Bean golden mosaic virus
Basic Information
| Genus |
Begomovirus
|
| NCBI Assembly |
GCF_000841845.1 |
| Release date |
2015/2/12 |
| Submitter |
Gilbertson,R.L., Faria,J.C., Hanson,S.F., Morales,F.J., Ahlquist,P.G., Maxwell,D.P., Russell,D.R., Hidayat,S.H., Martinez,R.T., Leong,S.A. |
| Download |
Genome
|GFF3
|PEP
|CDS |
Genomic Organization
JBrowse
Genome
TTTAAAACGCTTTGGTGGTGGCATACTTGTAAATAAGAGGGTGTACCCCGATTGAGCTCTCGTTCAAAAGTCTCTATGAATCGGTGTAATGGTGCCAATATATAGTAAGAAGTTCTTTAAGGATCTGTAGACACGTGGCGGCCATCCGCTATAATATTACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTTTAAGGCCCATTCTTGTTGGGCCGCTTGGGCCTTTCTTTATTTGAATTAAAGTAAAGTCATTTATTGTGACCAATAACTTTTGTGCTGACGGGTTTAGTTAATTTTGAACTTGTCGCCCAAGTTCTTTACTAAACTATAAATTTAATGTTGAATTGACCATATGCTTTAATTCAAAATGCCTAAGCGTGATGCTCAATGGCGCCATATGGGAGGTACGTCAAAAATTAGCCGTTCTGCTAATTTTTCTCCTCGTGGGGGTAATGGGCCTAAATACAACAAGGCCGCCGAATGGGTAAATAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGAACGTTACGAGGCCCTGACGTTCCACGGGGCTGTGAAGGCCCGTGTAAGGTACAGTCCTATGAACAACGACATGATGTCTCTCATGTTGGGAAGGTTATGTGTGTATCTGATGTGACGAGAGGTAATGGTATTACCCATCGTGTAGGAAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTTTATATTTTAGGTAAGATATGGATGGACGAAAATATCAAGTTGAAGAATCACACGAACAGTGTGATGTTTTGGTTAGTGAGAGATCGTAGACCGTATGGTACTCCTATGGACTTTGGTCAAGTTTTTAATATGTTTGACAATGAACCCAGTACTGCTACTGTTAAGAACGATCTTCGTGATCGTTTTCAAGTTATGCATAAGTTCTATGGAAAGGTAACAGGTGGACAATATGCTAGCAACGAGCAGGCATTGGTCAAGCGTTTTTGGAAGGTGAATAACTATGTAGTTTACAATCATCAAGAAGCAGGGAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCTTTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCCGTGTATGCTACTCTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATCACCAATTAATAAAATTTATATTTTATTTCATGATTCTCAAGTACATAATTTACATATGATTTATCTGTTGCGAAACGTACAGCTCTGATTACATTGTTAAGCGAAATGACACCTATTCTATCTAAATACAATAGCACTAAATATTTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTTGAAGAGATATCGTCCAGACTTGGAAATTCAGGAAAGCCTTGTGTAGACCCAGTTTGTTCCTGAGGTTGTGGTTGAACCGTATTTGGAGGTGGTATACTCTGGTCGTTGTGTATTGTAGATCCTCTACGTTGTACATCTTGAAATAAAGGGGATTTGATATCTCCCAGATATACACGCCATTCTCCGCTTGACGTGCAGTGATGCGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGTCCTGAGCAATTTATGTGTACGTAAATTGTGCAGCCGCACTCTAAATCAACGCGACGTCGTCTGATTGCTCGTTTCTTCGCAGCTCTGTGTTGAACTTTGATAGAGGGGGGAGTTGAGGAAGATGAATTTCGCATTATGGATTGTCCAGTTTTTAAGAGCTGCGTTTTCCTCTTTGTCGAGGAAACATTTATAACTGGCTCCTTCACCTGGATTGCAAAGCACGATTGATGGGATTCCACCTTTAATTTGAACGGGTTTCCCGTATTTGCAGTTTGATTGCCAGTCCTTTTGAGCTCCCATCAATTCCTTCCAGTGCTTTAACTTTAGATAGTGCGGTGCGATGTCATCAATGACGTTATACTCAGCATGATTTGAAAACACCTTTGAGTTGAAATCCAGGTGACCACTTAAATAATTGTGGGTCCCTAATGCACGTGCCCACATTGTCTTCCCCGTTCGTGAATCACCTTCGATGATGATACTAATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGCACCTCTCCCGAAATAATCATCTGCCCATTCTTGCATCTCTCTCGGTACGTTAGTAAAAGAGGAGAGGTGATACGGAGGTGACCACGGATCCGGAGCTTTTGTGAATATTCTATCCAGGTTACTGGATAAATTGTGATATTGGAAGAGAAACTTTTCCGGTAGTTTCTCTTTGATTATTTGCATGGCTTCTTCCTTTGAAGAAGCATTCAATGCTTCGGATGCCGCATCATTAGCTGTCTGTTGACCTCCTCTAGCAGATCTTCCGTCGACTTGAAAATGACCCCATTCGATGTAATCACCGTCTTTCTCGATGTAGGACTTGACATCAGAGGATGATTTTGCACTCTGTATATTGGCATGGGAGACGGAAGATGTTGTTGGGTGTTTGAGGTCGAACACTCTGCAATTCGTGCACTGGAACTTGCCTTCGAATTGGATAAGAGCATGCAGATGTGGTTCCCCATTCTCGTGAATTTCTCTGCAAATTCTGATGTATTTCTTGTTCACCGGTGTTTGTAGGTTTTGAAGTTGTTCAATTGCACTCTCTTTTGTAATTGAACATTGTGGGTATGTGAGGAAATAATTCTTTGCGTTTAT
TTTAAAACGCTTTGGTGATGGCATACTCGTAAATAAGAGGGTGTACCCCGATTGAGCTCTCGTTCAAAAGTCTCTATGAATCGGTGTAATGGTGCCAATATATAGTATGAAGTTCTTTAAGGATCTGGAGACACGTGGCGGCCATCCGTTATAATATTACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTCCCCTCTGAAATCCTGGCCGTTTATTTCAGTTCCGCAAAACTAGTTGAGCGTGTTTTTGAAATCCGTTGTCCATGTGTTGACACGTGTTCCATACAGGGGCTTATTTGTCATATTAGGTGATGACCAACTTTAGTTTTGCACGTGGCGCGTTTTACAATGTTGCATTTAATTGGAAATTTTTATCTAACGGCTATATTTGATTCAAATTTTGAATCATGTGAGAGTTGTCAGAAATTGGCTTTATATTTCTGACATTGTACTATATATTGAGATGGACCAATTAAATGCCTTGTTTCGTGTCTATTTAAATATTGTTGTAGATATATTGTGTATAAATTGTGTTCATTTTTATTAAGGAGACATGTGTATTTGAAAATGTATTTTTCGCGAAACAAACGTGGTGCCACTACTACTTCGAGACGAAGCTATTCAAGGTATCCCTTGTCTAGGCGTTCGTATAGTGTGAATAGAATCAATGGCAAACGTGGATCGAATATTCATAGAAAGGCCCATGATGATGGTAAAATGTTAGCCCAACGTTTACATGAGAATCAGTTTGGGCCTGAATTTGTCATGGCCCATAATTCAGCGATATCAACGTTTATTAATTTCCCTAGTCTTGGTAAGACTGAACCGAATCGATCAAAGAGCTTTATTAAGTTAAAACGTTTACGTTTTAAGGGTACTGTTAAAATTGAACGTGTTTTGAATATGGATGGTTCAACTCCTAAGATTGAAGGCGTATTTTCCATGGTCCTTGTTGTTGACCGAAAACCTCACTTGGGATCATCTGGATGTCTCCATACATTTGATGAATTGTTCGGTGCAAGGATTCATAGTCACGGTAATTTAGCCATTACTGCCACATTGAAAGAGCGATTCTATATACGTCATGTTTATAAGCGTGTGCTTTCAGTTGAGAAGGATAGCATGATGGTCGACGTCGAAGGAAGCACATACTTATCTAGTAGGCGTTTTAATTGTTGGGCTACATTTAAAGATGATGAACGTGACTCTTGTAATGGCGTTTATGCTAACATAAGCAAGAATGCTCTTTTAGTCTATTATTGTTGGATGTCGGATGCTATGTCCAAGGCATCTACGTTTGTATCATTTGATCTTGATTATGTTGGATGAATAATAGTAAGTTTCAAATAAGCCCTGTATATTTCCTGTTTATAGTTGCTTAAAATATTTATAAAATATTTTTATTTCAACGACTTTGGTTGAGCAGGAGTACAATTACTGTTAATACATTCTTGGGCCGCAGTTTTAACCAATTCGTTTAATTGGGCCATTGAAAGGGTGATACTTGACTCGGTTCTTCGCGCTCCAACTATAGATGCGGAATCTCCAGGGTCTAGAATACTTGTGTCCAATCTATGAAGTTGTCTATATGGATGTACTGCGTTGTCTAATTCAGAGTCCGCATCTGAAGTACCGGTTCCTATTGTACTTCTTGTTGCCCATGTCTCACCGGGTTTTAATGTAATTGGGCTGTGAAGCCCATATCGAGATGTGGATGCGGACTTTATTAATTTCCTCTCCCATTTCCCGTAACCAACGTGGGAGAAATCCACATCTTTCTCAGTGAATTGTGTAGATAATATTTTCACGGTTGGGGGCTTGAAAGGAATATCCACCGAATGTTTCGCAGTGGATATCTTCAGTTTCCCCTTAAATTTTGCGAAGTGTGTTCGTTGATGAACATTTGTGTCGCTAACTCTGTAATACAATTTCCAGGGAATTGGGTCTTTAAGGGAGAAGAATGAAGATGAAAAAAAGTGGAGATCTATGTTACACCTTATGGGATATGTCCATGATGCTTGTAATGACTCATTATCCGTCATTCTTTTGTCGTGAATCTCCACAATCACAGTTCCTGTTGCGTTGATAGGAACTTGTTGCCTGTATTCAATGACGCAATGATCTATCTTCATACAGCTTCGACTTAATCTGGCGCTTATTTGAGCTGTTGTTGAAGGAAATTGTAATACTATCTCATTCAAGTCATGAGACAGTTGATATTCATCACGGTTAGATTCTACATAATTGAACGCTGTTGGTGGATTAACTAATTGAGACTCCATTATCAACTGAATATAAGAATGAATGGCCGCGCAGCGCACTCGGTTCGGGAGTTTATGATGCAGAGACTATAAAAGAGCTGTTTTCTTGCTTAAGAACAATTTGACAGAAAGGAAGGAAGAGAAGTTGTTATATATGATAATGGGCGTTCCCCAATGTTTAAATAGACAAGTTTATTTTCGTACAACTCTGTAAAGTAATCAATGATTATGTATGTTCAAGTTGGACAAGTAATCATTTTTTACTTTATTAAATGGTGTTTATTTAGAGTAAACTTATGTGTATCTGTGTGTATAAGTTTGTGTTAAAG
Gene Information
|
NCBI Accession
|
NP_660081.1
|
|
Location
|
1556-2617,1-24 |
|
Gene Name
|
AL1 |
|
Protein Name
|
putative replicative protein |
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Coding Region
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ATGCCACCACCAAAGCGTTTTAAAATAAACGCAAAGAATTATTTCCTCACATACCCACAATGTTCAATTACAAAAGAGAGTGCAATTGAACAACTTCAAAACCTACAAACACCGGTGAACAAGAAATACATCAGAATTTGCAGAGAAATTCACGAGAATGGGGAACCACATCTGCATGCTCTTATCCAATTCGAAGGCAAGTTCCAGTGCACGAATTGCAGAGTGTTCGACCTCAAACACCCAACAACATCTTCCGTCTCCCATGCCAATATACAGAGTGCAAAATCATCCTCTGATGTCAAGTCCTACATCGAGAAAGACGGTGATTACATCGAATGGGGTCATTTTCAAGTCGACGGAAGATCTGCTAGAGGAGGTCAACAGACAGCTAATGATGCGGCATCCGAAGCATTGAATGCTTCTTCAAAGGAAGAAGCCATGCAAATAATCAAAGAGAAACTACCGGAAAAGTTTCTCTTCCAATATCACAATTTATCCAGTAACCTGGATAGAATATTCACAAAAGCTCCGGATCCGTGGTCACCTCCGTATCACCTCTCCTCTTTTACTAACGTACCGAGAGAGATGCAAGAATGGGCAGATGATTATTTCGGGAGAGGTGCCGCTGCGCGGCCGGAGAGACCTATTAGTATCATCATCGAAGGTGATTCACGAACGGGGAAGACAATGTGGGCACGTGCATTAGGGACCCACAATTATTTAAGTGGTCACCTGGATTTCAACTCAAAGGTGTTTTCAAATCATGCTGAGTATAACGTCATTGATGACATCGCACCGCACTATCTAAAGTTAAAGCACTGGAAGGAATTGATGGGAGCTCAAAAGGACTGGCAATCAAACTGCAAATACGGGAAACCCGTTCAAATTAAAGGTGGAATCCCATCAATCGTGCTTTGCAATCCAGGTGAAGGAGCCAGTTATAAATGTTTCCTCGACAAAGAGGAAAACGCAGCTCTTAAAAACTGGACAATCCATAATGCGAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCCCTCTATCAAAGTTCAACACAGAGCTGCGAAGAAACGAGCAATCAGACGACGTCGCGTTGA |
|
Protein Sequence
|
MPPPKRFKINAKNYFLTYPQCSITKESAIEQLQNLQTPVNKKYIRICREIHENGEPHLHALIQFEGKFQCTNCRVFDLKHPTTSSVSHANIQSAKSSSDVKSYIEKDGDYIEWGHFQVDGRSARGGQQTANDAASEALNASSKEEAMQIIKEKLPEKFLFQYHNLSSNLDRIFTKAPDPWSPPYHLSSFTNVPREMQEWADDYFGRGAAARPERPISIIIEGDSRTGKTMWARALGTHNYLSGHLDFNSKVFSNHAEYNVIDDIAPHYLKLKHWKELMGAQKDWQSNCKYGKPVQIKGGIPSIVLCNPGEGASYKCFLDKEENAALKNWTIHNAKFIFLNSPLYQSSTQSCEETSNQTTSR |
|
NCBI Accession
|
NP_660082.1
|
|
Location
|
358-1113 |
|
Gene Name
|
AR1 |
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Protein Name
|
coat protein |
|
Coding Region
|
ATGCCTAAGCGTGATGCTCAATGGCGCCATATGGGAGGTACGTCAAAAATTAGCCGTTCTGCTAATTTTTCTCCTCGTGGGGGTAATGGGCCTAAATACAACAAGGCCGCCGAATGGGTAAATAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGAACGTTACGAGGCCCTGACGTTCCACGGGGCTGTGAAGGCCCGTGTAAGGTACAGTCCTATGAACAACGACATGATGTCTCTCATGTTGGGAAGGTTATGTGTGTATCTGATGTGACGAGAGGTAATGGTATTACCCATCGTGTAGGAAAACGTTTTTGTGTTAAGTCTGTTTATATTTTAGGTAAGATATGGATGGACGAAAATATCAAGTTGAAGAATCACACGAACAGTGTGATGTTTTGGTTAGTGAGAGATCGTAGACCGTATGGTACTCCTATGGACTTTGGTCAAGTTTTTAATATGTTTGACAATGAACCCAGTACTGCTACTGTTAAGAACGATCTTCGTGATCGTTTTCAAGTTATGCATAAGTTCTATGGAAAGGTAACAGGTGGACAATATGCTAGCAACGAGCAGGCATTGGTCAAGCGTTTTTGGAAGGTGAATAACTATGTAGTTTACAATCATCAAGAAGCAGGGAAGTACGAGAATCATACGGAGAACGCTTTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCCTCAAATCCCGTGTATGCTACTCTAAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATCACCAATTAA |
|
Protein Sequence
|
MPKRDAQWRHMGGTSKISRSANFSPRGGNGPKYNKAAEWVNRPMYRKPRIYRTLRGPDVPRGCEGPCKVQSYEQRHDVSHVGKVMCVSDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHKFYGKVTGGQYASNEQALVKRFWKVNNYVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSITN |
|
NCBI Accession
|
NP_660083.1
|
|
Location
|
1110-1508 |
|
Gene Name
|
AL3 |
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Protein Name
|
AL3 protein |
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Coding Region
|
ATGGATTCACGCACAGGGGAACGCATCACTGCACGTCAAGCGGAGAATGGCGTGTATATCTGGGAGATATCAAATCCCCTTTATTTCAAGATGTACAACGTAGAGGATCTACAATACACAACGACCAGAGTATACCACCTCCAAATACGGTTCAACCACAACCTCAGGAACAAACTGGGTCTACACAAGGCTTTCCTGAATTTCCAAGTCTGGACGATATCTCTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAGATTTAAATATTTAGTGCTATTGTATTTAGATAGAATAGGTGTCATTTCGCTTAACAATGTAATCAGAGCTGTACGTTTCGCAACAGATAAATCATATGTAAATTATGTACTTGAGAATCATGAAATAAAATATAAATTTTATTAA |
|
Protein Sequence
|
MDSRTGERITARQAENGVYIWEISNPLYFKMYNVEDLQYTTTRVYHLQIRFNHNLRNKLGLHKAFLNFQVWTISLQASGTTYLNRFKYLVLLYLDRIGVISLNNVIRAVRFATDKSYVNYVLENHEIKYKFY |
|
NCBI Accession
|
NP_660084.1
|
|
Location
|
1255-1644 |
|
Gene Name
|
AL2 |
|
Protein Name
|
AL2 protein |
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Coding Region
|
ATGCGAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCCCTCTATCAAAGTTCAACACAGAGCTGCGAAGAAACGAGCAATCAGACGACGTCGCGTTGATTTAGAGTGCGGCTGCACAATTTACGTACACATAAATTGCTCAGGACATGGATTCACGCACAGGGGAACGCATCACTGCACGTCAAGCGGAGAATGGCGTGTATATCTGGGAGATATCAAATCCCCTTTATTTCAAGATGTACAACGTAGAGGATCTACAATACACAACGACCAGAGTATACCACCTCCAAATACGGTTCAACCACAACCTCAGGAACAAACTGGGTCTACACAAGGCTTTCCTGAATTTCCAAGTCTGGACGATATCTCTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAG |
|
Protein Sequence
|
MRNSSSSTPPSIKVQHRAAKKRAIRRRRVDLECGCTIYVHINCSGHGFTHRGTHHCTSSGEWRVYLGDIKSPLFQDVQRRGSTIHNDQSIPPPNTVQPQPQEQTGSTQGFPEFPSLDDISSSFWDDIFK |
|
NCBI Accession
|
NP_660085.1
|
|
Location
|
558-1319 |
|
Gene Name
|
BR1 |
|
Protein Name
|
BR1 protein |
|
Coding Region
|
ATGTATTTTTCGCGAAACAAACGTGGTGCCACTACTACTTCGAGACGAAGCTATTCAAGGTATCCCTTGTCTAGGCGTTCGTATAGTGTGAATAGAATCAATGGCAAACGTGGATCGAATATTCATAGAAAGGCCCATGATGATGGTAAAATGTTAGCCCAACGTTTACATGAGAATCAGTTTGGGCCTGAATTTGTCATGGCCCATAATTCAGCGATATCAACGTTTATTAATTTCCCTAGTCTTGGTAAGACTGAACCGAATCGATCAAAGAGCTTTATTAAGTTAAAACGTTTACGTTTTAAGGGTACTGTTAAAATTGAACGTGTTTTGAATATGGATGGTTCAACTCCTAAGATTGAAGGCGTATTTTCCATGGTCCTTGTTGTTGACCGAAAACCTCACTTGGGATCATCTGGATGTCTCCATACATTTGATGAATTGTTCGGTGCAAGGATTCATAGTCACGGTAATTTAGCCATTACTGCCACATTGAAAGAGCGATTCTATATACGTCATGTTTATAAGCGTGTGCTTTCAGTTGAGAAGGATAGCATGATGGTCGACGTCGAAGGAAGCACATACTTATCTAGTAGGCGTTTTAATTGTTGGGCTACATTTAAAGATGATGAACGTGACTCTTGTAATGGCGTTTATGCTAACATAAGCAAGAATGCTCTTTTAGTCTATTATTGTTGGATGTCGGATGCTATGTCCAAGGCATCTACGTTTGTATCATTTGATCTTGATTATGTTGGATGA |
|
Protein Sequence
|
MYFSRNKRGATTTSRRSYSRYPLSRRSYSVNRINGKRGSNIHRKAHDDGKMLAQRLHENQFGPEFVMAHNSAISTFINFPSLGKTEPNRSKSFIKLKRLRFKGTVKIERVLNMDGSTPKIEGVFSMVLVVDRKPHLGSSGCLHTFDELFGARIHSHGNLAITATLKERFYIRHVYKRVLSVEKDSMMVDVEGSTYLSSRRFNCWATFKDDERDSCNGVYANISKNALLVYYCWMSDAMSKASTFVSFDLDYVG |
|
NCBI Accession
|
NP_660086.1
|
|
Location
|
1391-2272 |
|
Gene Name
|
BL1 |
|
Protein Name
|
BL1 protein |
|
Coding Region
|
ATGGAGTCTCAATTAGTTAATCCACCAACAGCGTTCAATTATGTAGAATCTAACCGTGATGAATATCAACTGTCTCATGACTTGAATGAGATAGTATTACAATTTCCTTCAACAACAGCTCAAATAAGCGCCAGATTAAGTCGAAGCTGTATGAAGATAGATCATTGCGTCATTGAATACAGGCAACAAGTTCCTATCAACGCAACAGGAACTGTGATTGTGGAGATTCACGACAAAAGAATGACGGATAATGAGTCATTACAAGCATCATGGACATATCCCATAAGGTGTAACATAGATCTCCACTTTTTTTCATCTTCATTCTTCTCCCTTAAAGACCCAATTCCCTGGAAATTGTATTACAGAGTTAGCGACACAAATGTTCATCAACGAACACACTTCGCAAAATTTAAGGGGAAACTGAAGATATCCACTGCGAAACATTCGGTGGATATTCCTTTCAAGCCCCCAACCGTGAAAATATTATCTACACAATTCACTGAGAAAGATGTGGATTTCTCCCACGTTGGTTACGGGAAATGGGAGAGGAAATTAATAAAGTCCGCATCCACATCTCGATATGGGCTTCACAGCCCAATTACATTAAAACCCGGTGAGACATGGGCAACAAGAAGTACAATAGGAACCGGTACTTCAGATGCGGACTCTGAATTAGACAACGCAGTACATCCATATAGACAACTTCATAGATTGGACACAAGTATTCTAGACCCTGGAGATTCCGCATCTATAGTTGGAGCGCGAAGAACCGAGTCAAGTATCACCCTTTCAATGGCCCAATTAAACGAATTGGTTAAAACTGCGGCCCAAGAATGTATTAACAGTAATTGTACTCCTGCTCAACCAAAGTCGTTGAAATAA |
|
Protein Sequence
|
MESQLVNPPTAFNYVESNRDEYQLSHDLNEIVLQFPSTTAQISARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINATGTVIVEIHDKRMTDNESLQASWTYPIRCNIDLHFFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVSDTNVHQRTHFAKFKGKLKISTAKHSVDIPFKPPTVKILSTQFTEKDVDFSHVGYGKWERKLIKSASTSRYGLHSPITLKPGETWATRSTIGTGTSDADSELDNAVHPYRQLHRLDTSILDPGDSASIVGARRTESSITLSMAQLNELVKTAAQECINSNCTPAQPKSLK |