Merremia mosaic virus
Basic Information
| Genus |
Begomovirus
|
| NCBI Assembly |
GCF_000867165.1 |
| Isolate |
Puerto Rico |
| Release date |
2015/2/13 |
| Submitter |
Brown,J.K., Idris,A.M., Torres-Jerez,I., Banks,G.K., Wyatt,S.D., Baumann,K., Bird,J. |
| Vector |
|
| Download |
Genome
|GFF3
|PEP
|CDS |
Genomic Organization
JBrowse
Genome
ACCGGATGGCCGCCCGCCGCGCCCCCCCTGGGCCCACATATTAAAGCCGTCCAATCACAAAGCGTCCTGGAAGTCTAATTGTTTAAAATAAGCCTATAAATACATTGGAGTCCGTCTATACCCCACCAACTTTAATTTAAAATGGTTAAGAGGGACGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCACTAAAGTTAGTCGCAACGCCAATTTCTCGCCACGTGGAGGTATGGGCCCTAAGGCCGCTGCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATTTATCGCACTTTGAGAGGGCCTGATGTTCCTAAAGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTACAGTCTTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCTCATGTTGGTAAGGTAATCTGTATATCCGATGTAACTCGTGGTAACGGTATTACCCACCGTGTTGGCAAGCGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTATATTCTAGGTAAAATATGGATGGATGAGAACATAAAGCTGAAGAACCACACGAACAGCGTCATGTTTTGGTTGATTCGTGACAGGAGACCCTATGGTACCCCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCGAGTACTGCTACCGTCAAGAACGATCTTCGCGATCGATTTCAAGTCATGCATAGGTTCTATGCCAAAGTAACTGGTGGTCAGTATGCCAGTAACGAGCAGGCATTGGTTCGGCGATTTTGGAAGGTTAACAACTACGTCGTGTATAACCATCAGGAAGCAGGAAAATACGAGAATCACACGGAGAATGCTCTGTTATTGTATATGGCATCTACTCATGCTTCTAATCCTGTGTATGCTACCTTGAAAATTCGTAGTTATTTTTATGACTCCATTTCGAATTAATAAAGATTAAATTTTATTGAATGTCTTTCGAGCACACAATTTACATATGGTTTATCCGTTGCGAAACGAACAGCTCTAATGACATTGTTAAGCGAAACAACACCTAATTGATCTAAATACATTAAAACTAAATCTTTAAATCTATTTAAATATGTCGTCCCAGAAGCTTGAACTGATGTCGTCCAGATTTGGAAGTTCAGGTATGCTTTGTGTAGACTCAACGCCTTCCTCAGGTTGTAGTTGAACCGTATTTGGATGGTGTATATTCTGGTTGTGGTGTATATTGGCTCCTCCACTTGGATTATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAGATAAAAACGCCATTCATTGCTTGATGAGCAGTGATGGGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTTCTGCAGTTGATGTGTACGTAAATTGAACAGCCACAGTCCAGGTCTAACCTTCTCCGTCTAATGACAGATTTGGATCTCTTCGCTCTCCTGTGCTGTGCTTTGATAGAGGGGGGAGTTGAGGAAGATGAATTTTGCATTGTGGATCGTCCACGCTCTGAGAGATGCGTTTTCATCTTTATCGAGGAAGTCTTTATAGCTAGCCCCCTCTCCTGGATTGCACAGCACGATTGAGGGTATTCCTCCTTTAGTTTGAACTGGCTTCCCGTATTTACAGTTGGACTGCCAGTCCTTTTGGGCCCCTATCAATTCTTTCCAATGCTTTAATTTCAAATAATTAGGGCTTATGTCATCAATGACGTTATATTCGACGTCATTCGAATAGACTCTGCCATTAAAGTCAAGATGTCCACTAAGATAATTATGTTTACCTAATGAACGGGCCCACATTGTTTTTCCAGTTCGACTATCTCCTTCGATGATGATACTTATCGGTCTATCTGCCCGCGCAGCGGCACCCCTCCCAAAGTAGTTGTCTGCCCATTCTTGCATCTCATCTGGAACGTTCGTGAAGGAGGAGAGTTGAAACGGAGGAACCCATGGTTCTGGAGACTTCTGAAATATTCTTGTTGCGTTCGCAACGAGATTGTGATGTTGAAGAAAGAAGTGTTGTGGTTGTTCCTCCTTTATTATTTGCAGTGCTTCCTCTGCAGAAGCTGCGTTTAACGCCTTTGCGTATGTATCGTTAGAAGACTGCTGACCTCCTCTAGCAGATCTTCCGTCGATCTGGAATTGTCCCCATTCAATTGTATCTCCGTCCTTGTCGATGTAGGACTTGACATCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGATACCAAATCGAAGAATCTGTTATTCGTGCAGTTGTATTTTCCTTCGAACTGGATAAGCACATGAAGATGAGGTTCCCCATTATCGTGAAGCTCTCTACAGATCTTGATGAATTTTTTGTTTACAGGGGTGTGCAGAGCTTTGATTTGGGACAGTGCTTCTTCTTTGGCTAATGAACATATAGGGTATGTGAGGAAATAGTTTTTGGCTTTTATTGAGAATGAACCCTTCCGTGGCATTTTTGTAATAAGGGATGTTCCCCCAATTGCTCCGCTCTCAAAACTCTATATGAATCGGGGGAACTGGGGGTACATTTATACTAGAACTCTCATTAAAGGGATTTGCAACACGTGGCGGCCATCCGCTATAATATT
ACCGGATGGCCGCCCGCCGCGCCCCCCCTGGCCCCACATGGTGCCCACCAGCTGTGATGCACTTTGTAAAGGTAATACGTGGAACGCTCGTATGCATTCATTTGAACTAACTGTTAACTTTCTTCTTTAATTTGAATTATTGTCGCGCTACTATGAAAGGTTGGGTCATACTTACAATGATTAAATTGTTTAACGTAATGTACGATTTGGAGACGTGGACCAGTTATAACCATTATACATCGTCAAATTAGTTTGCCGTCTCTTTAAGATCTATATATATATATGCTTGAACGTGGAGTTATGTAAACATATATTTTATTAATATCTATTACTAGAATATGTATTCTTTTAGATATAGACCGTATCATTTTAATTATCGGAAACGATTTTACACACGTACGCAAGTGTCTAAACGGGTAGCCCCGTTTAAACGAGCTGATGTGAAATGTCGAACGAGGCAGACGACTATCGTTCATGATGAGACTAAGATGTCTTCGCAGCGCATTCATGAGAACCAATTTGGTCCAGAGTTTGTGATGACACATAACTCCGCCATATCCACTTTCATTAATTATCCTACTTTGAGTAAGACCGAGCCTAACAGAAGCAGATCTTACATTAAGTTGAAACGCTTGCGGTTTAAGGGTACTGTTAAAATTGAGCGTGTGTATGCGGATATGAACATGGATGGTTTGAACCCTAAAGTTGAAGGGGTATTCACTCTTGCTGTTGTAGTTGACCGAAAACCTCATTTAAAGCCATCTGGATGTCTGCATACATTTGATGAGGTATTTGGTGCACGGATTCACAGTCATGGTACGTTAGCCATTACTCCGTCACTGACAGATCGTTACTACATTCGCCATGTGTTTAAACGTGTAATGTCTGTTGAGAAGGATACTGCCATGGTTGATGTGGAAGGATCGATGTCTCTCTCTAATAAGCGTTTTAATTGTTGGGCTACGTTTAAGGATCTTGATCATGAATCTTGTAAGGGTGTTTATGACAATATTAGCAAAAACGCCTTGTTAATTTATTATTGTTGGATGTCTGATGTACCATCTAAGGCATCGTCATTTGTATCATTTGATTTGGATTATGTTGGCTAAATAAAAATATGTAATTTCTGTTTTAAATAAATAACTGTGTATTGAACAATAAATTCTATTTTAACGATTTCGGCTGAGCCGGTGTACAATTACTATTAATACACTCATGGACCGTTGATCGTACAAGATCATTTAATTGGGCCATTGACATTGTTATATTGGATTGGGCCCTTGAAGCCCCTACGATTGAAGCAGAATCACCTGGATCCAACGCACTGGTTCCCAGACGATTGAGTTGCCTGTATGGGTGTATTGCATTTTCCAGTTCCGAATCTGTGTCCGTTTGGCCTATACCGATTGTGCTTCTTGAGGCCCATGACTCGCCTGGTAATAATTCTATTGGGCTTGGTAGCCCAATTCTTGCCATTGAGATTGACCGGATCATTTTTCTTTCCCATCTCCCGTAGCCCACATGTGAGAAATCGACATCCTTCTCGGAAAATTGCTTAGACAGGATCTTCACCGCCGGAGCTCTGAATGGGATATCTACAGAATGTTTCGCTGTCGACAGTTTTAGTTTCCCTTTGAACTTGGCGAAATGTGTTCGTTGGTGTATGTTTGAATCACAGACTCTGTAGTATAGTTTCCACGGGATTGGGTCTTTCAGTGAGAAGAAAGACGAGGAAAAGTAATGAAGGTCTATGTTGCATCTGATTGGGAACGTCCATGATGCTTGTAATGATTCGTTATCCGTCATCCTTCTGTCGTGGATCTCCACAATTACAGTACCTATTGCGTTTATCGGTACCTGTTGCCTGTATTCTATGACGCAGTGATCTATTTTCATACAACTGCGACTTAATCTTGCTGATAATTGAGCCGCTGCTGACGGAAAGTGCAGTATTATCTCAGTTAAATCATGAGATAGCTGATATTCGTCTCTGTGAGATTCTATATAATTAAAGGCACTTGGAGGATTAACCAATTGAGCATCCATATAGCAAAATTAGCCCGCGCAGCGGAATGGATCTAACTGAGAGACGTCGTGGTGATTAATATAGGATGTTTTCTTGAAGAAAAGAAGATGATATTTGGGAGAGTAGATCTGGATGTTTGTGAGGTTTTTGTTGTGAAGAAGTATATGTGGTTCTGTCTATATATAGACTTTATTAATGTATTGGAAATAAACTAATAACAATTGCTTCATTGACACGTTTATGGTTGTACTATGTCTCTTACTGTTGCTAAAGAAGTTTAAGATCTATACTGGAAGCACTTAGTGGCATTTGTGTAATAAGGGATGTTCCCCCAATTGCTAAGGGGTGTTCCCCCAATTGCTCCGCTCTCAAAACTCTCTATGAATTGGGGGAACTGGGGGTACATTTATACTAGAACTCTCATTAAAGGGATTTGCAACACGTGGCGGCCATCCGCTATAATATT
Gene Information
|
NCBI Accession
|
YP_579167.1
|
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Location
|
142-888 |
|
Gene Name
|
AV1 |
|
Protein Name
|
coat protein |
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Coding Region
|
ATGGTTAAGAGGGACGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCACTAAAGTTAGTCGCAACGCCAATTTCTCGCCACGTGGAGGTATGGGCCCTAAGGCCGCTGCTTGGGTTAACAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATTTATCGCACTTTGAGAGGGCCTGATGTTCCTAAAGGTTGTGAAGGCCCATGTAAGGTACAGTCTTTCGAGCAGCGTCATGATATTTCTCATGTTGGTAAGGTAATCTGTATATCCGATGTAACTCGTGGTAACGGTATTACCCACCGTGTTGGCAAGCGTTTTTGTGTGAAGTCTGTGTATATTCTAGGTAAAATATGGATGGATGAGAACATAAAGCTGAAGAACCACACGAACAGCGTCATGTTTTGGTTGATTCGTGACAGGAGACCCTATGGTACCCCTATGGATTTTGGTCAGGTGTTTAACATGTATGACAATGAGCCGAGTACTGCTACCGTCAAGAACGATCTTCGCGATCGATTTCAAGTCATGCATAGGTTCTATGCCAAAGTAACTGGTGGTCAGTATGCCAGTAACGAGCAGGCATTGGTTCGGCGATTTTGGAAGGTTAACAACTACGTCGTGTATAACCATCAGGAAGCAGGAAAATACGAGAATCACACGGAGAATGCTCTGTTATTGTATATGGCATCTACTCATGCTTCTAATCCTGTGTATGCTACCTTGAAAATTCGTAGTTATTTTTATGACTCCATTTCGAATTAA |
|
Protein Sequence
|
MVKRDAPWRLMAGTTKVSRNANFSPRGGMGPKAAAWVNRPMYRKPRIYRTLRGPDVPKGCEGPCKVQSFEQRHDISHVGKVICISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLIRDRRPYGTPMDFGQVFNMYDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHRFYAKVTGGQYASNEQALVRRFWKVNNYVVYNHQEAGKYENHTENALLLYMASTHASNPVYATLKIRSYFYDSISN |
|
NCBI Accession
|
YP_579168.1
|
|
Location
|
885-1283 |
|
Gene Name
|
AC3 |
|
Protein Name
|
AC3 |
|
Coding Region
|
ATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCTCATCAAGCAATGAATGGCGTTTTTATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATAATCCAAGTGGAGGAGCCAATATACACCACAACCAGAATATACACCATCCAAATACGGTTCAACTACAACCTGAGGAAGGCGTTGAGTCTACACAAAGCATACCTGAACTTCCAAATCTGGACGACATCAGTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAGATTTAAAGATTTAGTTTTAATGTATTTAGATCAATTAGGTGTTGTTTCGCTTAACAATGTCATTAGAGCTGTTCGTTTCGCAACGGATAAACCATATGTAAATTGTGTGCTCGAAAGACATTCAATAAAATTTAATCTTTATTAA |
|
Protein Sequence
|
MDSRTGEPITAHQAMNGVFIWEVPNPLYFKIIQVEEPIYTTTRIYTIQIRFNYNLRKALSLHKAYLNFQIWTTSVQASGTTYLNRFKDLVLMYLDQLGVVSLNNVIRAVRFATDKPYVNCVLERHSIKFNLY |
|
NCBI Accession
|
YP_579169.1
|
|
Location
|
1030-1461 |
|
Gene Name
|
AC2 |
|
Protein Name
|
AC2 |
|
Coding Region
|
ATGAAAACGCATCTCTCAGAGCGTGGACGATCCACAATGCAAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGAGAGCGAAGAGATCCAAATCTGTCATTAGACGGAGAAGGTTAGACCTGGACTGTGGCTGTTCAATTTACGTACACATCAACTGCAGAAACCATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCTCATCAAGCAATGAATGGCGTTTTTATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATAATCCAAGTGGAGGAGCCAATATACACCACAACCAGAATATACACCATCCAAATACGGTTCAACTACAACCTGAGGAAGGCGTTGAGTCTACACAAAGCATACCTGAACTTCCAAATCTGGACGACATCAGTTCAAGCTTCTGGGACGACATATTTAAATAG |
|
Protein Sequence
|
MKTHLSERGRSTMQNSSSSTPPSIKAQHRRAKRSKSVIRRRRLDLDCGCSIYVHINCRNHGFTHRGTHHCSSSNEWRFYLGGSKSPLFQDNPSGGANIHHNQNIHHPNTVQLQPEEGVESTQSIPELPNLDDISSSFWDDIFK |
|
NCBI Accession
|
YP_579170.1
|
|
Location
|
1346-2422 |
|
Gene Name
|
AC1 |
|
Protein Name
|
AC1 |
|
Coding Region
|
ATGCCACGGAAGGGTTCATTCTCAATAAAAGCCAAAAACTATTTCCTCACATACCCTATATGTTCATTAGCCAAAGAAGAAGCACTGTCCCAAATCAAAGCTCTGCACACCCCTGTAAACAAAAAATTCATCAAGATCTGTAGAGAGCTTCACGATAATGGGGAACCTCATCTTCATGTGCTTATCCAGTTCGAAGGAAAATACAACTGCACGAATAACAGATTCTTCGATTTGGTATCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATTCAGGGAGCTAAATCCAGCTCCGATGTCAAGTCCTACATCGACAAGGACGGAGATACAATTGAATGGGGACAATTCCAGATCGACGGAAGATCTGCTAGAGGAGGTCAGCAGTCTTCTAACGATACATACGCAAAGGCGTTAAACGCAGCTTCTGCAGAGGAAGCACTGCAAATAATAAAGGAGGAACAACCACAACACTTCTTTCTTCAACATCACAATCTCGTTGCGAACGCAACAAGAATATTTCAGAAGTCTCCAGAACCATGGGTTCCTCCGTTTCAACTCTCCTCCTTCACGAACGTTCCAGATGAGATGCAAGAATGGGCAGACAACTACTTTGGGAGGGGTGCCGCTGCGCGGGCAGATAGACCGATAAGTATCATCATCGAAGGAGATAGTCGAACTGGAAAAACAATGTGGGCCCGTTCATTAGGTAAACATAATTATCTTAGTGGACATCTTGACTTTAATGGCAGAGTCTATTCGAATGACGTCGAATATAACGTCATTGATGACATAAGCCCTAATTATTTGAAATTAAAGCATTGGAAAGAATTGATAGGGGCCCAAAAGGACTGGCAGTCCAACTGTAAATACGGGAAGCCAGTTCAAACTAAAGGAGGAATACCCTCAATCGTGCTGTGCAATCCAGGAGAGGGGGCTAGCTATAAAGACTTCCTCGATAAAGATGAAAACGCATCTCTCAGAGCGTGGACGATCCACAATGCAAAATTCATCTTCCTCAACTCCCCCCTCTATCAAAGCACAGCACAGGAGAGCGAAGAGATCCAAATCTGTCATTAG |
|
Protein Sequence
|
MPRKGSFSIKAKNYFLTYPICSLAKEEALSQIKALHTPVNKKFIKICRELHDNGEPHLHVLIQFEGKYNCTNNRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTIEWGQFQIDGRSARGGQQSSNDTYAKALNAASAEEALQIIKEEQPQHFFLQHHNLVANATRIFQKSPEPWVPPFQLSSFTNVPDEMQEWADNYFGRGAAARADRPISIIIEGDSRTGKTMWARSLGKHNYLSGHLDFNGRVYSNDVEYNVIDDISPNYLKLKHWKELIGAQKDWQSNCKYGKPVQTKGGIPSIVLCNPGEGASYKDFLDKDENASLRAWTIHNAKFIFLNSPLYQSTAQESEEIQICH |
|
NCBI Accession
|
YP_579171.1
|
|
Location
|
339-1109 |
|
Protein Name
|
BV1 protein |
|
Coding Region
|
ATGTATTCTTTTAGATATAGACCGTATCATTTTAATTATCGGAAACGATTTTACACACGTACGCAAGTGTCTAAACGGGTAGCCCCGTTTAAACGAGCTGATGTGAAATGTCGAACGAGGCAGACGACTATCGTTCATGATGAGACTAAGATGTCTTCGCAGCGCATTCATGAGAACCAATTTGGTCCAGAGTTTGTGATGACACATAACTCCGCCATATCCACTTTCATTAATTATCCTACTTTGAGTAAGACCGAGCCTAACAGAAGCAGATCTTACATTAAGTTGAAACGCTTGCGGTTTAAGGGTACTGTTAAAATTGAGCGTGTGTATGCGGATATGAACATGGATGGTTTGAACCCTAAAGTTGAAGGGGTATTCACTCTTGCTGTTGTAGTTGACCGAAAACCTCATTTAAAGCCATCTGGATGTCTGCATACATTTGATGAGGTATTTGGTGCACGGATTCACAGTCATGGTACGTTAGCCATTACTCCGTCACTGACAGATCGTTACTACATTCGCCATGTGTTTAAACGTGTAATGTCTGTTGAGAAGGATACTGCCATGGTTGATGTGGAAGGATCGATGTCTCTCTCTAATAAGCGTTTTAATTGTTGGGCTACGTTTAAGGATCTTGATCATGAATCTTGTAAGGGTGTTTATGACAATATTAGCAAAAACGCCTTGTTAATTTATTATTGTTGGATGTCTGATGTACCATCTAAGGCATCGTCATTTGTATCATTTGATTTGGATTATGTTGGCTAA |
|
Protein Sequence
|
MYSFRYRPYHFNYRKRFYTRTQVSKRVAPFKRADVKCRTRQTTIVHDETKMSSQRIHENQFGPEFVMTHNSAISTFINYPTLSKTEPNRSRSYIKLKRLRFKGTVKIERVYADMNMDGLNPKVEGVFTLAVVVDRKPHLKPSGCLHTFDEVFGARIHSHGTLAITPSLTDRYYIRHVFKRVMSVEKDTAMVDVEGSMSLSNKRFNCWATFKDLDHESCKGVYDNISKNALLIYYCWMSDVPSKASSFVSFDLDYVG |
|
NCBI Accession
|
YP_579172.1
|
|
Location
|
1165-2046 |
|
Protein Name
|
BC1 protein |
|
Coding Region
|
ATGGATGCTCAATTGGTTAATCCTCCAAGTGCCTTTAATTATATAGAATCTCACAGAGACGAATATCAGCTATCTCATGATTTAACTGAGATAATACTGCACTTTCCGTCAGCAGCGGCTCAATTATCAGCAAGATTAAGTCGCAGTTGTATGAAAATAGATCACTGCGTCATAGAATACAGGCAACAGGTACCGATAAACGCAATAGGTACTGTAATTGTGGAGATCCACGACAGAAGGATGACGGATAACGAATCATTACAAGCATCATGGACGTTCCCAATCAGATGCAACATAGACCTTCATTACTTTTCCTCGTCTTTCTTCTCACTGAAAGACCCAATCCCGTGGAAACTATACTACAGAGTCTGTGATTCAAACATACACCAACGAACACATTTCGCCAAGTTCAAAGGGAAACTAAAACTGTCGACAGCGAAACATTCTGTAGATATCCCATTCAGAGCTCCGGCGGTGAAGATCCTGTCTAAGCAATTTTCCGAGAAGGATGTCGATTTCTCACATGTGGGCTACGGGAGATGGGAAAGAAAAATGATCCGGTCAATCTCAATGGCAAGAATTGGGCTACCAAGCCCAATAGAATTATTACCAGGCGAGTCATGGGCCTCAAGAAGCACAATCGGTATAGGCCAAACGGACACAGATTCGGAACTGGAAAATGCAATACACCCATACAGGCAACTCAATCGTCTGGGAACCAGTGCGTTGGATCCAGGTGATTCTGCTTCAATCGTAGGGGCTTCAAGGGCCCAATCCAATATAACAATGTCAATGGCCCAATTAAATGATCTTGTACGATCAACGGTCCATGAGTGTATTAATAGTAATTGTACACCGGCTCAGCCGAAATCGTTAAAATAG |
|
Protein Sequence
|
MDAQLVNPPSAFNYIESHRDEYQLSHDLTEIILHFPSAAAQLSARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINAIGTVIVEIHDRRMTDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVCDSNIHQRTHFAKFKGKLKLSTAKHSVDIPFRAPAVKILSKQFSEKDVDFSHVGYGRWERKMIRSISMARIGLPSPIELLPGESWASRSTIGIGQTDTDSELENAIHPYRQLNRLGTSALDPGDSASIVGASRAQSNITMSMAQLNDLVRSTVHECINSNCTPAQPKSLK |