Rhynchosia mild mosaic virus

Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000891055.1
Isolate Puerto Rico
Release date 2015/2/22
Submitter Zhao,Z.C., Hu,G.B., Hu,F.C., Wang,H.C., Yang,Z.Y., Lai,B., Idris,A.M., Brown,J.K.
Host
Vector
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Genomic Organization

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Genome

NC_015488
ACCGGATGGCCGACCGCTGGCTTTGGTGTATGGCCTGTACGCACGTGATGCTGTTGTTCGAATTAAAGATGTTTATTTTGCTTTGTCCAATGACGTTTGTCGTGGCGCGTCTAGATAATTGTGTTCAACTTAGCGCCCAAGTATTGACTGTATATAAATACGAGCTATGTGACGTGGAACTAATCATCTTTAATTCAAAATGCCTAAGCGGGATGCCCCGTGGCGTTCTACTGCGGGGACCTCTAAGGTTAGTCGCAATTTGAATTACTCCCCTGGTGGAGGCCCAAAAACCAACAGGGCCAATGCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTACAGGACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGGCCCTGTAAGATCCAGTCGTTTGAACAACGCCATGATGTTTCGCACGTTGGTAGGGTTATGTGTATATCCGACGTGACACGTGGTAGTGGTATTACCCATCGCGTTGGGAAACGATTTTGTGTTAAGTCTGTGTATATTTTAGGCAAAGTATGGATGGACGACAACATCAAGTTGAAGAACCACACCAACAGTGTTATGTTTTGGTTGGTTAGGGATAGGAGACCATATGGCACCCCTATGGATTTTGGGCAGGTGTTTAATATGTTTGACAATGAGCCCAGTACCGCTACTGTTAAGAACGATCTTCGTGATCGTTTCCAGGTGATGCATAAGTTTTATGCCAAGGTTACAGGTGGACAATATGCGAGCAATGAACAGGCAATTGTTAAGCGTTTTTGGAAGGTCAACACTCATGTGGTGTACAACCATCAGGAAGCCGCAAAGTACGAGAACCATACTGAGAACGCTCTATTGTTGTATATGGCTTGTACTCATGCCTCGAACCCTGTGTATGCTACTTTGAAAATTCGGATCTATTTTTACGATTCGATAATGAATTAATAAAATTTGTATTTTATTTCATGATCTTCAACTACATTATTTACATAACGTCTGTCCGTTGCATATGAGACAGCTCTGATTATATTGTTAACTGAAATAACACCTAAATTGTCTAAGTAATACATGACAAGGTACTTAAATCTACTTAAATAAATCTGCCCAGAAGCTGTCGTCAATGTCGTCCAGACTTGGAAATTGAAGTAGGCTTTGTGAAGTGCCAACGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGGCTCGGATTTGTATGTCGAACACCGTGCTGTTCGTGTACATCGGACGCTCCACGTTGATTATCTTGAAATAAAGGGGATTTTGAACCTCCCAAATAAAAACGCCATTCGTTGCTTGAGCTGCAGTGATGGGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGATTGCTGCAGTTAATGTGGACGTAAATCGAACAGCCGCACTGCAGATCAAATCTTCTACGTCGAGTCTGTCTCTTCGCGTAACGATGACGAGGTTTGATTGACGGTGGAGTAGAGTGGTTCCTCAATGGAGACGTAGACGGCGTTTTTTTGTGCCCAGTCATTGAGTGATTTGTTTTTCTCTTCTCCGAGATACTCCTTATATGATGAATGGGGACCAGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATTCCTCCTTTAATTTGAATTGGCTTTCCGTATTTGCAGTTTGATTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAACTCTTTAAAGTGCTTCAGATAATGCGGATCAACGTCATCGATGACGTTATACCACGCATCGTTGGAGTATATCCTTGGGTTGAGATCGATATGACCACATAAATAATTGTGAGGGCCCAGACTTCGGGCCCATATTGTTTTGCCCGTTCTTGATGGACCTTCAACAATGATTGATATCGGTCTCAATGGCCGCGCAGCGGAATCGGAAATATTTTCGTTAACCCAATCGGACATGATTTCTGGGACATTGTTGAACGTGGATAATTGAAACGGAGAAACCCATGGTTCTGGTGGTTTATGAAATATTTTCGTTATGTTGGACACCAGATTGTGATATTGAAGGACGAAATGTTTAGGTTGTTGCTCTTTAATAATCTGCATAGCCTCTTCTGCAGATTCTGCATTTAACGCCCTTGCATATGAATCGTTAGCAGATTGCTGACCTCCTCTAGCAGATCTGCCGTCGATCTGAAATTCTCCCCATTCAATTGTATCGCCGTCCTTGTCGATGTAGGACTTGACGTCGGAGCTTGACTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGAAACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTCGTGCACTGGTATTTCCCTTCGAACTGGATGAGCACGTGAAGATGAGGTTCCCCATTTTCATGGAGTTCCGTGCATATTTTGATGAACTTCTTGTTAACTGGAGTTGATAGGTTTTGCAATTGGGAAAGAGCTTCTTCTTTTGTTAGAGAGCATTTGGGGTATGTGAGGAAATAGTTTTTGGCATTTAAGCGGAAACGCTTCTGGAGTGGCATTTTTGTAATAAGAAGGGTGTACCCCGATTGAGGTTCTCAACACTGGCTTATACTATTGGTGTATTGGGGGTCAATATATAGTATACCTTCTTACTAGCATCTGCTGACACGTGGAGGCCATCCGTTATAATATT
NC_015489
ACCGGATGGCCGACCGCTGCCTTTGGTGTATGGTCCCTTTTGCGCTGGAGTGACGCTCTCCCGCTATTGGCGCTCTCTCTCTTCTGACGTGGAGTCTCCTCTACCGTTGGATAAAGCTTATCGCGTTATTGATTTTGAAATTTGAATTATGTGCACGTCGTTTCATGATTATGGTCGTCATGTGAGGCGATAAGGTTTTCTGACACATTGTACGATGTATGAGACGTGGCCCAATAAAATATTATGTGGCGAGTTTAATTATGTTGAGTTGAATAATGTTTGTGTATATAACGACCGAACATGAATAATATTTTAAATCGTCTTTTGACATTAAAACTTGTAATTTTATTTGTACAGGAAAGTTTTAATATGTTTTCGTCGAGATATAGACGTGGTGTACATTATTATGGACGGCAAAATAGTTCAGGTAACAATTTGTTTAAGCGATCATCAAATGTTAAACGTAAGGTTGTTAAACGGCGAATAAGTCATGCAAATAATGTTCAAGAGGATGCGAAAATGGTATCTCAACGCATCCATGAAAATCAGTATGGTCCTGAATTTGTTATGGCGCACAACGCGGCGTTATCTACGTTTATTAATTTCCCTCATTTGGGTCAGAGTCAACCCAATCGGAGCAGGTCATATATTAAGTTAAAACGTCTACGTTTTAAAGGAACGGTTAAGATTGAACGTGTGCATGCTGATGTTAACATGGATGGGTTAAATCCGAAGATTGAAGGAGTGTTCTCTCTTGTAATTGTGGTGGATCGTAAACCTCATTTGAGCTCTACGGGTTGTTTGCATACATTTGATGAATTATTTGGTGCAAGGATCCACAGCCACGGTAATTTAGCTATTACACCGTCATTGAAAGACCGGTTTTATGTTCGCCATGTACTGAAGCGTGTGTTGTCTGTTGAGAAAGACAGTCTGATGGTGGATTTGGAAGGATCTATCGCTCTTTCTAACAGGCGTTTTAATTGTTGGTCTACGTTTAAAGACTTAGATCATGACTCATGTAATGGCGTTTATGACAATATTAGCAAGAACGCCTTGTTAGTATATTATTGTTGGATGTCGGATGTTATGTCTAAGGCATCCACATTTGTATCGTTTGACCTTGACTATGTTGGATGAACATGAATAAAATGAAGATTATAATATAATGTGTATATGTAAATAAAATGTGGCGATTTTATTTCAAAGATTTGGGCTGATTTGGATTACAATTATTGTTTATACATTCTTGAACCGTTGTCCTAACAAGCTCGCTTAATTGGGCTACTGACATTGTAATGTTAGATTGGGCCCTCTGCAACCCGGTTTGTGATGCTGAATCACCTGGGTCTAACGCGCTGGATCCTAAACGATTCAATTCTCTGTATGGGTGTAATGCGTTCTCCAATTCTGACTCTGTGTCCGCTTGATTCAGTCCAACTGTACTTCTGGAAGCCCATGATTCACCTGGCCTTAATTCAATTGGGCCTGGTAGCCCAACTCTTGACATGGATGTGGACCTCAATGTTTTCCTTTCCCATTTGCCGTAGTCCACATGTGAAAAATCAACATCTTTATGTGAAAATTGTTTGGAGTGAATTTTCACTGTTGGTGCCCGGAATGGTATATCCACTGAATGTTTAGCTGTGGACAACTTCAATTTCCCCTTAAACTTGGCAAAATGTGTTCGTTGATGTACATTTGTGTCGCTAACCCTGTAGTATAGCTTCCATGGAATTGGGTCTTTAAGGGAAAAGAACGAACATGAAAAAAAGTGGAGATCTATGTTGCATCGTATGGGAAATGTCCATGACGCTTGTAATGATTCGTCGTCAGTCATTCGTTTGTCATGGATCTCCACAATTACCGACCCAGTCGCGTTTATCGGCACCTGCTGTCTATATTCAATAACGCAATGGTCGATTTTCATACAGCTACGACTAAGTCTTGCTGTTAATTGCGCTGCTGTTGAGGGAAATTGAAGGATTATCTCAGTTAGGTCATGAGACAGTTGATATTCATCCCTATGAGACTCTATATAATTGAAGGCATTTGGAGGATTTGCTAACTGGGAATCCATATATGAACAATTGGCCGCGCAGCGGAACTGGCAGGACAATATGTTTATGAACCACGGATGAACAGAATGAACAACAAGACTATGATAAGCAGGTTATTATGAAACACAATGAACAAGAACAACTGGAAATGAATAACGATAAGCAACTGTTTAAATCATGTTCAATATGCATTTCTGAACGGGGCTGATATGAATATGATGAATAAGAACTGTTTATGCGAAAATTTTTCTGGGTTAACAAATGCTGGTTATGCATATGAATGTTCATTTGCGTTGTTTAAATAGACACGCGGAAGCGTTTGGGTGTGTAATGAAGCGAGAGCGCTCTAAGTGGCATTTTTGTAATAAGAAGGGTGTACCCCGATTGAGGCTCTCAACACTGGCTTATACTATTGGTGTATTGGGGGTCAATATATAGTATACCTTCTTACTAGCATCTGCTGACACGTGGAGGCCATCCGTTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_004429236.1
Location 200-949
Protein Name coat protein
Coding Region ATGCCTAAGCGGGATGCCCCGTGGCGTTCTACTGCGGGGACCTCTAAGGTTAGTCGCAATTTGAATTACTCCCCTGGTGGAGGCCCAAAAACCAACAGGGCCAATGCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTACAGGACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGGCCCTGTAAGATCCAGTCGTTTGAACAACGCCATGATGTTTCGCACGTTGGTAGGGTTATGTGTATATCCGACGTGACACGTGGTAGTGGTATTACCCATCGCGTTGGGAAACGATTTTGTGTTAAGTCTGTGTATATTTTAGGCAAAGTATGGATGGACGACAACATCAAGTTGAAGAACCACACCAACAGTGTTATGTTTTGGTTGGTTAGGGATAGGAGACCATATGGCACCCCTATGGATTTTGGGCAGGTGTTTAATATGTTTGACAATGAGCCCAGTACCGCTACTGTTAAGAACGATCTTCGTGATCGTTTCCAGGTGATGCATAAGTTTTATGCCAAGGTTACAGGTGGACAATATGCGAGCAATGAACAGGCAATTGTTAAGCGTTTTTGGAAGGTCAACACTCATGTGGTGTACAACCATCAGGAAGCCGCAAAGTACGAGAACCATACTGAGAACGCTCTATTGTTGTATATGGCTTGTACTCATGCCTCGAACCCTGTGTATGCTACTTTGAAAATTCGGATCTATTTTTACGATTCGATAATGAATTAA
Protein Sequence MPKRDAPWRSTAGTSKVSRNLNYSPGGGPKTNRANAWVNRPMYRKPRIYRMYRTPDVPRGCEGPCKIQSFEQRHDVSHVGRVMCISDVTRGSGITHRVGKRFCVKSVYILGKVWMDDNIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHKFYAKVTGGQYASNEQAIVKRFWKVNTHVVYNHQEAAKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSIMN

NCBI Accession YP_004429237.1
Location 946-1344
Protein Name REn
Coding Region ATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCAGCTCAAGCAACGAATGGCGTTTTTATTTGGGAGGTTCAAAATCCCCTTTATTTCAAGATAATCAACGTGGAGCGTCCGATGTACACGAACAGCACGGTGTTCGACATACAAATCCGAGCCAACCACAACCTGAGGAAAGCGTTGGCACTTCACAAAGCCTACTTCAATTTCCAAGTCTGGACGACATTGACGACAGCTTCTGGGCAGATTTATTTAAGTAGATTTAAGTACCTTGTCATGTATTACTTAGACAATTTAGGTGTTATTTCAGTTAACAATATAATCAGAGCTGTCTCATATGCAACGGACAGACGTTATGTAAATAATGTAGTTGAAGATCATGAAATAAAATACAAATTTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGEPITAAQATNGVFIWEVQNPLYFKIINVERPMYTNSTVFDIQIRANHNLRKALALHKAYFNFQVWTTLTTASGQIYLSRFKYLVMYYLDNLGVISVNNIIRAVSYATDRRYVNNVVEDHEIKYKFY

NCBI Accession YP_004429238.1
Location 1091-1507
Protein Name TrAP
Coding Region ATGACTGGGCACAAAAAAACGCCGTCTACGTCTCCATTGAGGAACCACTCTACTCCACCGTCAATCAAACCTCGTCATCGTTACGCGAAGAGACAGACTCGACGTAGAAGATTTGATCTGCAGTGCGGCTGTTCGATTTACGTCCACATTAACTGCAGCAATCATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCAGCTCAAGCAACGAATGGCGTTTTTATTTGGGAGGTTCAAAATCCCCTTTATTTCAAGATAATCAACGTGGAGCGTCCGATGTACACGAACAGCACGGTGTTCGACATACAAATCCGAGCCAACCACAACCTGAGGAAAGCGTTGGCACTTCACAAAGCCTACTTCAATTTCCAAGTCTGGACGACATTGACGACAGCTTCTGGGCAGATTTATTTAAGTAG
Protein Sequence MTGHKKTPSTSPLRNHSTPPSIKPRHRYAKRQTRRRRFDLQCGCSIYVHINCSNHGFTHRGTHHCSSSNEWRFYLGGSKSPLFQDNQRGASDVHEQHGVRHTNPSQPQPEESVGTSQSLLQFPSLDDIDDSFWADLFK

NCBI Accession YP_004429239.1
Location 1401-2477
Protein Name Rep
Coding Region ATGCCACTCCAGAAGCGTTTCCGCTTAAATGCCAAAAACTATTTCCTCACATACCCCAAATGCTCTCTAACAAAAGAAGAAGCTCTTTCCCAATTGCAAAACCTATCAACTCCAGTTAACAAGAAGTTCATCAAAATATGCACGGAACTCCATGAAAATGGGGAACCTCATCTTCACGTGCTCATCCAGTTCGAAGGGAAATACCAGTGCACGAATAACAGATTCTTCGACTTGGTTTCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAGTCAAGCTCCGACGTCAAGTCCTACATCGACAAGGACGGCGATACAATTGAATGGGGAGAATTTCAGATCGACGGCAGATCTGCTAGAGGAGGTCAGCAATCTGCTAACGATTCATATGCAAGGGCGTTAAATGCAGAATCTGCAGAAGAGGCTATGCAGATTATTAAAGAGCAACAACCTAAACATTTCGTCCTTCAATATCACAATCTGGTGTCCAACATAACGAAAATATTTCATAAACCACCAGAACCATGGGTTTCTCCGTTTCAATTATCCACGTTCAACAATGTCCCAGAAATCATGTCCGATTGGGTTAACGAAAATATTTCCGATTCCGCTGCGCGGCCATTGAGACCGATATCAATCATTGTTGAAGGTCCATCAAGAACGGGCAAAACAATATGGGCCCGAAGTCTGGGCCCTCACAATTATTTATGTGGTCATATCGATCTCAACCCAAGGATATACTCCAACGATGCGTGGTATAACGTCATCGATGACGTTGATCCGCATTATCTGAAGCACTTTAAAGAGTTCATGGGGGCCCAAAGGGACTGGCAATCAAACTGCAAATACGGAAAGCCAATTCAAATTAAAGGAGGAATTCCCACTATCTTCCTCTGCAATCCTGGTCCCCATTCATCATATAAGGAGTATCTCGGAGAAGAGAAAAACAAATCACTCAATGACTGGGCACAAAAAAACGCCGTCTACGTCTCCATTGAGGAACCACTCTACTCCACCGTCAATCAAACCTCGTCATCGTTACGCGAAGAGACAGACTCGACGTAG
Protein Sequence MPLQKRFRLNAKNYFLTYPKCSLTKEEALSQLQNLSTPVNKKFIKICTELHENGEPHLHVLIQFEGKYQCTNNRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTIEWGEFQIDGRSARGGQQSANDSYARALNAESAEEAMQIIKEQQPKHFVLQYHNLVSNITKIFHKPPEPWVSPFQLSTFNNVPEIMSDWVNENISDSAARPLRPISIIVEGPSRTGKTIWARSLGPHNYLCGHIDLNPRIYSNDAWYNVIDDVDPHYLKHFKEFMGAQRDWQSNCKYGKPIQIKGGIPTIFLCNPGPHSSYKEYLGEEKNKSLNDWAQKNAVYVSIEEPLYSTVNQTSSSLREETDST

NCBI Accession YP_004429240.1
Location 370-1140
Protein Name movement protein
Coding Region ATGTTTTCGTCGAGATATAGACGTGGTGTACATTATTATGGACGGCAAAATAGTTCAGGTAACAATTTGTTTAAGCGATCATCAAATGTTAAACGTAAGGTTGTTAAACGGCGAATAAGTCATGCAAATAATGTTCAAGAGGATGCGAAAATGGTATCTCAACGCATCCATGAAAATCAGTATGGTCCTGAATTTGTTATGGCGCACAACGCGGCGTTATCTACGTTTATTAATTTCCCTCATTTGGGTCAGAGTCAACCCAATCGGAGCAGGTCATATATTAAGTTAAAACGTCTACGTTTTAAAGGAACGGTTAAGATTGAACGTGTGCATGCTGATGTTAACATGGATGGGTTAAATCCGAAGATTGAAGGAGTGTTCTCTCTTGTAATTGTGGTGGATCGTAAACCTCATTTGAGCTCTACGGGTTGTTTGCATACATTTGATGAATTATTTGGTGCAAGGATCCACAGCCACGGTAATTTAGCTATTACACCGTCATTGAAAGACCGGTTTTATGTTCGCCATGTACTGAAGCGTGTGTTGTCTGTTGAGAAAGACAGTCTGATGGTGGATTTGGAAGGATCTATCGCTCTTTCTAACAGGCGTTTTAATTGTTGGTCTACGTTTAAAGACTTAGATCATGACTCATGTAATGGCGTTTATGACAATATTAGCAAGAACGCCTTGTTAGTATATTATTGTTGGATGTCGGATGTTATGTCTAAGGCATCCACATTTGTATCGTTTGACCTTGACTATGTTGGATGA
Protein Sequence MFSSRYRRGVHYYGRQNSSGNNLFKRSSNVKRKVVKRRISHANNVQEDAKMVSQRIHENQYGPEFVMAHNAALSTFINFPHLGQSQPNRSRSYIKLKRLRFKGTVKIERVHADVNMDGLNPKIEGVFSLVIVVDRKPHLSSTGCLHTFDELFGARIHSHGNLAITPSLKDRFYVRHVLKRVLSVEKDSLMVDLEGSIALSNRRFNCWSTFKDLDHDSCNGVYDNISKNALLVYYCWMSDVMSKASTFVSFDLDYVG

NCBI Accession YP_004429241.1
Location 1199-2080
Protein Name nuclear shuttle protein
Coding Region ATGGATTCCCAGTTAGCAAATCCTCCAAATGCCTTCAATTATATAGAGTCTCATAGGGATGAATATCAACTGTCTCATGACCTAACTGAGATAATCCTTCAATTTCCCTCAACAGCAGCGCAATTAACAGCAAGACTTAGTCGTAGCTGTATGAAAATCGACCATTGCGTTATTGAATATAGACAGCAGGTGCCGATAAACGCGACTGGGTCGGTAATTGTGGAGATCCATGACAAACGAATGACTGACGACGAATCATTACAAGCGTCATGGACATTTCCCATACGATGCAACATAGATCTCCACTTTTTTTCATGTTCGTTCTTTTCCCTTAAAGACCCAATTCCATGGAAGCTATACTACAGGGTTAGCGACACAAATGTACATCAACGAACACATTTTGCCAAGTTTAAGGGGAAATTGAAGTTGTCCACAGCTAAACATTCAGTGGATATACCATTCCGGGCACCAACAGTGAAAATTCACTCCAAACAATTTTCACATAAAGATGTTGATTTTTCACATGTGGACTACGGCAAATGGGAAAGGAAAACATTGAGGTCCACATCCATGTCAAGAGTTGGGCTACCAGGCCCAATTGAATTAAGGCCAGGTGAATCATGGGCTTCCAGAAGTACAGTTGGACTGAATCAAGCGGACACAGAGTCAGAATTGGAGAACGCATTACACCCATACAGAGAATTGAATCGTTTAGGATCCAGCGCGTTAGACCCAGGTGATTCAGCATCACAAACCGGGTTGCAGAGGGCCCAATCTAACATTACAATGTCAGTAGCCCAATTAAGCGAGCTTGTTAGGACAACGGTTCAAGAATGTATAAACAATAATTGTAATCCAAATCAGCCCAAATCTTTGAAATAA
Protein Sequence MDSQLANPPNAFNYIESHRDEYQLSHDLTEIILQFPSTAAQLTARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINATGSVIVEIHDKRMTDDESLQASWTFPIRCNIDLHFFSCSFFSLKDPIPWKLYYRVSDTNVHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFRAPTVKIHSKQFSHKDVDFSHVDYGKWERKTLRSTSMSRVGLPGPIELRPGESWASRSTVGLNQADTESELENALHPYRELNRLGSSALDPGDSASQTGLQRAQSNITMSVAQLSELVRTTVQECINNNCNPNQPKSLK

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