Tomato mild yellow leaf curl Aragua virus
Basic Information
| Genus |
Begomovirus
|
| NCBI Assembly |
GCF_000870725.1 |
| Isolate |
Venezuela |
| Release date |
2015/2/13 |
| Submitter |
Zambrano,K.A., Carrillo,J., Carballo,O., Rivera-Bustamante,R., Marys,E.E., Rivera-Bustamante,R.F. |
| Host |
|
| Download |
Genome
|GFF3
|PEP
|CDS |
Genomic Organization
JBrowse
Genome
ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTGGAGTCCTCCGTTCTCGGCCCAGGCCCAAACGCATTTCTTTTGATATGGGACCACTTTAACAAAGCTGACCAATCATATTGCGTCTGACGAGTCTAGATATTTTAACTTATTCGTTAAGTTGTGGTCCCTATATATTTAGGACCATTATTGACAGAGTTATAACTTTAATTTGAAATGGTTAAGAGAGATGCCCCATGGCGATTAATGGCGGGGACCCCCAAGGTTTCGCGCTCTGTCAATTATTCCCCCCGTGGTGGTCCTAAATTAGACAAGGCCGCTGCGTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGAAAGCCCAGGATATATCGAACAGTGAGAGGGCCCGATGTTCCGAAGGGCTGTGAAGGCCCATGCAAAGTCCAGTCTTATGAGCAGCGGCACGACGTTTCCCATGTTGGTAAGGTGATGTGTATATCCGACGTGACTCGTGGTAACGGTATAACCCATCGTGTGGGGAAACGTTTTTGCGTCAAATCTGTGTACATATTAGGGAAGATTTGGATGGACGAAAACATCAAGCTGAAGAACCACACGAACAGTGTCATGTTCTGGTTGGTCCGAGACCGTAGACCGTATGGGACGCCTATGGATTTTGGGCAGGTGTTCAACATGTTCGACAACGAGCCTAGTACAGCTACTGTCAAGAACGATCTCCGCGATCGTTTTCAAGTCATGCACAAGTTCTATGCTAAGGTCACGGGTGGACAGTACGCCAGCAACGAGCAGGCATTGGTCAAGCGATTTTGGAAGGTCAACAACCATGTAGTGTACAACCATCAGGAAGCAGGGAAATACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCTTCTAATCCTGTATATGCGACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAATAAAAATTGAATTTTATTTCATGAGATTCGAGTACATCAGTTACATAGCATTTGTCTGTTGCATAACGAACAGCTCTAATTACATTATTAAGACCAACTACGCCTAACCTATCTAAGTACAATAAGACCAAATGCCTGAATCTACTTAAATAAGTCGTCCCAGAAGCTCGAACTGATGTCGTCCAAACTTGGAAGTTCAGGAATGCTTTGCGTAGATTCAGCGCCTTCCTGATGTTGTAATTGAACCGGATTTGTATGTGATAGACCCTGCTCGTTGTGTATAATGGGTCCTCTACTCGGCACATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAAATAAAAACGGAATTCTCTGCCTGAGACGCAGTGATGTTCTCCCCTGTGAGTGAATCCATGATCGGCGCAGTTGATGTGAAGGAATATGGAACAGCCGCAGTTCAAGTCGATCCGCCTACGACGAATAGCTCTCTTCTTGGCTAGCCTGTGCTGTGGTTTTATAGAGGGGGGCGTCGAGGAAGACGAATTTAGCATTTTTTAATGTCCAAGCTCTCAGTGCAGCATTTTCCTCTTTGTCGAGGAAATCTTTATAGCTGCCCCCCTCTCCTGGATTGCACAGCACGATTGATGGGATACCACCTTTAATTTGAACCGGCTTTCCATATTTACAGTTGGACTGCCAATCCTTTTGGGCCCCAATCAATTCTTTCCAGTGCTTTAGCTTTAGGTAGTGCGGTGCGACATCATCAATGACGTTATACTCCACATGATTGGAGTAAACCCTAGAATTGAAATCTAAATGACCGCTCAAGTAGTTATGTGGGCCTAAAGCACGAGCCCACATTGTCTTGCCCGTTCGTGATTCCCCTTCGACGATAATACTAATAGGTCTCTCTGGCCGCGCAGCGGAACCCCTCCCGAAATAATGATCAGCCCACTCTTGCAAATCAACCGGGACGTTAACAAACGACGAGAGTCTGAACGGCGGAACCCAAGGTTCGGGAGGCTTTTGAAAGAGGCGATCGATGTTAGCCTTTACGTTATGGTAACTGACGATGAACGTTCTAGGATCGCCAGCTTTTATAATGTCGAGAGCCTCTCCCGCACTTCCTGCATTGACGGCGTTATGGTAGACGTCGTCTTTATTTGATTTTGACCCCCCAAACACCTTATATTTCCCGGATTCACAATAATCACCCTCTTTGGTGATGTAATTCTTGACGGCGTTGGTGTCTTTGGCAGCCTGAATGTTTGGGTGAAAACAGGCTGACCGTCTGGGGTGAGTAATGTCGAAAAATCTAGCATCCTTGATGTTGGACTTGCCAGATAATTGTATGAGGCAGTGTAAGTGCGGGAACCCATCGCGATGTTCCTCTCTGGCGACTCGGATGTACGACGGTTTAACGATCGACCACGGTAGGTTGTGAAGCAACTGAAGAAATTCATCTTTGGGAACATCGCATTGAGGATATGTCAAGAAAATATTTTTAGCCTGTAAACGAAAGGAATTAGGGTTCCGTGGCATATTTGTAAATATGAGCCAGGACTCCAGGAGAGCTCTCTCAAAAAGTCTATTGTTGCTGGAGTCCTGGAGTCCCATTTATACTAAAAGCCTCTAGGACTCCAAGGGACACGTGGTGCACATCGGCCATCCGCAATAATATT
ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTGGAGTCCTCCGTTCTCGGCCCAGGCCCAAGCGCCCTCTCTTGATGGTGGAAGGGACCACATACAAAAGACAAATACAGCTGGCCAATCATATTGCGTCTGACGAGTCTGCATATTAACGACTTCCTCGATAAGTTGTGGTCCTGTAACTGTAATATGTTGACGGCACTTTCCGCTTTAATTCAAAACTTAGACGCGGAGTGCCCTAATTGTCTAACGAGTTTATCTCACAACCTCTGTGGTAATGGACCACAATCGACAACATCTTGACATATCCTCAATGCGATGTTCCCAAAGATGTGTTCGACCAATGGTTGTTCAGCTACATAGATTAGGTAATATGTATAGGACACATGACCTGTGTAGTTAAATACGTTAGTGACTGGATTGGAGAACACATCTCTTCATTATAGTCATATTGGTCAATATGTATTCTTCTAAAAACAGACGTGGTGGGTCTTCTAGGCAACGACGAAGTTATTCTCGATCAATATGGTTGAAGCGCCAATATGACATGCGACGTCCCGCTGTTACGCGTTTAACGAATAGTCATAACAAGACCGACGAGGATGCTAAGCTATCGACACAGCGGATTCACGAAGACCAGTTCGGTCCGGAGTTTGTACTTGCCCATAATACAGCCATTTCGACATACATTACTTACCCTAGTATTGTTAAGACCGAACCCAATCGGACCAGGTCTTATATCAAGTTAAAACGCCTACGTTATAAAGGTACTCTGAAGGTCGAGCGTGTACATGCCGATGTGAATATGGACGGTGCAAGTTCAAGGATCGAGGGCGTTTTTTCTATGGTTATTGTTGTCGACCGTAAACCCCATTTGAATCCTTCGGGGTGTTTACATACATTTGATGAGCTATTCGGTGCAAGGATCCACAGTCATGGTAATTTGGCAATCACTTCTTCACTGAAGGATCGCTTCTACATTCGACATGTATTCAAGCGTGTGATATCAGTCGAGAAGGATAGTCTTATGGTTGATCTAGAAGGGACGACGTACATGTCGAACAAGCGGATTAACTGTTGGGCATCGTTTAGGGATTTAGAGCGTGATTCATGTAACGGGGTTTACGCTAATATAAGCAAGAACGCCCTACTAATTTATTATTGCTGGATGTCCGATGCTATGTCTAAGGCATCGACTTTTGTATCATTTGATTTGGACTATATTGGATGAACAGGTTTATATTGAACGACATAATAAATTACATGTTATACATTACATGCTCAAAATCAACACTCAAATAAATAAATGTCCGACATTTATCCCAACGTCTTAGGATGTGAAGGGACACAGTTGGTGTTAATGCACTCTTGCACAGTCGATCTGACTAGCTCGTTCAACTGCGACATGGACATGGTTATATTGGACTGTGTCCTTTGGGCTCCCACTATTGAGGCCGACTCACCGGGGTCCAAGATAGGCGTCGATAACCGGTTGAGTTCTCGATAGGGATGCAACGCGTCTGTTGTGTCCGAGCCCGCATTTGTATGGCCCATTCCTATAGCACTTCTTGTGGCCCAGGATTCTCCTGGGTTTATTTCAATTGGGCTTGGAAGCCCATACCTGTGAGAGGATGCGGATCGGACCATTCTTCTCTCCCATTTCCCATACCCAACATGGTTGAAGTCTATGTCCTTATCGGTAAACTGTTTCGACAATATTTTGACTGTTGGCGCACGGAAAGGGATATCGACCGAGTGTTTAGCCGTTGACAGCTTCAGTTTACCCTTGAATTTAGCGAAATGGGTTCTCTGATGAACATTCGAGTCGCTAACTCTATAGTACAGCTTCCAAGGGATTGGGTCTTTGAGTGAGAAGAATGAAGATGAAAAGTAGTGGAGATCTATATTACATCTGATCGGAAAAGTCCACGATGCTTGTAAGGACTCATTGTCTGTCATACGTTTGTCATGGATCTCCACTATCACCGTACCAGACGCGTTGATCGGTACTTGTTGCCTATATTCTATCACACAATGGTCAATTTTCATGCAGCTACGACTCAACCGCGCACCTAATTGCGACGCCGTTGATGGGAATTGTAGGATAATCTCGGTTAGGTCATGGGAAAGCTGATATTCATCCCGGTGAGACTCTATGTAATTAAACGCATTTGGAGGTATAACCAATTGGGACTCCATCTATGGAAACTTGCCCGCGCAGCGGCACTGCTAAATCAATTTACAAGACGACGACAACTTACACCGACCGACGGGAATTTGATGAACAAGTAAATAAATAAGGATGATTTAGCTTATCGGAGTTTGCGAAAGGAAGAGAGCGATTAAGGGATAATGAAGAACAACCTAAGCGATAGTCAGATATATATAGGCAGTTCAACCTGGGAAGTGAAGTAATTAATTCGTAGTGGCATATTTGTAAATATGATGCAGGACTCCAGGGGAGCTCTCTCATAAAACCTATTGTTGCTGGAGTCCTGGAGTCCCATTTATACTAAAAGCCTCTAGGACTCCAAGGGACACGTGTTGCACATCGGCCATCCGCAATAATATT
Gene Information
|
NCBI Accession
|
YP_001249279.1
|
|
Location
|
198-947 |
|
Gene Name
|
cp |
|
Protein Name
|
coat protein |
|
Coding Region
|
ATGGTTAAGAGAGATGCCCCATGGCGATTAATGGCGGGGACCCCCAAGGTTTCGCGCTCTGTCAATTATTCCCCCCGTGGTGGTCCTAAATTAGACAAGGCCGCTGCGTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGAAAGCCCAGGATATATCGAACAGTGAGAGGGCCCGATGTTCCGAAGGGCTGTGAAGGCCCATGCAAAGTCCAGTCTTATGAGCAGCGGCACGACGTTTCCCATGTTGGTAAGGTGATGTGTATATCCGACGTGACTCGTGGTAACGGTATAACCCATCGTGTGGGGAAACGTTTTTGCGTCAAATCTGTGTACATATTAGGGAAGATTTGGATGGACGAAAACATCAAGCTGAAGAACCACACGAACAGTGTCATGTTCTGGTTGGTCCGAGACCGTAGACCGTATGGGACGCCTATGGATTTTGGGCAGGTGTTCAACATGTTCGACAACGAGCCTAGTACAGCTACTGTCAAGAACGATCTCCGCGATCGTTTTCAAGTCATGCACAAGTTCTATGCTAAGGTCACGGGTGGACAGTACGCCAGCAACGAGCAGGCATTGGTCAAGCGATTTTGGAAGGTCAACAACCATGTAGTGTACAACCATCAGGAAGCAGGGAAATACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCTTCTAATCCTGTATATGCGACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAA |
|
Protein Sequence
|
MVKRDAPWRLMAGTPKVSRSVNYSPRGGPKLDKAAAWVNRPMYRKPRIYRTVRGPDVPKGCEGPCKVQSYEQRHDVSHVGKVMCISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHKFYAKVTGGQYASNEQALVKRFWKVNNHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSITN |
|
NCBI Accession
|
YP_001249280.1
|
|
Location
|
944-1342 |
|
Gene Name
|
AC3 |
|
Protein Name
|
replication enhancer protein |
|
Coding Region
|
ATGGATTCACTCACAGGGGAGAACATCACTGCGTCTCAGGCAGAGAATTCCGTTTTTATTTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATGTGCCGAGTAGAGGACCCATTATACACAACGAGCAGGGTCTATCACATACAAATCCGGTTCAATTACAACATCAGGAAGGCGCTGAATCTACGCAAAGCATTCCTGAACTTCCAAGTTTGGACGACATCAGTTCGAGCTTCTGGGACGACTTATTTAAGTAGATTCAGGCATTTGGTCTTATTGTACTTAGATAGGTTAGGCGTAGTTGGTCTTAATAATGTAATTAGAGCTGTTCGTTATGCAACAGACAAATGCTATGTAACTGATGTACTCGAATCTCATGAAATAAAATTCAATTTTTATTAA |
|
Protein Sequence
|
MDSLTGENITASQAENSVFIWEVPNPLYFKMCRVEDPLYTTSRVYHIQIRFNYNIRKALNLRKAFLNFQVWTTSVRASGTTYLSRFRHLVLLYLDRLGVVGLNNVIRAVRYATDKCYVTDVLESHEIKFNFY |
|
NCBI Accession
|
YP_001249281.1
|
|
Location
|
1399-2469 |
|
Gene Name
|
AC1 |
|
Protein Name
|
replication initiator protein |
|
Coding Region
|
ATGCCACGGAACCCTAATTCCTTTCGTTTACAGGCTAAAAATATTTTCTTGACATATCCTCAATGCGATGTTCCCAAAGATGAATTTCTTCAGTTGCTTCACAACCTACCGTGGTCGATCGTTAAACCGTCGTACATCCGAGTCGCCAGAGAGGAACATCGCGATGGGTTCCCGCACTTACACTGCCTCATACAATTATCTGGCAAGTCCAACATCAAGGATGCTAGATTTTTCGACATTACTCACCCCAGACGGTCAGCCTGTTTTCACCCAAACATTCAGGCTGCCAAAGACACCAACGCCGTCAAGAATTACATCACCAAAGAGGGTGATTATTGTGAATCCGGGAAATATAAGGTGTTTGGGGGGTCAAAATCAAATAAAGACGACGTCTACCATAACGCCGTCAATGCAGGAAGTGCGGGAGAGGCTCTCGACATTATAAAAGCTGGCGATCCTAGAACGTTCATCGTCAGTTACCATAACGTAAAGGCTAACATCGATCGCCTCTTTCAAAAGCCTCCCGAACCTTGGGTTCCGCCGTTCAGACTCTCGTCGTTTGTTAACGTCCCGGTTGATTTGCAAGAGTGGGCTGATCATTATTTCGGGAGGGGTTCCGCTGCGCGGCCAGAGAGACCTATTAGTATTATCGTCGAAGGGGAATCACGAACGGGCAAGACAATGTGGGCTCGTGCTTTAGGCCCACATAACTACTTGAGCGGTCATTTAGATTTCAATTCTAGGGTTTACTCCAATCATGTGGAGTATAACGTCATTGATGATGTCGCACCGCACTACCTAAAGCTAAAGCACTGGAAAGAATTGATTGGGGCCCAAAAGGATTGGCAGTCCAACTGTAAATATGGAAAGCCGGTTCAAATTAAAGGTGGTATCCCATCAATCGTGCTGTGCAATCCAGGAGAGGGGGGCAGCTATAAAGATTTCCTCGACAAAGAGGAAAATGCTGCACTGAGAGCTTGGACATTAAAAAATGCTAAATTCGTCTTCCTCGACGCCCCCCTCTATAAAACCACAGCACAGGCTAGCCAAGAAGAGAGCTATTCGTCGTAG |
|
Protein Sequence
|
MPRNPNSFRLQAKNIFLTYPQCDVPKDEFLQLLHNLPWSIVKPSYIRVAREEHRDGFPHLHCLIQLSGKSNIKDARFFDITHPRRSACFHPNIQAAKDTNAVKNYITKEGDYCESGKYKVFGGSKSNKDDVYHNAVNAGSAGEALDIIKAGDPRTFIVSYHNVKANIDRLFQKPPEPWVPPFRLSSFVNVPVDLQEWADHYFGRGSAARPERPISIIVEGESRTGKTMWARALGPHNYLSGHLDFNSRVYSNHVEYNVIDDVAPHYLKLKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPVQIKGGIPSIVLCNPGEGGSYKDFLDKEENAALRAWTLKNAKFVFLDAPLYKTTAQASQEESYSS |
|
NCBI Accession
|
YP_001249282.1
|
|
Location
|
448-1218 |
|
Gene Name
|
BV1 |
|
Protein Name
|
nuclear-shuttle protein |
|
Coding Region
|
ATGTATTCTTCTAAAAACAGACGTGGTGGGTCTTCTAGGCAACGACGAAGTTATTCTCGATCAATATGGTTGAAGCGCCAATATGACATGCGACGTCCCGCTGTTACGCGTTTAACGAATAGTCATAACAAGACCGACGAGGATGCTAAGCTATCGACACAGCGGATTCACGAAGACCAGTTCGGTCCGGAGTTTGTACTTGCCCATAATACAGCCATTTCGACATACATTACTTACCCTAGTATTGTTAAGACCGAACCCAATCGGACCAGGTCTTATATCAAGTTAAAACGCCTACGTTATAAAGGTACTCTGAAGGTCGAGCGTGTACATGCCGATGTGAATATGGACGGTGCAAGTTCAAGGATCGAGGGCGTTTTTTCTATGGTTATTGTTGTCGACCGTAAACCCCATTTGAATCCTTCGGGGTGTTTACATACATTTGATGAGCTATTCGGTGCAAGGATCCACAGTCATGGTAATTTGGCAATCACTTCTTCACTGAAGGATCGCTTCTACATTCGACATGTATTCAAGCGTGTGATATCAGTCGAGAAGGATAGTCTTATGGTTGATCTAGAAGGGACGACGTACATGTCGAACAAGCGGATTAACTGTTGGGCATCGTTTAGGGATTTAGAGCGTGATTCATGTAACGGGGTTTACGCTAATATAAGCAAGAACGCCCTACTAATTTATTATTGCTGGATGTCCGATGCTATGTCTAAGGCATCGACTTTTGTATCATTTGATTTGGACTATATTGGATGA |
|
Protein Sequence
|
MYSSKNRRGGSSRQRRSYSRSIWLKRQYDMRRPAVTRLTNSHNKTDEDAKLSTQRIHEDQFGPEFVLAHNTAISTYITYPSIVKTEPNRTRSYIKLKRLRYKGTLKVERVHADVNMDGASSRIEGVFSMVIVVDRKPHLNPSGCLHTFDELFGARIHSHGNLAITSSLKDRFYIRHVFKRVISVEKDSLMVDLEGTTYMSNKRINCWASFRDLERDSCNGVYANISKNALLIYYCWMSDAMSKASTFVSFDLDYIG |
|
NCBI Accession
|
YP_001249283.1
|
|
Location
|
1305-2186 |
|
Gene Name
|
BC1 |
|
Protein Name
|
movement protein |
|
Coding Region
|
ATGGAGTCCCAATTGGTTATACCTCCAAATGCGTTTAATTACATAGAGTCTCACCGGGATGAATATCAGCTTTCCCATGACCTAACCGAGATTATCCTACAATTCCCATCAACGGCGTCGCAATTAGGTGCGCGGTTGAGTCGTAGCTGCATGAAAATTGACCATTGTGTGATAGAATATAGGCAACAAGTACCGATCAACGCGTCTGGTACGGTGATAGTGGAGATCCATGACAAACGTATGACAGACAATGAGTCCTTACAAGCATCGTGGACTTTTCCGATCAGATGTAATATAGATCTCCACTACTTTTCATCTTCATTCTTCTCACTCAAAGACCCAATCCCTTGGAAGCTGTACTATAGAGTTAGCGACTCGAATGTTCATCAGAGAACCCATTTCGCTAAATTCAAGGGTAAACTGAAGCTGTCAACGGCTAAACACTCGGTCGATATCCCTTTCCGTGCGCCAACAGTCAAAATATTGTCGAAACAGTTTACCGATAAGGACATAGACTTCAACCATGTTGGGTATGGGAAATGGGAGAGAAGAATGGTCCGATCCGCATCCTCTCACAGGTATGGGCTTCCAAGCCCAATTGAAATAAACCCAGGAGAATCCTGGGCCACAAGAAGTGCTATAGGAATGGGCCATACAAATGCGGGCTCGGACACAACAGACGCGTTGCATCCCTATCGAGAACTCAACCGGTTATCGACGCCTATCTTGGACCCCGGTGAGTCGGCCTCAATAGTGGGAGCCCAAAGGACACAGTCCAATATAACCATGTCCATGTCGCAGTTGAACGAGCTAGTCAGATCGACTGTGCAAGAGTGCATTAACACCAACTGTGTCCCTTCACATCCTAAGACGTTGGGATAA |
|
Protein Sequence
|
MESQLVIPPNAFNYIESHRDEYQLSHDLTEIILQFPSTASQLGARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINASGTVIVEIHDKRMTDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVSDSNVHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFRAPTVKILSKQFTDKDIDFNHVGYGKWERRMVRSASSHRYGLPSPIEINPGESWATRSAIGMGHTNAGSDTTDALHPYRELNRLSTPILDPGESASIVGAQRTQSNITMSMSQLNELVRSTVQECINTNCVPSHPKTLG |