Tomato bright yellow mosaic virus
Basic Information
Genomic Organization
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Genome
ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTCCCCCCCTTCTTTTATTTGAATTAAAGTTAACTTTGATTTGGACCAATGATATTGCGTCTGACGAGGTTAGATATTGTTGAACAACTTGGCGACCAAGTTTTAACGGCTATAAATAGAACGTACGACTGAGATTATCTTTAATTCAAATGTCTAAGCGAGGGGCCACATGGCGCTCTCTGGAGGGGATCTCAAAGGCCCGTCGTTCTATCAATTTTTCTCCTCGTGGAGGTAATGGGCCTAGGTCCAATAAGGCCGCTGAATGGGTTAACAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTATAGAACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGCCCATGTAAAGTCCAGTCGTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCCCATSTTGGTAAGGTGATATGTGTCTCGGACGTGACAAGGGGTAATGGTATTACCCACCGTGTAGGAAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTATATTTTAGGCAAGGTATGGATGGACGAGAATATTAAGTTGAAGAACCACACCAACAGTGTTATGTTCTGGCTGGTCAGAGACCGTAGACCGTATGGTACACCTATGGACTTTGGCCAAGTTTTTAACATGTTTGACAACGAGCCTAGTACCGCAACTGTTAAGAACGATCTTCGTGACCGTTACCAAGTTATGCACAAGTTTTATGCCAAGGTGACTGGTGGACAGTATGCAAGCAACGAGCAGGCTATTGTTAAGCGTTTTTGGAGGGTGAACATTCATGTGGTATACAACCATCAAGAGGCTGGGAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTATTATTGTATATGGCATGTACATATGCGTCGAATCCTGTGTATGCAACCTTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAATAAAGTTTGAATTTTATTTCATGATTCTCAAGTACATTGTGAATATAGTGTTTGTCCGTTGCGAAACGAACTGCTCTAATTACATTGTTAATTGAAATGACGCCTATATTGTCTAAATAAGCTAAAACTAACAATCTAAACCTATTTAAATATCTCGTCCCAGAAGCTGTAATCGATGTCGTCCAGATGTGGAAATTAAGGTAGGCCTTGTGGAGACCCAACGCTTTCCTGGTGTTGTGGTTGAACCGTATCTGGAGGTGATATATCCGGGTCGTTGTGTATGGTGGATCCTCCACGTCGATGATCTTGAAATAAAGGGGATTTGGAATTTCCCAGATATGTACGCCATTCTGTGCCTGAGGTGCAGTGATGTGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATATCCCGTGCATTAATGTGAAGATAAATTGAACAGCCGCACTCAAAGTCAATGCGTCGTCTTCGGATTGCTCGCCTTTTGGATACTTGAGCTTTTCTTTTAGCAGCTCTGTGTTGGACTTTGATAGAGGGGGGAGTTGATAAAGACGAATTTCGCTATGTGGAGCGTCCAATTTTTGAGAGCTGCGTTTTCCTCTTTGTCGAGGAAACATTTATAGCTGGATCCCTCTCCTGGATTGCAGAGCACGATTGAGGGGATCCCTCCTTTAATTTGAACTGGACGACCATATTTGCAATTGGATTGCCAGTCTTTTTGGGCCCCAATGAGTTCTTTCCAGTGTTTAATTTTAAAATATTTGGGGTCCACGTCGTCAATAATGTTGTACTGGGCCTCATTTGAATAGCATTTTGAATTAAAGTCGAGATGACCACTAAGATAATTGTGGACCCCCAAAGCACGTGCCCACATCGTCTTTCCCGTTCTGGAATCACCCTCAATGATAATACTGATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGAACTTCTTCCGAAATATTCATCTGCCCACTGTTGCATCTCCTGTGGAACGTTAGTGAATGAGGAGAGTTGAAACGGAGGAACCCATGGTTCTGGAGCCTTAACGAAGATCCGTTCAAAATTTGAGCGGATGTTATGATGTTGAACGACGAAATCTTTGGGTTGTTCCTCCCTAAATATATTGAGGGCCTCCATGACTGATCCTGCGTTGAGGACCTTGGCATACGTGTCGTTGGCAGACTGCTGACCTCCTCTAGCTGATCTGCCATCGATTTGGAACACTCCATGATCAATGAAATCTCCGTCTTTTTCCACGTATGTTTTAACATCTGAGCTGCTCTTAGCTGCCTGTATGTTAGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGAGATGTAAGGTCGAACAATCTCTGGTTGGTACATTGGAATTTCCCTTCGAATTGGATGAGGACATGCAGATGAGGTTGCCCATCTTCGTGTAATTCCCTGGCAACACGAACGAATAATTTATTGACTGGTATTGTAAAGGCAAATAGTTGGGAAAGTGCTTCTTCCTTCGATAGAGAGCACTTAGGATAAGTGAGGAAATAGTTTTTGGCATTTAAACGAAATCGTTTTGGGAGTGGCATATTTGTAAATAAGAGCTTGTACACCGATTGGGAGCTCTCAAAACTTGCTGAATGAATCGGTGTATTGGTGTACAATTTATACTAGAACCCCCAATAGAACTCCCATTGTGGTCCCCAACACGTGGCGGCCATCCGTTATAATATT
Gene Information
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NCBI Accession
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YP_009506513.1
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Location
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171-926 |
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Protein Name
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capsid protein |
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Coding Region
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ATGTCTAAGCGAGGGGCCACATGGCGCTCTCTGGAGGGGATCTCAAAGGCCCGTCGTTCTATCAATTTTTCTCCTCGTGGAGGTAATGGGCCTAGGTCCAATAAGGCCGCTGAATGGGTTAACAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTATAGAACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGCCCATGTAAAGTCCAGTCGTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCCCATSTTGGTAAGGTGATATGTGTCTCGGACGTGACAAGGGGTAATGGTATTACCCACCGTGTAGGAAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTGTATATTTTAGGCAAGGTATGGATGGACGAGAATATTAAGTTGAAGAACCACACCAACAGTGTTATGTTCTGGCTGGTCAGAGACCGTAGACCGTATGGTACACCTATGGACTTTGGCCAAGTTTTTAACATGTTTGACAACGAGCCTAGTACCGCAACTGTTAAGAACGATCTTCGTGACCGTTACCAAGTTATGCACAAGTTTTATGCCAAGGTGACTGGTGGACAGTATGCAAGCAACGAGCAGGCTATTGTTAAGCGTTTTTGGAGGGTGAACATTCATGTGGTATACAACCATCAAGAGGCTGGGAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCGTTATTATTGTATATGGCATGTACATATGCGTCGAATCCTGTGTATGCAACCTTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAA |
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Protein Sequence
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NCBI Accession
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YP_009506514.1
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Location
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923-1321 |
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Protein Name
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AL3 |
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Coding Region
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ATGGATTCACGCACAGGGGAACACATCACTGCACCTCAGGCACAGAATGGCGTACATATCTGGGAAATTCCAAATCCCCTTTATTTCAAGATCATCGACGTGGAGGATCCACCATACACAACGACCCGGATATATCACCTCCAGATACGGTTCAACCACAACACCAGGAAAGCGTTGGGTCTCCACAAGGCCTACCTTAATTTCCACATCTGGACGACATCGATTACAGCTTCTGGGACGAGATATTTAAATAGGTTTAGATTGTTAGTTTTAGCTTATTTAGACAATATAGGCGTCATTTCAATTAACAATGTAATTAGAGCAGTTCGTTTCGCAACGGACAAACACTATATTCACAATGTACTTGAGAATCATGAAATAAAATTCAAACTTTATTAA |
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Protein Sequence
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MDSRTGEHITAPQAQNGVHIWEIPNPLYFKIIDVEDPPYTTTRIYHLQIRFNHNTRKALGLHKAYLNFHIWTTSITASGTRYLNRFRLLVLAYLDNIGVISINNVIRAVRFATDKHYIHNVLENHEIKFKLY |
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NCBI Accession
|
YP_009506515.1
|
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Location
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1072-1530 |
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Protein Name
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AL2 |
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Coding Region
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ATGTTTCCTCGACAAAGAGGAAAACGCAGCTCTCAAAAATTGGACGCTCCACATAGCGAAATTCGTCTTTATCAACTCCCCCCTCTATCAAAGTCCAACACAGAGCTGCTAAAAGAAAAGCTCAAGTATCCAAAAGGCGAGCAATCCGAAGACGACGCATTGACTTTGAGTGCGGCTGTTCAATTTATCTTCACATTAATGCACGGGATATGGATTCACGCACAGGGGAACACATCACTGCACCTCAGGCACAGAATGGCGTACATATCTGGGAAATTCCAAATCCCCTTTATTTCAAGATCATCGACGTGGAGGATCCACCATACACAACGACCCGGATATATCACCTCCAGATACGGTTCAACCACAACACCAGGAAAGCGTTGGGTCTCCACAAGGCCTACCTTAATTTCCACATCTGGACGACATCGATTACAGCTTCTGGGACGAGATATTTAA |
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Protein Sequence
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MFPRQRGKRSSQKLDAPHSEIRLYQLPPLSKSNTELLKEKLKYPKGEQSEDDALTLSAAVQFIFTLMHGIWIHAQGNTSLHLRHRMAYISGKFQIPFISRSSTWRIHHTQRPGYITSRYGSTTTPGKRWVSTRPTLISTSGRHRLQLLGRDI |
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NCBI Accession
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YP_009506516.1
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Location
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1475-2446 |
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Protein Name
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AL1 |
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Coding Region
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ATGCCAAAAACTATTTCCTCACTTATCCTAAGTGCTCTCTATCGAAGGAAGAAGCACTTTCCCAACTATTTGCCTTTACAATACCAGTCAATAAATTATTCGTTCGTGTTGCCAGGGAATTACACGAAGATGGGCAACCTCATCTGCATGTCCTCATCCAATTCGAAGGGAAATTCCAATGTACCAACCAGAGATTGTTCGACCTTACATCTCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCTAACATACAGGCAGCTAAGAGCAGCTCAGATGTTAAAACATACGTGGAAAAAGACGGAGATTTCATTGATCATGGAGTGTTCCAAATCGATGGCAGATCAGCTAGAGGAGGTCAGCAGTCTGCCAACGACACGTATGCCAAGGTCCTCAACGCAGGATCAGTCATGGAGGCCCTCAATATATTTAGGGAGGAACAACCCAAAGATTTCGTCGTTCAACATCATAACATCCGCTCAAATTTTGAACGGATCTTCGTTAAGGCTCCAGAACCATGGGTTCCTCCGTTTCAACTCTCCTCATTCACTAACGTTCCACAGGAGATGCAACAGTGGGCAGATGAATATTTCGGAAGAAGTTCCGCTGCGCGGCCGGAGAGACCTATCAGTATTATCATTGAGGGTGATTCCAGAACGGGAAAGACGATGTGGGCACGTGCTTTGGGGGTCCACAATTATCTTAGTGGTCATCTCGACTTTAATTCAAAATGCTATTCAAATGAGGCCCAGTACAACATTATTGACGACGTGGACCCCAAATATTTTAAAATTAAACACTGGAAAGAACTCATTGGGGCCCAAAAAGACTGGCAATCCAATTGCAAATATGGTCGTCCAGTTCAAATTAAAGGAGGGATCCCCTCAATCGTGCTCTGCAATCCAGGAGAGGGATCCAGCTATAAATGTTTCCTCGACAAAGAGGAAAACGCAGCTCTCAAAAATTGGACGCTCCACATAG |
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Protein Sequence
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MPKTISSLILSALYRRKKHFPNYLPLQYQSINYSFVLPGNYTKMGNLICMSSSNSKGNSNVPTRDCSTLHLQPGQHISILTYRQLRAAQMLKHTWKKTEISLIMECSKSMADQLEEVSSLPTTRMPRSSTQDQSWRPSIYLGRNNPKISSFNIITSAQILNGSSLRLQNHGFLRFNSPHSLTFHRRCNSGQMNISEEVPLRGRRDLSVLSLRVIPERERRCGHVLWGSTIILVVISTLIQNAIQMRPSTTLLTTWTPNILKLNTGKNSLGPKKTGNPIANMVVQFKLKEGSPQSCSAIQERDPAINVSSTKRKTQLSKIGRST |