDHWGDFSSSAGVTNYVSMPYLGQAKNQRHTNKIKIWSISANGALHIKTAGANPDTIIATVFLMWAHNPNGGSNPPAFNDVFTTSTNMDDQHNPSCAKIKHPMLAYYKCLARKHIVLIPYTNYCAGENRALFNINIKFRGRNAKYVEFGESSSGGSYSDIKSGGLFYYVRYYSPDPAARLEGDWNCRVIYYH |
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NCBI Accession
|
AUT11868.1
|
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Location
|
1056-1460 |
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Protein Name
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REn |
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Coding Region
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ATGGATTCTCGCACAGGGGATACAATCACTGCACACCAGGCCAATTCCGGGATATGGTTCGACGAACTGAAGAACCCAATCAATGTCAACATAGACAAGGATTGGGACATCTTCCCAACATTCAACAAAGGATTCCAGGTCACAGTCAAGTTCAACCACAACCTGAGGAAAGCACTGGGACTTCACAAATGCTGGATAACATTCAAGATCTGGACGACCTTGAAGAGCTTTGGGAAGAAATCTTTAGAACATAGGATTAGGTTTCATTTAATGTCTTTCTTAGATTCTTGCGGTGTAATTTCAATTAACCTTATGATTAGAGCAATTAATAAATTAATTGCAAAATGTTTATGGATTGTAAACATTGAGGAGCAAAGAAATATTGTAATGTTCAACATTTATTAA |
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Protein Sequence
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MDSRTGDTITAHQANSGIWFDELKNPINVNIDKDWDIFPTFNKGFQVTVKFNHNLRKALGLHKCWITFKIWTTLKSFGKKSLEHRIRFHLMSFLDSCGVISINLMIRAINKLIAKCLWIVNIEEQRNIVMFNIY |
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NCBI Accession
|
AUT11867.1
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Location
|
1207-1614 |
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Protein Name
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TrAP |
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Coding Region
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ATGCGGTCTTCGTACAGCTCACCTCCCCCCTCTTCAGTTCAAATTCAAATTCCTCCACAGAAACTCATACATAAAAAGGCCAAAGCACCCAAGAGAAGAAAGCGGATAAACTGTCCGTGTCAGTGCATCATATACAGACACCCAGACTGCGAACATGGATTCTCGCACAGGGGATACAATCACTGCACACCAGGCCAATTCCGGGATATGGTTCGACGAACTGAAGAACCCAATCAATGTCAACATAGACAAGGATTGGGACATCTTCCCAACATTCAACAAAGGATTCCAGGTCACAGTCAAGTTCAACCACAACCTGAGGAAAGCACTGGGACTTCACAAATGCTGGATAACATTCAAGATCTGGACGACCTTGAAGAGCTTTGGGAAGAAATCTTTAGAACATAG |
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Protein Sequence
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MRSSYSSPPPSSVQIQIPPQKLIHKKAKAPKRRKRINCPCQCIIYRHPDCEHGFSHRGYNHCTPGQFRDMVRRTEEPNQCQHRQGLGHLPNIQQRIPGHSQVQPQPEESTGTSQMLDNIQDLDDLEELWEEIFRT |
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NCBI Accession
|
AUT11866.1
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Location
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1541-2605 |
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Protein Name
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replication associated protein |
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Coding Region
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ATGGCTCCTCCCAAACGTTTCCAAATATATGCCAAAAACTATTTCCTCACTTATCCCCAATGCTCATTATCAATCGACGAAACACTTTCCCAACTAAAATACCTACAAACCCCAGTTAATAAGAAATTCATCAGGGTGTGTCAAGAACAGCACGAGGATGGGTCTCCTCACTTGCATGCCCTGGTGCAATTCGAGGGGAAATACAAGCGCACGAATCCAAGATTCTTCGACCTCATATCCCCAAGCAGGTCAGCACATTTCCATTGCAACATTCAGGGAGCTAAATCAAGCTCTGACGTCAAGAACTATATCGAGAAGGACGGTCAATTCGCCGACTGGGGAGAATTCCAGATCGACGGCCGATCAGCAAGGGGAGGTCAACAATCAGCCAACGACGCTTACGCCTCAGCAATTAACACAGGCAGTAAGTCAGAGGCTCTTAGAGTCATAAGGGAATTAGCCCCTAAGGATTATGTTTTACAATTTCATAATTTAAGCAGTAATTTAGATAGGATTTTTGCTCCAGAGATCCCTTTATGGACTCCTCCGTTTCCCCTCTCTTCATTCAATAATGTTCCAGAAGAGATGCAAGAGTGGGCTGATGGATATTTTGGAGTTAGTGCCGCTGCGCGGCCATTAAGATATAATAGTATTATAATAGAAGGTGACTCAAGAACAGGGAAGACTATGTGGGCAAGATCGCTGGGCAAGCACAACTACCTTGCCGGGCACATTGATCTCAACAGTAAAGTGTTTTCCAATGATGCTGAGTACAACATCATTGATGACGTCAATCCGCAATACCTAAAGCACTGGAAAGAATTTATTGGGGCCCAGTCTGATTGGCAATCCAACTTAAAGTATGGAAAACCAATTCAAATTAAAGGCAGCATCTCCACAATCGTGCTCTGCAATCCAGGGGTGGGGTCCTCTTATCAACAATATCTTGATAAAGAGGAAAACGAGGGCCTGAAAAACTGGACAATTAAAAATGCGGTCTTCGTACAGCTCACCTCCCCCCTCTTCAGTTCAAATTCAAATTCCTCCACAGAAACTCATACATAA |
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Protein Sequence
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MAPPKRFQIYAKNYFLTYPQCSLSIDETLSQLKYLQTPVNKKFIRVCQEQHEDGSPHLHALVQFEGKYKRTNPRFFDLISPSRSAHFHCNIQGAKSSSDVKNYIEKDGQFADWGEFQIDGRSARGGQQSANDAYASAINTGSKSEALRVIRELAPKDYVLQFHNLSSNLDRIFAPEIPLWTPPFPLSSFNNVPEEMQEWADGYFGVSAAARPLRYNSIIIEGDSRTGKTMWARSLGKHNYLAGHIDLNSKVFSNDAEYNIIDDVNPQYLKHWKEFIGAQSDWQSNLKYGKPIQIKGSISTIVLCNPGVGSSYQQYLDKEENEGLKNWTIKNAVFVQLTSPLFSSNSNSSTETHT |