Merremia mosaic Puerto Rico virus

Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_000892695.1
Isolate Puerto Rico
Release date 2015/2/22
Submitter Idris,A.M., Brown,J.K.
Host
Vector
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Genomic Organization

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Genome

NC_015490
ACCGGATGGCCGACCGCTGCCCTTGGTGTCCCTCTCTCTCCCACGTGGTGCTTTAGTTTGAATTAAAGATATGTTTTATGCTTTGTCCAATCAGATTTGGTCTGGCGAGTCTAGGTATTCGTGTTCAAACTTAGTGACCAAGTATTACCGCATATAAGTACGAGTTATCTTATGTGGAGCCAGACATCTTTAATTCAAAATGCCTAAGCGGGATGCCCCGTGGCGTTCTATGGCGGGAACCTCCAAGGTTAGTCGAAACGCCAATTATTCTCCTGGTGGATCATCTGGCCCAAAATCCAACAGGGCCAATACTTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTATAGGACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGCCCATGTAAGGTGCAATCCTTTGAGCAACGCCATGATATCTCACATGTTGGCAAGGTGATGTGTATATCCGACGTGACACGTGGGAACGGTATAACTCACCGTGTTGGTAAGCGTTTTTGTGTTAAGTCCGTGTACATACTAGGCAAGATATGGATGGACGAGAACATCAAGTTGAAGAACCACACCAATAGTGTTATGTTTTGGTTAGTTAGGGATAGGAGACCATATGGCACTCCCATGGATTTTGGGCAAGTGTTTAATATGTTTGACAATGAGCCTAGTACTGCTACGGTCAAGAATGATCTCCGTGATCGTTTTCAAGTCATGCACAAATTTTATGCCAAGGTTACAGGTGGACAATATGCTAGTAATGAGCAGGCGATTGTTAAGCGTTTCTGGAAGGTGAACAGTCATGTTGTTTATAACCACCAGGAAGCCGCTAAGTACGAAAATCATACGGAGAATGCTCTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTGTATGCTACTTTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAATGAATTAATAAAATTTGAATTTTATTTCATGTTGTTCAAGTACATCATTTACATATTGTCTGTCCGTTGCATATGAGACAGCTCTAATTACATTATTAACTGAAATAACCCCTAAATTGTCTAAGAATTTCATAACAAGAAATTTGAATCTACTTAAATAAATCTGCCCAGAAGCTGTCGTCAAAGTCGTCCAGACTTGGAAATTGAAGTAGGCTTTGTGGAGATCCAACGCTTTCCTGAGGTTGTGGTTGGCGCGAATTTGTATGTGGAACACTCTGCTGTGGGTGAACATTGGACGGTCCACCCTGATTATTTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACCTCCCAGATAAAAACGCCACTCGTTGCTTGAGCTGCAGTGATGGGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTGCTGCAGTTAATGTGTAGGTAATATGAACAACCGCACTGCAGATCAATTCTTTTACGTCTCGTCTGCCTCTTTGCGAATCTATGACGAGGTTTGATTGACGGTGGAGTAGAGTGGTTCCTCAATGGTGACGAAGACGGCGTTTTTCTTTGCCCAGTCATTGAGTGTTTTGTTTTTTTCCTCTCCGAGATACTCCTTATATGATGAATGGGGGCCAGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATTCCACCTTTAATTTGAATTGGCTTTCCGTATTTGCAGTTTGATGGCCAATCCCTCTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTGAGATAATGCGGATCTACGTCATCGATGACGTTATACCATGCATCATTGGAGTATATCCTCGGGTTGAGATCTATATGTCCACATAGATAATTGTGAGGGCCCAGGCTACGGGCCCATATTGTTTTGCCCGTTCTTGATGGTCCTTCAACAATGATTGATATAGGTCTCAACGGCCGCGCAGCGGCATCGGAAATATTATCGTCGACCCACTTCATCATTATTTCCGGTACATTAATGAACGTGGACATTTGAAATGGAGGAACCCATGGTTCCGGAGGTTTATGGAATATTTTCGTTATATTTGAAACCAGATTGTGATATTGGAGGACGAAATGTTGTGGTTGTTGTTCCTTAATGATCTGCATCGCCTCTTCTGCAGAAGATGAATTCAACGCCGTCGCATATGTGTCGTTAGCAGATTGCTGACCTCCTCTAGCAGATCTGCCGTCGATTTGAAATTGTCCCCATTCGATTGTATCTCCGTCTTTGTCGATGTAGGACTTGACGTCGGAGCTAGACTTAGCTCCCTGTATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGAAACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTCTTGCACTGGTATTTCCCTTCGAACTGGATGAGCACGTGAAGATGAGGTTCCCCATTTTCGTGGAGTTCTCTGCATATTTTGATGAACTTCTTGTTGACAGGAGTGTTTAGGTTTTGTAATTGGGAAAGTGCCTCTTCTTTGGTTAGAGAGCACTTGGGGTATGTAATGAAATAATTCTTGGCATTTATTCTAAAACGCTGAACTGATGGCATTCTCGTAATAAAAAGGCTGGACACCAATTGAATGTACGGAGAGACACCAATTGAGCTCTTCAACTCCCCCCCCTTGTATTGGTGTCTGGGGTCTTATTTATAGTATACCTTCTATTCTTTAATTTTTTGACACGTGGAGGCCATCCGTTATAATATT
NC_015491
ACCGGATGGCCGACCGCTGCCCTTGGTGTCCCTCTCTCTCCCACGTGACGCTTGGTGTGGTGCGCTCTCTCTCTTCTGACGTGGAGGATTTGTAAACCGTTCGATAAAGCTTATCGCGCTATGAGATTTGAAATTTGAATTATATGCACGGCTTTCTATGTATTAGGTAGCATATGAAGCGATAAGGTTTTCTGACACATTGTACTATGCCTAAGACGTGGCCCAATTAAATATTATCTGGCGAGTTATGTTAACTCTATTTTGAATCACTTATTCTATATATAACTAGTGGATATGAATATTTAATATCGTCTATTGACATTATAACTCCTTAAATTTTTGTATAAGAGATTTTTTAATATGTATTTGCTAAGATATAGACGTGGAACATCTTACTCACAACGACGATATAATACAGGTAATAATGTGTTTAAACGTGTATCATATGTTAAACGTAAGGATGGTAAGCGTCGATCGAGTCATGGAAATAATGTTCATGAAGATGGGAAGATGACGTCTCAACGCATACATGAAAATCAGTATGGGCCTGAATTTGTGATGTCTCAAAATTCAGCGTTATCCACATTCATTACTTTTCCTCATTTGGGGAAGACTCAACCTAATCGGTGCAGGTCATATATTAAGCTGAAACGGCTTCGTTTTAAAGGAACTGTTAAGATTGAACGTGTTCATGCGGATTTGAACATGGATGGTTTGCTCCCTAAGATTGAAGGTGTATTTTCCCTTGTAATTGTGGTGGATCGCAAACCCCATTTGAATGCTTCTGGATGTTTGCACTCATTTGACGAATTATTTGGTGCAAGGATCAACAGCCACGGGAATTTAGCTATTATCTCAGCTTTGAAAGATCGTTTTTATGTTCGTCATGTATTGAAACGTGTGTTGTCCGTGGAGAAAGACAGTACGATGATGGACCTGGAAGGATCGATCTTTTTTTCTAATAGGCGTTTTAATTGTTGGTCAAGTTTTAAAGATAATGACCATGATTCATGTAATGGTGTTTATGACAATATTAGCAAAAACGCCATATTAGTTTATTATTGTTGGATGTCGGATGTAATGTCTAAGGCATCAACATTTGTATCGTTCGACCTTGATTATGTTGGGTGAATAATAATAAATTGTAATGAGAAATAAAAATATAACTTTTATTTCAAAGATTTAGGCGGATTGGAATTACAGTTTGTGTTTATACATTCATGGACCGTTGTCCTAACTAACTCGTTTAATTGGGCCATTGACATTGTAATGTTTGATTGGGCCCGTTGTAACCCGGCTTGTGATGCTGAATCTCCTGGGTCTAGGACGCTTGCTCCCAAACGATTTAGTTCTTTATAGGGGTGTAACGCGTTGTCCAACTCTGAATCAGTATCTGTGTGGGCTAGCCCAATTGTACTCTTTGAAGCCCACGATTCACCTGGTCTTAATTCAATTGGGCCGGGTAACCCAACTCTTGATATTGATGTGGACCTCAACGTTTTCCGTTCCCATCGTCCGTAGTCCACATGTGTAAAATCCACATCTTTATGCGAGAATTGTTTGGATAGTATTTTGACCGTCGGTGCCCGGAATGGGATATCCACCGAATGTTTCGCCGTGGACAACTTCCATTTTCCCTTGAACTTGGCAAAATGCGTTCTGTGGTGGACATTTGTGTCGCTAACCCTGTAATACAGCTTCCATGGAATTGGGTCTTTTAGCGAGAAAAAGGACGATGAAAAATAGTGGAGATCTATGTTGCATCTAATTGGAAATGTCCATGACGCTTGTAAGGATTCGTTGTCAATCATCCTTTTGTCATGGATCTCCACAATAACTGTACCAGTTGCGTTTATGGGTACTTGTTGCCTGTACTCGATGACACAATGGTCTATTTTCATGCAGCTACGACTAAGTCTAGCTGTTAATTGAGATGCAGTTGAAGGAAATTGAAGGACTATCTCAGTTAGATCATGAGACAGCTGATATTCATCCCTATTGGATTCTATGTAATTAAAGGCATTTGGAGGATTTGCTAACTGAGAATCCATATATGAATAATTGGCCGCGCAGCGGAACTGTTTGAGTAATCTTATAGACTAACAAGGTTTATGGGTAAGAACAGATAGAACAAGACGAATAGTATATGACGGATGATGAATATGAGCAGGTTAAAGAAGATTATTGTGTTATGAAGGGCGAAGAGAATGAAGAGTAAAGGATGTTATTCTGGATAATTGTGTATATGATCCCTAACTGTGTTTCTGGAAATAAAATTAAAAGCTAAACTAATGAATATGAGCTAATGATAGAGAAATTAGCTATTTGTGAAGAAATTGATGCTGTGAGTTTTGTTATATGCCGTCGTGTTTATATAGACACTCATGTGTCTGTGTGTGTTATGAAGCGAGAGCGTTTCTTGTGGTATTTTCGTAATAAGAAGGCTGGACACCAATTGAATGTACGGAGAGACACCAATTGAGCTCTTCAACTCCCCCCCCTTGTATTGGTGTCTGGGGTCTTATTTATAGTATACCTTCTATTCTTTAATTTTTGGACACGTGGAGGCCATCCGCTATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_004429242.1
Location 200-955
Protein Name coat protein
Coding Region ATGCCTAAGCGGGATGCCCCGTGGCGTTCTATGGCGGGAACCTCCAAGGTTAGTCGAAACGCCAATTATTCTCCTGGTGGATCATCTGGCCCAAAATCCAACAGGGCCAATACTTGGGTTAATAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGGATATATCGGATGTATAGGACCCCCGATGTTCCAAGAGGCTGTGAAGGCCCATGTAAGGTGCAATCCTTTGAGCAACGCCATGATATCTCACATGTTGGCAAGGTGATGTGTATATCCGACGTGACACGTGGGAACGGTATAACTCACCGTGTTGGTAAGCGTTTTTGTGTTAAGTCCGTGTACATACTAGGCAAGATATGGATGGACGAGAACATCAAGTTGAAGAACCACACCAATAGTGTTATGTTTTGGTTAGTTAGGGATAGGAGACCATATGGCACTCCCATGGATTTTGGGCAAGTGTTTAATATGTTTGACAATGAGCCTAGTACTGCTACGGTCAAGAATGATCTCCGTGATCGTTTTCAAGTCATGCACAAATTTTATGCCAAGGTTACAGGTGGACAATATGCTAGTAATGAGCAGGCGATTGTTAAGCGTTTCTGGAAGGTGAACAGTCATGTTGTTTATAACCACCAGGAAGCCGCTAAGTACGAAAATCATACGGAGAATGCTCTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTGTATGCTACTTTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAATGAATTAA
Protein Sequence MPKRDAPWRSMAGTSKVSRNANYSPGGSSGPKSNRANTWVNRPMYRKPRIYRMYRTPDVPRGCEGPCKVQSFEQRHDISHVGKVMCISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRFQVMHKFYAKVTGGQYASNEQAIVKRFWKVNSHVVYNHQEAAKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSIMN

NCBI Accession YP_004429243.1
Location 952-1350
Protein Name REn
Coding Region ATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCAGCTCAAGCAACGAGTGGCGTTTTTATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAAATAATCAGGGTGGACCGTCCAATGTTCACCCACAGCAGAGTGTTCCACATACAAATTCGCGCCAACCACAACCTCAGGAAAGCGTTGGATCTCCACAAAGCCTACTTCAATTTCCAAGTCTGGACGACTTTGACGACAGCTTCTGGGCAGATTTATTTAAGTAGATTCAAATTTCTTGTTATGAAATTCTTAGACAATTTAGGGGTTATTTCAGTTAATAATGTAATTAGAGCTGTCTCATATGCAACGGACAGACAATATGTAAATGATGTACTTGAACAACATGAAATAAAATTCAAATTTTATTAA
Protein Sequence MDSRTGEPITAAQATSGVFIWEVPNPLYFKIIRVDRPMFTHSRVFHIQIRANHNLRKALDLHKAYFNFQVWTTLTTASGQIYLSRFKFLVMKFLDNLGVISVNNVIRAVSYATDRQYVNDVLEQHEIKFKFY

NCBI Accession YP_004429244.1
Location 1097-1513
Protein Name TrAP
Coding Region ATGACTGGGCAAAGAAAAACGCCGTCTTCGTCACCATTGAGGAACCACTCTACTCCACCGTCAATCAAACCTCGTCATAGATTCGCAAAGAGGCAGACGAGACGTAAAAGAATTGATCTGCAGTGCGGTTGTTCATATTACCTACACATTAACTGCAGCAACCATGGATTCACGCACAGGGGAACCCATCACTGCAGCTCAAGCAACGAGTGGCGTTTTTATCTGGGAGGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAAATAATCAGGGTGGACCGTCCAATGTTCACCCACAGCAGAGTGTTCCACATACAAATTCGCGCCAACCACAACCTCAGGAAAGCGTTGGATCTCCACAAAGCCTACTTCAATTTCCAAGTCTGGACGACTTTGACGACAGCTTCTGGGCAGATTTATTTAAGTAG
Protein Sequence MTGQRKTPSSSPLRNHSTPPSIKPRHRFAKRQTRRKRIDLQCGCSYYLHINCSNHGFTHRGTHHCSSSNEWRFYLGGSKSPLFQNNQGGPSNVHPQQSVPHTNSRQPQPQESVGSPQSLLQFPSLDDFDDSFWADLFK

NCBI Accession YP_004429245.1
Location 1434-2483
Protein Name Rep
Coding Region ATGCCATCAGTTCAGCGTTTTAGAATAAATGCCAAGAATTATTTCATTACATACCCCAAGTGCTCTCTAACCAAAGAAGAGGCACTTTCCCAATTACAAAACCTAAACACTCCTGTCAACAAGAAGTTCATCAAAATATGCAGAGAACTCCACGAAAATGGGGAACCTCATCTTCACGTGCTCATCCAGTTCGAAGGGAAATACCAGTGCAAGAATAACAGATTCTTCGACTTGGTTTCCCCAACCAGGTCAGCACATTTCCATCCGAACATACAGGGAGCTAAGTCTAGCTCCGACGTCAAGTCCTACATCGACAAAGACGGAGATACAATCGAATGGGGACAATTTCAAATCGACGGCAGATCTGCTAGAGGAGGTCAGCAATCTGCTAACGACACATATGCGACGGCGTTGAATTCATCTTCTGCAGAAGAGGCGATGCAGATCATTAAGGAACAACAACCACAACATTTCGTCCTCCAATATCACAATCTGGTTTCAAATATAACGAAAATATTCCATAAACCTCCGGAACCATGGGTTCCTCCATTTCAAATGTCCACGTTCATTAATGTACCGGAAATAATGATGAAGTGGGTCGACGATAATATTTCCGATGCCGCTGCGCGGCCGTTGAGACCTATATCAATCATTGTTGAAGGACCATCAAGAACGGGCAAAACAATATGGGCCCGTAGCCTGGGCCCTCACAATTATCTATGTGGACATATAGATCTCAACCCGAGGATATACTCCAATGATGCATGGTATAACGTCATCGATGACGTAGATCCGCATTATCTCAAGCACTTTAAAGAATTCATGGGGGCCCAGAGGGATTGGCCATCAAACTGCAAATACGGAAAGCCAATTCAAATTAAAGGTGGAATTCCCACTATCTTCCTCTGCAATCCTGGCCCCCATTCATCATATAAGGAGTATCTCGGAGAGGAAAAAAACAAAACACTCAATGACTGGGCAAAGAAAAACGCCGTCTTCGTCACCATTGAGGAACCACTCTACTCCACCGTCAATCAAACCTCGTCATAG
Protein Sequence MPSVQRFRINAKNYFITYPKCSLTKEEALSQLQNLNTPVNKKFIKICRELHENGEPHLHVLIQFEGKYQCKNNRFFDLVSPTRSAHFHPNIQGAKSSSDVKSYIDKDGDTIEWGQFQIDGRSARGGQQSANDTYATALNSSSAEEAMQIIKEQQPQHFVLQYHNLVSNITKIFHKPPEPWVPPFQMSTFINVPEIMMKWVDDNISDAAARPLRPISIIVEGPSRTGKTIWARSLGPHNYLCGHIDLNPRIYSNDAWYNVIDDVDPHYLKHFKEFMGAQRDWPSNCKYGKPIQIKGGIPTIFLCNPGPHSSYKEYLGEEKNKTLNDWAKKNAVFVTIEEPLYSTVNQTSS

NCBI Accession YP_004429246.1
Location 361-1131
Protein Name movement protein
Coding Region ATGTATTTGCTAAGATATAGACGTGGAACATCTTACTCACAACGACGATATAATACAGGTAATAATGTGTTTAAACGTGTATCATATGTTAAACGTAAGGATGGTAAGCGTCGATCGAGTCATGGAAATAATGTTCATGAAGATGGGAAGATGACGTCTCAACGCATACATGAAAATCAGTATGGGCCTGAATTTGTGATGTCTCAAAATTCAGCGTTATCCACATTCATTACTTTTCCTCATTTGGGGAAGACTCAACCTAATCGGTGCAGGTCATATATTAAGCTGAAACGGCTTCGTTTTAAAGGAACTGTTAAGATTGAACGTGTTCATGCGGATTTGAACATGGATGGTTTGCTCCCTAAGATTGAAGGTGTATTTTCCCTTGTAATTGTGGTGGATCGCAAACCCCATTTGAATGCTTCTGGATGTTTGCACTCATTTGACGAATTATTTGGTGCAAGGATCAACAGCCACGGGAATTTAGCTATTATCTCAGCTTTGAAAGATCGTTTTTATGTTCGTCATGTATTGAAACGTGTGTTGTCCGTGGAGAAAGACAGTACGATGATGGACCTGGAAGGATCGATCTTTTTTTCTAATAGGCGTTTTAATTGTTGGTCAAGTTTTAAAGATAATGACCATGATTCATGTAATGGTGTTTATGACAATATTAGCAAAAACGCCATATTAGTTTATTATTGTTGGATGTCGGATGTAATGTCTAAGGCATCAACATTTGTATCGTTCGACCTTGATTATGTTGGGTGA
Protein Sequence MYLLRYRRGTSYSQRRYNTGNNVFKRVSYVKRKDGKRRSSHGNNVHEDGKMTSQRIHENQYGPEFVMSQNSALSTFITFPHLGKTQPNRCRSYIKLKRLRFKGTVKIERVHADLNMDGLLPKIEGVFSLVIVVDRKPHLNASGCLHSFDELFGARINSHGNLAIISALKDRFYVRHVLKRVLSVEKDSTMMDLEGSIFFSNRRFNCWSSFKDNDHDSCNGVYDNISKNAILVYYCWMSDVMSKASTFVSFDLDYVG

NCBI Accession YP_004429247.1
Location 1170-2051
Protein Name nuclear shuttle protein
Coding Region ATGGATTCTCAGTTAGCAAATCCTCCAAATGCCTTTAATTACATAGAATCCAATAGGGATGAATATCAGCTGTCTCATGATCTAACTGAGATAGTCCTTCAATTTCCTTCAACTGCATCTCAATTAACAGCTAGACTTAGTCGTAGCTGCATGAAAATAGACCATTGTGTCATCGAGTACAGGCAACAAGTACCCATAAACGCAACTGGTACAGTTATTGTGGAGATCCATGACAAAAGGATGATTGACAACGAATCCTTACAAGCGTCATGGACATTTCCAATTAGATGCAACATAGATCTCCACTATTTTTCATCGTCCTTTTTCTCGCTAAAAGACCCAATTCCATGGAAGCTGTATTACAGGGTTAGCGACACAAATGTCCACCACAGAACGCATTTTGCCAAGTTCAAGGGAAAATGGAAGTTGTCCACGGCGAAACATTCGGTGGATATCCCATTCCGGGCACCGACGGTCAAAATACTATCCAAACAATTCTCGCATAAAGATGTGGATTTTACACATGTGGACTACGGACGATGGGAACGGAAAACGTTGAGGTCCACATCAATATCAAGAGTTGGGTTACCCGGCCCAATTGAATTAAGACCAGGTGAATCGTGGGCTTCAAAGAGTACAATTGGGCTAGCCCACACAGATACTGATTCAGAGTTGGACAACGCGTTACACCCCTATAAAGAACTAAATCGTTTGGGAGCAAGCGTCCTAGACCCAGGAGATTCAGCATCACAAGCCGGGTTACAACGGGCCCAATCAAACATTACAATGTCAATGGCCCAATTAAACGAGTTAGTTAGGACAACGGTCCATGAATGTATAAACACAAACTGTAATTCCAATCCGCCTAAATCTTTGAAATAA
Protein Sequence MDSQLANPPNAFNYIESNRDEYQLSHDLTEIVLQFPSTASQLTARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINATGTVIVEIHDKRMIDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVSDTNVHHRTHFAKFKGKWKLSTAKHSVDIPFRAPTVKILSKQFSHKDVDFTHVDYGRWERKTLRSTSISRVGLPGPIELRPGESWASKSTIGLAHTDTDSELDNALHPYKELNRLGASVLDPGDSASQAGLQRAQSNITMSMAQLNELVRTTVHECINTNCNSNPPKSLK

References More References in PubMed

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Minimal genomic variability in Merremia mosaic virus isolates endemic in Merremia spp and cultivated tomato in Puerto Rico.

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A Bipartite Begomovirus Infecting Boerhavia erecta (Family Nyctaginaceae) in the Dominican Republic Represents a Distinct Phylogenetic Lineage and has a High Degree of Host Specificity.

Melgarejo TA, et al.  Phytopathology. 2019 Aug;109(8):1464-1474. doi: 10.1094/PHYTO-02-19-0061-R. Epub 2019 Jul 11.

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