Bean golden yellow mosaic virus
Basic Information
| Genus |
Begomovirus
|
| NCBI Assembly |
GCF_002867405.1 |
| Release date |
2015/2/12 |
| Submitter |
Morinaga,T., Ikegami,M., Shimotohno,K., Miura,K. |
| Download |
Genome
|GFF3
|PEP
|CDS |
Genomic Organization
JBrowse
Genome
GTGATGGCAGTTTTGTAATAAGAAGGTGTCTCCATTCGAGTTCTTGAGTGTCTCCATTTGATCCCCCTCAAAACTCGCTCATGCAATTGGAGACTGGAGTACAATATATACTAGAACCCTCAATCTCGTGAATTACGAGATTCACACACGTGGCGGCCATCCGATATAATATTACCGGATGGCCGCGCGCTCCCTCTTATATCCGTACGCCGCATTTCGATACCAGAAATGCCCTTCCCACGCTTTATACACGGTATTCTATACCGTTGGATAAAGCCTATCGCACTCTATCTTTTGAATTTTGAATTATTGGCTTTGCCCTTGTGTCTAGTTATTTATGGATATGTCTGACACATCTCTGATATTGTACGACTCGACCAATCAAAATTCAAAATAGAAGTTTAGTTAAATCGTGTGTTAATATGTGATTCATATAAATAAGCATGTTTGATAAAGAAAAAACGTACCGTTTTTAATGACTATGATTTTATGTTAGCCACACGATTTAATTATGTATACGTCTAAGTATAAACGTGGTTCGTCTAACTATCAACGACGAGGTTATTCACGTAGCCAAGGTTTTCGACGAACGTCAATTGTTAAACGACATGATGGTAAGCGTCGACAACATCAATCCAGTAAGTCTAATGAAGATCCTAAATTGTTGGTGCAATGTATACGTGAAAATCAATTTGGTCCTGATTTTGTTATGGCTCATAATACTGCCATATCCACGTTTATTAATTATCCCCAATTGGGTAAGATCGAACCTAATCGATGTAGGTCGTATATGAAGTTGAAACGCTTGCGTTTCAAAGGGACGGTTAAAATTGAACGTGTACACTCTGATGTGAACATGGATGGATTATCTCCTAAGATTGAAGGCGTATTTAGTATTGTTATTGTGGTTGATCGGAAACCACATTTAAATCCCAGTGGATGTCTTCATACATTTGATGAACTATTTGGAGCAAGGATTCATAGCCATGGGAATCTTGCTGTGATGCCTTCTTTGAAAGACCGATTTTACATACGACACGTGTTGAAGCGTGTTTTATCGGTAGATAAAGACACGACTATGATAGACGTTGAGGGTTCCACTTTGTTGTCTAATAAGCGTTATAATATGTGGTCTACGTTTAATGATTTTGATCATGACTCATGTAATGGTGCATATGCTAATATTGCTAAGAACGCTTTATTAGTGTATTATTGTTGGATGTCGGATATTATGTCTAAGGCATCGACATTTGTGTCATTTGATCTTGATTATGTTGGATAAACGTCAATGTATAAGATAAATAAATATGTTTATTTATTTCAAAGATTTTGGTTGAGAAGGAGTACAATTGTTGTTGATACATTCATGTACCGTTGATCGCACAATTTCGTTTAATTGTGCAATTGACAATGTTATGTTTGATTGGGCTCTCTGAGCCCCAATAATTGACGCTGAATCTCCCGGGTCCAAAACACTGGTTCCCAGTCTGTTTAAATCCTTGTATGGGTGTATCGCGCTCTCTAAGTCCGAGTCCGCATCTACATGAGACATACCGATTGTACTTCTTGAGGCCCAAGACTCTCCTGGTTTTAATTCGATTGGGCCTTGTAGACCATACCTTGATAATGATGCGGACCGGATCAATTTCCTTTCCCACCTCCCATAGTCGACGTGGGAGAAGTCGACGTCCTTATTGGAAAACTGCTTTGATAATATTTTAACTGTTGGTGCCCGGAAGGGGATATCTACTGAATGTTTAGCCGTTGATAATTTCAGTTTTCCTTTGAATTTTGCGAAATGTGTCCTTTGATGAACGTTGGTGTCTGAAACTCTATAATAGAGTTTCCATGGTATTGGGTCTTTCAACGAGAAAAATGACGATGAAAAGTAGTGGAGATCTATGTTGCATCTAATGGGAAATGTCCATGAAGCTTGTAATGATTCGTTGTCTGTCATCCTCTTGTCATGAATCTCCACTACAACTGATCCTGTTGCGTTAATAGGCACCTGTTGCCTATATTCTATGACGCAATGATCGATCTTCATACAGCTGCGACTGAATCTCGCAGATAATTGAGAAGCTGTGGAAGGAAATTGAAGGATTATCTCAGTTAGATCATGAGACAATTGATATTCGTCTCTGTGTGACTCTACATAATTAAATGCATTTGGAGGATTTGCTAACTGAGAATCCATTTAAGAAGAAATGGCCGCGCAGCTGAAGCGCAAAGATAGAGAAGCTCGACTCTAACTAGCGGAATGCTAAGAGAGAGAAACTCATTTGGTGACACTCGCATACAACTGATAAACTGAACAACCAAGAGATTATGAAATAGTTTATATTGATATAGACAAGCATTGTGTATGCTTATATAGGCAGTTGTATGCCTTTATATCGCCTTTTGAAAAAGAACATATTATTTAGTTAATATGTTAATGTGTTTTATTTGAACATGATATATATATCGGATATATATATTTGAAGAATTTAATATATTTATGGTATATTAAATGTTATATGACAGTTGAATGTTAATATCAAATTATTAATTTGGTTTATGAATTATTTGATGATTAATAAGCAAAACGATATCGTTTTGAGTCTAT
GTGATGGCATATTTGTAAATATGCGAGTGTCTTCCGAATGGGTTTGCGAGTGTCTCCAATTGAGGCTCCTCAAACTCTCGCATTCAATTGGAGACTGGAGTACAATATATACTAGAACCCTCAATCTCGTGAATTACGAGATTCACACACGTGGCGGCCATCCGATATAATATTACCGGATGGCCGCGCGCCCCCCTTTATTTCCGTACTTCTCCACGTGGCGCTTTAATTTAAATTAAAGATGTCTATTTTTGACTGACCAATGCTTTTGCATGTGAGGAGCTTAGTTATTTGTGTAAAACTTGGCGACTAAGTTTTACCCTCGTTTATAAATTTAAATTAAATGCATGCCCATTCCACGTGTAAGTCCAGAATGCCTAAGCGTGATGCGCCTTGGCGTAATAATGCGGGAACCTACAAGGTTTCCCGTTCTGGCAATTATTCTCCAGGCGGTGGAATGGGCTCAAAATCCAACAAGGCCAATGCATGGGTTAACAGGCCCATGTATAGAAAGCCAAGGATATATCGGATGTACAGAAGCCCAGACGTGCCCAAGGGATGTGAAGGACCTTGCAAGGTCCAATCATATGAACAACGCCATGATATATCTCATGTTGGTAAGGTTATGTGTATATCCGATATCACACGTGGGAATGGTATTACCCACCGTGTTGGTAAACGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTACATTTTAGGGAAGATATGGATGGATGAAAATATCAAGCTTAAGAACCATACTAATAGTGTTATATTTTGGTTGGTCCGTGACCGTAGACCATATGGAACCCCTATGGATTTTGGTCAAGTTTTTAATATGTTTGACAATGAACCCAGTACTGCTACGGTCAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAAGTTATGCATAGGTTCAATGCAAAGGTGACTGGTGGTCAATATGCAAGCAACGAGCAAGCCTTGGTAAGGCGATTTTGGAAGGTGAACAACCATGTCGTCTATAACCACCAGGAAGCAGGAAAATACGAGAATCATACGGAGAATGCGTTATTGTTATATATGGCATGTACACATGCCTCTAATCCTGTATATGCGACATTGAAAATTCGGATCTATTTCTATGATTCGATAACCAATTAATAAAATTTATATTTTATTTCATGATTCTCAAGTACAGTATTTACATATGATTTGTCTGTTGCGAACTGAACAGCTCGATTGACATTGTTTAATCCTATTACGCCTAACCTATGTAAATACAATAAAACCAAATGTCTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTTGAATCGATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGAATGCTTTGTGGAGATCCAGTGCTTTCCTGAGGTTGTGATTGAACCTGACTTGGATGTGGTATATCCTTGTCCGTGTGTATGCTGGATCTTCCACCCGCATGATCTTGAAATAAAGGGGATTTGGTACCTCCCAAATAAAAACGGAATTCTCTGCCTGATGCGCAGTGATGTTCTCCCCTGTGCGTGAATCCATGATCTGCGCACTTGATATGGTAAAATATGGAACAGCCGCAGTTCAGGTCAATGCGTCGTCGACGAATGGCTTTACGTTTGGCAATCCTGTGCTGTGCTTTGATAGAGGGGGGCTGTGAGGGTGACGAAGATCGCATTATGAATAGTCCAGTTGTGTAAAGCTCGGTTTTCTTCTTTGTCGAGGAAGTCTTTATAACTGGAACCCTCACCTGGATTGCACAGCACGATTGATGGTATTCCTCCTTTAATTTGAACCGGCTTTCCATATTTACAGTTTGATTGCCAGTCCTTTTGTGCCCCAATTAGTTCTTTCCAGTGCTTTAACTTCAAATAATTGGGGCTTATGTCATCAATGACGTTGTATTCCACCTCGTTGGAATAGACACGTGAATTAAAGTCCAAGTGACCGCTCAAATAATTATGTGGTCCTAATGCACGAGCCCACATTGTTTTTCCTGTTCGTGAATCACCTTCGACGATGATACTAATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGAACCCCTTCCGAAATAGTCGTCAACCCATTCTTGCATAACAACCGGAACATTGATGAATGATGACAACGGAAATGGAGGAACCCATGGTTCCGGCACTTTGAAGAAGATCCGTTCGAGATTAGAACGGATGTTGTGATTTTGAAGGACGTAATCTTTCGGTTGTTCTTCCTTTAATATCGTCAAGGCAGATTCAATTGAATCTGCGTTTAATGCCTTTGCATATGAGTCGTTGGCAGTCTGCTGACCCCCTCTTGCAGATCTGCCGTCGACTTGAAATTGTCCCCATTCGATTGTGTCTCCATCTTTGTCGATGTATGCTTTGACGTCTGAACTTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGAGGATACCAGGTCGAACAATCTTTTATTTGTGCAGACGAATTTACCTTCGAACTGAATAAGCGCATGAAGATGGGGTTCACCATTCTCGTGACGTTCCTCACAGACTTTGATGAATTTTTTATTCGTCGCTGTATGAATCTTCTGAAGTTGCGAAAGAGCTTCTTCTTTCGGTATAGAGCAATGAGGATAAGTGAGGAAATAGTTTTTGGACTGAACTCTAAATCTATGAG
Gene Information
|
NCBI Accession
|
YP_009507973.1
|
|
Location
|
512-1282 |
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Gene Name
|
BR1 |
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Protein Name
|
BR1 protein |
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Coding Region
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ATGTATACGTCTAAGTATAAACGTGGTTCGTCTAACTATCAACGACGAGGTTATTCACGTAGCCAAGGTTTTCGACGAACGTCAATTGTTAAACGACATGATGGTAAGCGTCGACAACATCAATCCAGTAAGTCTAATGAAGATCCTAAATTGTTGGTGCAATGTATACGTGAAAATCAATTTGGTCCTGATTTTGTTATGGCTCATAATACTGCCATATCCACGTTTATTAATTATCCCCAATTGGGTAAGATCGAACCTAATCGATGTAGGTCGTATATGAAGTTGAAACGCTTGCGTTTCAAAGGGACGGTTAAAATTGAACGTGTACACTCTGATGTGAACATGGATGGATTATCTCCTAAGATTGAAGGCGTATTTAGTATTGTTATTGTGGTTGATCGGAAACCACATTTAAATCCCAGTGGATGTCTTCATACATTTGATGAACTATTTGGAGCAAGGATTCATAGCCATGGGAATCTTGCTGTGATGCCTTCTTTGAAAGACCGATTTTACATACGACACGTGTTGAAGCGTGTTTTATCGGTAGATAAAGACACGACTATGATAGACGTTGAGGGTTCCACTTTGTTGTCTAATAAGCGTTATAATATGTGGTCTACGTTTAATGATTTTGATCATGACTCATGTAATGGTGCATATGCTAATATTGCTAAGAACGCTTTATTAGTGTATTATTGTTGGATGTCGGATATTATGTCTAAGGCATCGACATTTGTGTCATTTGATCTTGATTATGTTGGATAA |
|
Protein Sequence
|
MYTSKYKRGSSNYQRRGYSRSQGFRRTSIVKRHDGKRRQHQSSKSNEDPKLLVQCIRENQFGPDFVMAHNTAISTFINYPQLGKIEPNRCRSYMKLKRLRFKGTVKIERVHSDVNMDGLSPKIEGVFSIVIVVDRKPHLNPSGCLHTFDELFGARIHSHGNLAVMPSLKDRFYIRHVLKRVLSVDKDTTMIDVEGSTLLSNKRYNMWSTFNDFDHDSCNGAYANIAKNALLVYYCWMSDIMSKASTFVSFDLDYVG |
|
NCBI Accession
|
YP_009507974.1
|
|
Location
|
1316-2197 |
|
Gene Name
|
BL1 |
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Protein Name
|
BL1 protein |
|
Coding Region
|
ATGGATTCTCAGTTAGCAAATCCTCCAAATGCATTTAATTATGTAGAGTCACACAGAGACGAATATCAATTGTCTCATGATCTAACTGAGATAATCCTTCAATTTCCTTCCACAGCTTCTCAATTATCTGCGAGATTCAGTCGCAGCTGTATGAAGATCGATCATTGCGTCATAGAATATAGGCAACAGGTGCCTATTAACGCAACAGGATCAGTTGTAGTGGAGATTCATGACAAGAGGATGACAGACAACGAATCATTACAAGCTTCATGGACATTTCCCATTAGATGCAACATAGATCTCCACTACTTTTCATCGTCATTTTTCTCGTTGAAAGACCCAATACCATGGAAACTCTATTATAGAGTTTCAGACACCAACGTTCATCAAAGGACACATTTCGCAAAATTCAAAGGAAAACTGAAATTATCAACGGCTAAACATTCAGTAGATATCCCCTTCCGGGCACCAACAGTTAAAATATTATCAAAGCAGTTTTCCAATAAGGACGTCGACTTCTCCCACGTCGACTATGGGAGGTGGGAAAGGAAATTGATCCGGTCCGCATCATTATCAAGGTATGGTCTACAAGGCCCAATCGAATTAAAACCAGGAGAGTCTTGGGCCTCAAGAAGTACAATCGGTATGTCTCATGTAGATGCGGACTCGGACTTAGAGAGCGCGATACACCCATACAAGGATTTAAACAGACTGGGAACCAGTGTTTTGGACCCGGGAGATTCAGCGTCAATTATTGGGGCTCAGAGAGCCCAATCAAACATAACATTGTCAATTGCACAATTAAACGAAATTGTGCGATCAACGGTACATGAATGTATCAACAACAATTGTACTCCTTCTCAACCAAAATCTTTGAAATAA |
|
Protein Sequence
|
MDSQLANPPNAFNYVESHRDEYQLSHDLTEIILQFPSTASQLSARFSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINATGSVVVEIHDKRMTDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVSDTNVHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFRAPTVKILSKQFSNKDVDFSHVDYGRWERKLIRSASLSRYGLQGPIELKPGESWASRSTIGMSHVDADSDLESAIHPYKDLNRLGTSVLDPGDSASIIGAQRAQSNITLSIAQLNEIVRSTVHECINNNCTPSQPKSLK |
|
NCBI Accession
|
YP_009507975.1
|
|
Location
|
344-1129 |
|
Gene Name
|
AR1 |
|
Protein Name
|
coat protein |
|
Coding Region
|
ATGCATGCCCATTCCACGTGTAAGTCCAGAATGCCTAAGCGTGATGCGCCTTGGCGTAATAATGCGGGAACCTACAAGGTTTCCCGTTCTGGCAATTATTCTCCAGGCGGTGGAATGGGCTCAAAATCCAACAAGGCCAATGCATGGGTTAACAGGCCCATGTATAGAAAGCCAAGGATATATCGGATGTACAGAAGCCCAGACGTGCCCAAGGGATGTGAAGGACCTTGCAAGGTCCAATCATATGAACAACGCCATGATATATCTCATGTTGGTAAGGTTATGTGTATATCCGATATCACACGTGGGAATGGTATTACCCACCGTGTTGGTAAACGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTACATTTTAGGGAAGATATGGATGGATGAAAATATCAAGCTTAAGAACCATACTAATAGTGTTATATTTTGGTTGGTCCGTGACCGTAGACCATATGGAACCCCTATGGATTTTGGTCAAGTTTTTAATATGTTTGACAATGAACCCAGTACTGCTACGGTCAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAAGTTATGCATAGGTTCAATGCAAAGGTGACTGGTGGTCAATATGCAAGCAACGAGCAAGCCTTGGTAAGGCGATTTTGGAAGGTGAACAACCATGTCGTCTATAACCACCAGGAAGCAGGAAAATACGAGAATCATACGGAGAATGCGTTATTGTTATATATGGCATGTACACATGCCTCTAATCCTGTATATGCGACATTGAAAATTCGGATCTATTTCTATGATTCGATAACCAATTAA |
|
Protein Sequence
|
MHAHSTCKSRMPKRDAPWRNNAGTYKVSRSGNYSPGGGMGSKSNKANAWVNRPMYRKPRIYRMYRSPDVPKGCEGPCKVQSYEQRHDISHVGKVMCISDITRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVIFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVMHRFNAKVTGGQYASNEQALVRRFWKVNNHVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSITN |
|
NCBI Accession
|
YP_009507976.1
|
|
Location
|
1126-1524 |
|
Gene Name
|
AL3 |
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Protein Name
|
AL3 protein |
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Coding Region
|
ATGGATTCACGCACAGGGGAGAACATCACTGCGCATCAGGCAGAGAATTCCGTTTTTATTTGGGAGGTACCAAATCCCCTTTATTTCAAGATCATGCGGGTGGAAGATCCAGCATACACACGGACAAGGATATACCACATCCAAGTCAGGTTCAATCACAACCTCAGGAAAGCACTGGATCTCCACAAAGCATTCCTGAACTTCCAAGTCTGGACGACATCGATTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAGATTTAGACATTTGGTTTTATTGTATTTACATAGGTTAGGCGTAATAGGATTAAACAATGTCAATCGAGCTGTTCAGTTCGCAACAGACAAATCATATGTAAATACTGTACTTGAGAATCATGAAATAAAATATAAATTTTATTAA |
|
Protein Sequence
|
MDSRTGENITAHQAENSVFIWEVPNPLYFKIMRVEDPAYTRTRIYHIQVRFNHNLRKALDLHKAFLNFQVWTTSIQASGTTYLNRFRHLVLLYLHRLGVIGLNNVNRAVQFATDKSYVNTVLENHEIKYKFY |
|
NCBI Accession
|
YP_009507977.1
|
|
Location
|
1271-1789 |
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Gene Name
|
AL2 |
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Protein Name
|
AL2 protein |
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Coding Region
|
ATGGAAAGCCGGTTCAAATTAAAGGAGGAATACCATCAATCGTGCTGTGCAATCCAGGTGAGGGTTCCAGTTATAAAGACTTCCTCGACAAAGAAGAAAACCGAGCTTTACACAACTGGACTATTCATAATGCGATCTTCGTCACCCTCACAGCCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGATTGCCAAACGTAAAGCCATTCGTCGACGACGCATTGACCTGAACTGCGGCTGTTCCATATTTTACCATATCAAGTGCGCAGATCATGGATTCACGCACAGGGGAGAACATCACTGCGCATCAGGCAGAGAATTCCGTTTTTATTTGGGAGGTACCAAATCCCCTTTATTTCAAGATCATGCGGGTGGAAGATCCAGCATACACACGGACAAGGATATACCACATCCAAGTCAGGTTCAATCACAACCTCAGGAAAGCACTGGATCTCCACAAAGCATTCCTGAACTTCCAAGTCTGGACGACATCGATTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAG |
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Protein Sequence
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MESRFKLKEEYHQSCCAIQVRVPVIKTSSTKKKTELYTTGLFIMRSSSPSQPPSIKAQHRIAKRKAIRRRRIDLNCGCSIFYHIKCADHGFTHRGEHHCASGREFRFYLGGTKSPLFQDHAGGRSSIHTDKDIPHPSQVQSQPQESTGSPQSIPELPSLDDIDSSFWDDIFK |