Solanum mosaic Bolivia virus

Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000921815.1
Isolate Bolivia
Release date 2015/2/22
Submitter Wyant,P.S., Gotthardt,D., Schafer,B., Krenz,B., Jeske,H.
Host
Vector
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Genomic Organization

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Genome

NC_024304
ACCGGATGGGCCGCGCGATCTTTTATACCGGGCCCCGCCTCCGTAAATTGCGCTCAATCACTTTAGAATTGGTCCCACTATATCTGACCAATCATGTTCTGTCCTGAAAGCTAAGATATTTTAAAATCCTTAGGCGCGAAGTATTTAAATTAATATAAATGGGCCATATCTTACGTGGCCTGACATGCTTTAATTCAAAATGCCTAAGCGTGATGCCCCATCACGTTTGATGGCGGGAACCTCAAAGGTTCGCCGTACTACCAATTATTCACCTCGTGGAGGCATGCCTAAGCGGGATGCTTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGGAAGCCTAGGATCTATCGTATGTGGAGAAGTCCAGATGTCCCTAGAGGTTGTGAAGGGCCTTGTAAGGTCCAGTCTTTCGAACAGCGTCATGACATTTCCCATGTTGGCAAGGTGATGTGTGTTTCGGATGTGACACGTGGTAATGGTATTACTCACCGTGTTGGTAAGCGTTTTTGTGTTAAGTCCGTGTACATTCTAGGTAAGATATGGATGGACGAGAATATCAAGTTGAAGAACCATACTAACAGCGTCATGTTCTGGTTGGTGAGAGATCGTAGACCGTATGGTACACCTATGGATTTTGGCCAGGTGTTCAACATGTTTGACAATGAGCCTAGTACTGCTACTGTGAAGAACGATCTTCGTGATCGTTACCAAGTTATGCATAAGTTTTATGCAAAAGTTACAGGTGGACAATATGCTAGCAATGAGCAGGCTCTCGTGAAGCGTTTCTGGAAGGTCAATAACTACGTGGTGTACAACCATCAAGAAGCTGGGAAATATGAAAATCATACTGAGAACGCCTTATTGTTGTATATGGCATGTACTCATGCTTCTAATCCCGTGTATGCTACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATCAGTAATTAATAAAGTTTGAATTTTATTGAATGATCTTCGAGTACATAATTTACATAAGATCTGTCTGTCGCGGAGCGAACAGCTCTAATTACATTGTTAATTGAAATAACACCTAATTGATCTAGATATAACAAAACTAAATATTTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTGTCAGAGAACTCGTCCAGACTTGGAAATTGAGAAATGCCTTGTGGAGATCCAACGCTTTCCTCGCGTTGTGGTTGAACCGAATCTGGATGTGGTAAATCCTGGTGTTGGTGTATGGTGGATCCTCCACGTTGGTTATCTTGAAATAAAGGGGATTTGATATTTCCCAAATATATACGCCATTCTCTGCTTGAGGCACAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTGCTGCAGTTGATATGGACGTAAATGGAGCAGCCGCAGTTCAAGTCAATGCGTCTGCGTCTAATTGGTCGCCGTTTGGCTGCTCTGTGCTGTGCTTTGATAGAGAGGGGAGTTGAGGAAGATGAATTTAGCATTATGAAGTGTCCACGCTCTTAGAGATGCATTTTCCTCTTTGTCTAGGAAGACTTTATAACTAGCCCCCTCTCCTGGATTGCACAGCACAATTGATGGGATGCCTCCTTTAATTTGAACTGGCTTTCCGTATTTGCAGTTGGATTGCCAGTCCTTTTGGGCCCCAATTAACTCTTTCCAGTGTTTCATCTTTAGATAATGCGGGCTGACATCATCTATGACATTATATTCAGCTTTATTTGAATAAACTCTGGAATTAAAATCAAGATGTCCGCTCAAATAATTATGTGGGCCTAATGCTCGAGCCCACATCGTCTTCCCCGTTCGACTATCACCTTCAATGATAATACTAATAGGTCTCTCTGGCCGCGCAGCGGAATCCTTTCCAAAATAATCATCAGCCCATTCCTGCATCTCGTCAGGCACGTTAGTGAAAGATGAGAGTCGAAAAGGAGATACCCATGGTTCTGGAGGCTTCTCAAATATTTTTTGAACATGTGCTCTAATTTTATCTAATTGAAGAACATAATCCCGGGGTTGTTCTTCTCTAAGTATTTTAAGTGCCGTGGTAATGCTATCTGCGTTTAGAACCTTCGCATAAGTATCGTTGGCAGATTGACAACCTCCTCTAGCTGATCTTCCATCTATTTGGAAAGTTCCAAAATCAACGAAGTCTCCGTCTTTCTCCATATAGGTCTTGACGTCTGACGAACTCTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTTGTTGGGGATACCAAGTCGAAGAATCGTTGATTTGTGCAGATGTATTTTCCTTCGAATTGGATAAGCACATGGAGATGAGGCTCCCCATTTTCGTGTAGCTCTCTACAAACCCTAATGAATTTCTTGTTGATATTACAATTTAAGGCTTGTAATTGTGAAAGAGCCTCTTCTTTAGATAGTGAACAATGAGGGTATGTAAGGAAATAATTTTTAGACTGAACTCTAAAACGTTTAGGCGGTGGCATATTTGTAAATAAGAGGTGTCTCCAATTGGGAGCTCTCAAACTTGGTGAAATGAATTGGAGACTGGAGTACAATATATAGTAGAGTCTCTTAAAGGTTTTTTGCACACGTGGCGGCCATCCGTTATAATATT
NC_024305
ACCGGATGGCCGCGTTGCCCCTCTTTTGCTCAGATTGTGACGCGTGTCCCTTATCTTTTCGCATTTTAATTAAGCGCATTTTTGAAATCCGCGAATTGAGTTCACCGCATTTATTTCAAGTCCGCGCGTGAAGTCACGACAAATAACTTTAATTTGAATAAAAGCGGAGCTTTTTTCCAGCCAATCAATTCGCGTCTGACGAGCCTATTTAATTTGTAGATTTTTACTGTTCAAAATGTTGACCGAACGGACGTGAGATATAATTTGTAAGTTGAATTATTTGGGCTCGTCATATGACATTATTTTGACGTGGACCAATAATATTTCGCTGTGGAAGCTAAATAACTAGTTTATGAAACCAGGAATTTTATATATAAATTCCGTATTGATTAATGTCAAAATTATATTGCAATATGTTTCCTACTAAATATAGACGTGGGATTTCATTTAATCCACGACGAAGTTATGGACGCACTTATTTGTTTAAGCGTTCTAATTATATTAAACGCACGGATGGGAAACGTCGATTAAGTAATTCTAATCAGGCTACTGATGATGGGAAGCTGTCACAACAACGTATTCATGAAAACCAGTTTGGGCCAGAATTTGTTATGGGTCATAATACAGCCATTTCAACATTTATCACCTTTCCTAAGCTGGGTAAGAATCAGCCCAATCGATCCAGGTCATATATTAAGTTGCAACGACTACGTTTCAAAGGCACCGTGAAGATTGAACGTGTTAATACGGACGTGAACATGGTCGGTGCACCTCCAAAGATTGAAGGCGTATTCTCAGTGGTTGTCGTGGTTGATCGTAAACCACATTTAAGTCCAACGGGATGTCTCCACACATTTGACGAAGTATTCGGTGCACGTATAAACAGCCATGGCAATTTAGATATAACTCCTTCGTTGAAAGATCGTTTTTACATACGTCACGTGCTGAAACGTGTGATATCTGTCGAGAAGGATACCACGATGATCGACCTCGAAGGAAGGACAACGTTGTCTAACAGGCGTTTTAATTGTTGGTCTTCGTTTAGGGATCTAGATCATGACTCATGTAACGGCGTATATGCTAATATAAGCAAGAACGCCTTGTTAGTTTATTATTGTTGGATGTCGGATATCATATCTAAGGCATCGACATTTGTATCTTTTGATCTTGACTATGTTGGTTAAATAACAAGAGTATATTGTTTAATTGCATTACATGCGAGTAAGCATAACAAGAATTATATATAAGAAACTGGTAATTTAAGCAATAAGAAATACAGTTAAGAAAGCATGGCTACGCATCTTAATACAAAGTAAAGTAAAGACATTTTATTTATTTCAAAGATTTGGGTTGTGTAGGAATACAGTTCGTATTAATACATTCTTGGACTGTTGTCCTTACAATGTCGTTTAATTGGGCCATTGACATTGTTATGTTGGACTGTGTCCGTTGGGCCCCAATTATTGAAGCAGATTCACCCGGGTCCAACATTGTTGAGCCCAATCTGTTAAGCTCTCTATATGGATGGGCTCCATCATCTATTTCGGAATCTGCATATGGGCCTATGGTACTTCTTGTAGCCCATGATTCTCCTGGTTTGAGTTCTATTGGGCCGGGAAGCCCAAATCTGGAAGTGGATGCGGATCTTACTAATTTCCTCTCCCACTTCCCATAACTTACATGGGAGAAATCTATATCCTTGTCCGTAAATTGTTTGGACAGGATTTTAACTGTGGGAGCTTTGAAGGGGATGTCCACTGAGTGTTTAGCCGTTGATAGTTTCAGTTTCCCTTTGAATTTGGCGAAGTGAGTCCTCTGATGAACATTGGAGTCGCAAACTCTGTAATACAGCTTCCATGGAATTGGGTCTTTGAGGGAGAAGAATGAAGAAGAAAAATAGTGGAGATCTATGTTACATCTAATTGGAAAAGTCCAGGTTGCCTGTAAGGATTCATTGTCAGTCATCCTCTTGTCATGAATCTCCACTATCACAGTCCCAGATGCGTTGATTGGGACTTGTTGCCTGTATTCTATGACGCAATGGTCGATCTTCATACAGCTACGACTGAGTCTTGCACTTAATTGAGATGCCGTTGAAGGAAATTGTAAGATGATCTCGGTTAGGTCATGAGATAGTTGATATTCATCTCGATGAGACTCAATATAATTAAAGGCGTTTGGAGGATGAGCTAGTTGAGAATCCATATAAGAAAATATGGCTGCGCAGCTGAATACAAAGTAAATTACAGACAAGGCGTCTATTTAAAGAAGAGAGAAATTGAGATATAACAGCTGAATATTGTGAATACAAGACGTCTATTTATAGAAGGGAGAAATTGAGATATAGGAAATTATTATTAAGAGTAACAGTATGTGTGGATTAAATAAGCGTCTAGAGTGGTTAATTGTAATTATTAGCCTTTATTCTAAAATAAATAAATGTGCTACAGGGATAATGGCATAATTGTAAATAAGGGAGTGTCTCCAATCGGGAGCTCTCAAACTTGGTGAAATGAATTGGAGACTGGAGTACAATATATAGTAGAGTCCATAATGGGTTTTATGCACACGTGGCGGCCATCCGTTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_009042055.1
Location 200-943
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGCCTAAGCGTGATGCCCCATCACGTTTGATGGCGGGAACCTCAAAGGTTCGCCGTACTACCAATTATTCACCTCGTGGAGGCATGCCTAAGCGGGATGCTTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGGAAGCCTAGGATCTATCGTATGTGGAGAAGTCCAGATGTCCCTAGAGGTTGTGAAGGGCCTTGTAAGGTCCAGTCTTTCGAACAGCGTCATGACATTTCCCATGTTGGCAAGGTGATGTGTGTTTCGGATGTGACACGTGGTAATGGTATTACTCACCGTGTTGGTAAGCGTTTTTGTGTTAAGTCCGTGTACATTCTAGGTAAGATATGGATGGACGAGAATATCAAGTTGAAGAACCATACTAACAGCGTCATGTTCTGGTTGGTGAGAGATCGTAGACCGTATGGTACACCTATGGATTTTGGCCAGGTGTTCAACATGTTTGACAATGAGCCTAGTACTGCTACTGTGAAGAACGATCTTCGTGATCGTTACCAAGTTATGCATAAGTTTTATGCAAAAGTTACAGGTGGACAATATGCTAGCAATGAGCAGGCTCTCGTGAAGCGTTTCTGGAAGGTCAATAACTACGTGGTGTACAACCATCAAGAAGCTGGGAAATATGAAAATCATACTGAGAACGCCTTATTGTTGTATATGGCATGTACTCATGCTTCTAATCCCGTGTATGCTACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATCAGTAATTAA
Protein Sequence MPKRDAPSRLMAGTSKVRRTTNYSPRGGMPKRDAWVNRPMYRKPRIYRMWRSPDVPRGCEGPCKVQSFEQRHDISHVGKVMCVSDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVMHKFYAKVTGGQYASNEQALVKRFWKVNNYVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSISN

NCBI Accession YP_009042056.1
Location 940-1338
Gene Name AC3
Protein Name replication enhancer
Coding Region ATGGATTCACGCACAGGGGAACTCATCACTGTGCCTCAAGCAGAGAATGGCGTATATATTTGGGAAATATCAAATCCCCTTTATTTCAAGATAACCAACGTGGAGGATCCACCATACACCAACACCAGGATTTACCACATCCAGATTCGGTTCAACCACAACGCGAGGAAAGCGTTGGATCTCCACAAGGCATTTCTCAATTTCCAAGTCTGGACGAGTTCTCTGACAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAGATTTAAATATTTAGTTTTGTTATATCTAGATCAATTAGGTGTTATTTCAATTAACAATGTAATTAGAGCTGTTCGCTCCGCGACAGACAGATCTTATGTAAATTATGTACTCGAAGATCATTCAATAAAATTCAAACTTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGELITVPQAENGVYIWEISNPLYFKITNVEDPPYTNTRIYHIQIRFNHNARKALDLHKAFLNFQVWTSSLTASGTTYLNRFKYLVLLYLDQLGVISINNVIRAVRSATDRSYVNYVLEDHSIKFKLY

NCBI Accession YP_009042057.1
Location 1085-1474
Gene Name AC2
Protein Name transcriptional regulator
Coding Region ATGCTAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCTCTCTATCAAAGCACAGCACAGAGCAGCCAAACGGCGACCAATTAGACGCAGACGCATTGACTTGAACTGCGGCTGCTCCATTTACGTCCATATCAACTGCAGCAACCATGGATTCACGCACAGGGGAACTCATCACTGTGCCTCAAGCAGAGAATGGCGTATATATTTGGGAAATATCAAATCCCCTTTATTTCAAGATAACCAACGTGGAGGATCCACCATACACCAACACCAGGATTTACCACATCCAGATTCGGTTCAACCACAACGCGAGGAAAGCGTTGGATCTCCACAAGGCATTTCTCAATTTCCAAGTCTGGACGAGTTCTCTGACAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAG
Protein Sequence MLNSSSSTPLSIKAQHRAAKRRPIRRRRIDLNCGCSIYVHINCSNHGFTHRGTHHCASSREWRIYLGNIKSPLFQDNQRGGSTIHQHQDLPHPDSVQPQREESVGSPQGISQFPSLDEFSDSFWDDIFK

NCBI Accession YP_009042058.1
Location 1401-2471
Gene Name AC1
Protein Name replication-associated protein
Coding Region ATGCCACCGCCTAAACGTTTTAGAGTTCAGTCTAAAAATTATTTCCTTACATACCCTCATTGTTCACTATCTAAAGAAGAGGCTCTTTCACAATTACAAGCCTTAAATTGTAATATCAACAAGAAATTCATTAGGGTTTGTAGAGAGCTACACGAAAATGGGGAGCCTCATCTCCATGTGCTTATCCAATTCGAAGGAAAATACATCTGCACAAATCAACGATTCTTCGACTTGGTATCCCCAACAAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAGAGTTCGTCAGACGTCAAGACCTATATGGAGAAAGACGGAGACTTCGTTGATTTTGGAACTTTCCAAATAGATGGAAGATCAGCTAGAGGAGGTTGTCAATCTGCCAACGATACTTATGCGAAGGTTCTAAACGCAGATAGCATTACCACGGCACTTAAAATACTTAGAGAAGAACAACCCCGGGATTATGTTCTTCAATTAGATAAAATTAGAGCACATGTTCAAAAAATATTTGAGAAGCCTCCAGAACCATGGGTATCTCCTTTTCGACTCTCATCTTTCACTAACGTGCCTGACGAGATGCAGGAATGGGCTGATGATTATTTTGGAAAGGATTCCGCTGCGCGGCCAGAGAGACCTATTAGTATTATCATTGAAGGTGATAGTCGAACGGGGAAGACGATGTGGGCTCGAGCATTAGGCCCACATAATTATTTGAGCGGACATCTTGATTTTAATTCCAGAGTTTATTCAAATAAAGCTGAATATAATGTCATAGATGATGTCAGCCCGCATTATCTAAAGATGAAACACTGGAAAGAGTTAATTGGGGCCCAAAAGGACTGGCAATCCAACTGCAAATACGGAAAGCCAGTTCAAATTAAAGGAGGCATCCCATCAATTGTGCTGTGCAATCCAGGAGAGGGGGCTAGTTATAAAGTCTTCCTAGACAAAGAGGAAAATGCATCTCTAAGAGCGTGGACACTTCATAATGCTAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCTCTCTATCAAAGCACAGCACAGAGCAGCCAAACGGCGACCAATTAG
Protein Sequence MPPPKRFRVQSKNYFLTYPHCSLSKEEALSQLQALNCNINKKFIRVCRELHENGEPHLHVLIQFEGKYICTNQRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKTYMEKDGDFVDFGTFQIDGRSARGGCQSANDTYAKVLNADSITTALKILREEQPRDYVLQLDKIRAHVQKIFEKPPEPWVSPFRLSSFTNVPDEMQEWADDYFGKDSAARPERPISIIIEGDSRTGKTMWARALGPHNYLSGHLDFNSRVYSNKAEYNVIDDVSPHYLKMKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPVQIKGGIPSIVLCNPGEGASYKVFLDKEENASLRAWTLHNAKFIFLNSPLYQSTAQSSQTATN

NCBI Accession YP_009042059.1
Location 2117-2314
Gene Name AC4
Protein Name AC4 protein
Coding Region ATGGGGAGCCTCATCTCCATGTGCTTATCCAATTCGAAGGAAAATACATCTGCACAAATCAACGATTCTTCGACTTGGTATCCCCAACAAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAGAGTTCGTCAGACGTCAAGACCTATATGGAGAAAGACGGAGACTTCGTTGATTTTGGAACTTTCCAAATAG
Protein Sequence MGSLISMCLSNSKENTSAQINDSSTWYPQQGQHISIRTFRELRVRQTSRPIWRKTETSLILELSK

NCBI Accession YP_009042060.1
Location 393-1184
Gene Name BV1
Protein Name nuclear shuttle protein
Coding Region ATGTCAAAATTATATTGCAATATGTTTCCTACTAAATATAGACGTGGGATTTCATTTAATCCACGACGAAGTTATGGACGCACTTATTTGTTTAAGCGTTCTAATTATATTAAACGCACGGATGGGAAACGTCGATTAAGTAATTCTAATCAGGCTACTGATGATGGGAAGCTGTCACAACAACGTATTCATGAAAACCAGTTTGGGCCAGAATTTGTTATGGGTCATAATACAGCCATTTCAACATTTATCACCTTTCCTAAGCTGGGTAAGAATCAGCCCAATCGATCCAGGTCATATATTAAGTTGCAACGACTACGTTTCAAAGGCACCGTGAAGATTGAACGTGTTAATACGGACGTGAACATGGTCGGTGCACCTCCAAAGATTGAAGGCGTATTCTCAGTGGTTGTCGTGGTTGATCGTAAACCACATTTAAGTCCAACGGGATGTCTCCACACATTTGACGAAGTATTCGGTGCACGTATAAACAGCCATGGCAATTTAGATATAACTCCTTCGTTGAAAGATCGTTTTTACATACGTCACGTGCTGAAACGTGTGATATCTGTCGAGAAGGATACCACGATGATCGACCTCGAAGGAAGGACAACGTTGTCTAACAGGCGTTTTAATTGTTGGTCTTCGTTTAGGGATCTAGATCATGACTCATGTAACGGCGTATATGCTAATATAAGCAAGAACGCCTTGTTAGTTTATTATTGTTGGATGTCGGATATCATATCTAAGGCATCGACATTTGTATCTTTTGATCTTGACTATGTTGGTTAA
Protein Sequence MSKLYCNMFPTKYRRGISFNPRRSYGRTYLFKRSNYIKRTDGKRRLSNSNQATDDGKLSQQRIHENQFGPEFVMGHNTAISTFITFPKLGKNQPNRSRSYIKLQRLRFKGTVKIERVNTDVNMVGAPPKIEGVFSVVVVVDRKPHLSPTGCLHTFDEVFGARINSHGNLDITPSLKDRFYIRHVLKRVISVEKDTTMIDLEGRTTLSNRRFNCWSSFRDLDHDSCNGVYANISKNALLVYYCWMSDIISKASTFVSFDLDYVG

NCBI Accession YP_009042061.1
Location 1333-2205
Gene Name BC1
Protein Name movement protein
Coding Region ATGGATTCTCAACTAGCTCATCCTCCAAACGCCTTTAATTATATTGAGTCTCATCGAGATGAATATCAACTATCTCATGACCTAACCGAGATCATCTTACAATTTCCTTCAACGGCATCTCAATTAAGTGCAAGACTCAGTCGTAGCTGTATGAAGATCGACCATTGCGTCATAGAATACAGGCAACAAGTCCCAATCAACGCATCTGGGACTGTGATAGTGGAGATTCATGACAAGAGGATGACTGACAATGAATCCTTACAGGCAACCTGGACTTTTCCAATTAGATGTAACATAGATCTCCACTATTTTTCTTCTTCATTCTTCTCCCTCAAAGACCCAATTCCATGGAAGCTGTATTACAGAGTTTGCGACTCCAATGTTCATCAGAGGACTCACTTCGCCAAATTCAAAGGGAAACTGAAACTATCAACGGCTAAACACTCAGTGGACATCCCCTTCAAAGCTCCCACAGTTAAAATCCTGTCCAAACAATTTACGGACAAGGATATAGATTTCTCCCATGTAAGTTATGGGAAGTGGGAGAGGAAATTAGTAAGATCCGCATCCACTTCCAGATTTGGGCTTCCCGGCCCAATAGAACTCAAACCAGGAGAATCATGGGCTACAAGAAGTACCATAGGCCCATATGCAGATTCCGAAATAGATGATGGAGCCCATCCATATAGAGAGCTTAACAGATTGGGCTCAACAATGTTGGACCCGGGTGAATCTGCTTCAATAATTGGGGCCCAACGGACACAGTCCAACATAACAATGTCAATGGCCCAATTAAACGACATTGTAAGGACAACAGTCCAAGAATGTATTAATACGAACTGTATTCCTACACAACCCAAATCTTTGAAATAA
Protein Sequence MDSQLAHPPNAFNYIESHRDEYQLSHDLTEIILQFPSTASQLSARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINASGTVIVEIHDKRMTDNESLQATWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVCDSNVHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFKAPTVKILSKQFTDKDIDFSHVSYGKWERKLVRSASTSRFGLPGPIELKPGESWATRSTIGPYADSEIDDGAHPYRELNRLGSTMLDPGESASIIGAQRTQSNITMSMAQLNDIVRTTVQECINTNCIPTQPKSLK

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