Melon chlorotic leaf curl virus


Basic Information

Genus Begomovirus
NCBI Assembly GCF_001430695.1
Isolate Guatemala
Release date 2015/11/3
Submitter Brown,J.K., Idris,A.M., Rogan,D., Hussein,M.H., Palmieri,M., Mills-Lujan,K., Martin,K.
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Genomic Organization


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Genome

NC_028138
ACCGGATGGCCGCCCTTTTTTGGTGTCCTCCACTTTATTCCCGGGCCTGGACCATCTGCGGTGTGCAGGATGAAAGGCCCAGCCCATCTTGACGTGCGCCTTTACTCTTTATGGGACCACACAGCACAAACAACCAATCATATTCGGAGTTTGTATCTTGTATATCTGCTAATTGTAACACAATGGTGGACCCATGTGAACATTGTGCTGTGTAAGAAACTTCGTCTTTAATTCAAATTGCCAAAGTGGGCATCTCGTCTTTATTTTGAACATTTAAAGAAAGCTGTACGAATGTCAGCTTTAACCCATTACTTCTTCGCTCGGTACCGCATATTAATAATTTGAATTATACTTTATTGTGGCCAATTACATTTCAACTACGTGTCTTGTTAGATGATCAGGACCACGTTATTTGTCTATTTATATGTGCTTCGTGTAATTGGCCTCCACGTCGTATACATGCTTTAGCCACATTGTTTAGTTTATACACGATTGATATCGGGTATAGTATTTAATTTACCTGTTCGTTATGTATTCGGCGAACTATAGACGTACTCGTGGGACTACCCAACGTGGTTCATATTCACGACGTCCAATATTCAAGCGTCCACATTATTTGTCTCGGTCAGATGATAAGCGTCGCACTAATTCGACTATTGTGCCTCATGCCGACACTAAGATGTTAAAACAACGGTTGCATGAGGATCAATTTGGCCCAGATTATGTTTTGTGTCATAATAGTGCGATGTCCACGTTTATTACTCTTCCTAGTCTTGGTAAGCACGAGCCCAATCGTTCAAGGTCGTTTATAAAGTTACAACGACTCCGTTACAAGGGAACTCTGAAAATTGAACGTGGACCTGGTGACACGTTCATGGAAGGTCCCACGTCAAAGGTAGAAGGCGTCTTTTCTATGGTAGTTGTGGTTGATCGTAAACCACATGTTAACCCATCTGGACGCTTACATTCCTTTGATGAGTTATTCGGCGCGCGTATCCATAGTCACGGTAATTTAGCCATAGTCCCGGCATTGAAGGAGCGTTTTTACATTCGCCACGTATTGAAACGAGTATTATCCGTCGAGAAAGACACGTTGATGGTTGATCTACATGGAACAACCGCATTATCTAATAGGCGATTCAATTGTTGGTCCTCGTTTAATGATCTTGAACGCGATTCATGTAACGGCGTTTACGCTAATATAAACAAGAACGCTCTTTTAGTTTATTATTGTTGGATGTCGGATATGCCTTCGAAGGCATCGACATATGTAACGTTTGATCTCGACTATGTCGGATAAATAGGAATATTTTATTGATCAAATATGTTGCCTACCGCCATATATTACAAACAATAATCTTTTACCCAGATCTTTTAATTAAACCCGTAGTTTAATTATCCTATTAAATATGGCCACGCAGTGGAACACTCTCCAAAATGAAGAACAGCAATATTTTCATTAACCAATTATCGTCATGATGTGACAATAAACCTAAATACAATATTATCCTAAGGATTTTGGAGTTGAGGGAATACAACTGGTCTTGATGCACTCCTGAACGGTGGATCTAACTAATTCGTTCAGTTGTGCCATTGACATGGTAATGTTTGATTGCGACCGTTGTATTCCGACCATTGACGCCGATTCTCCAGGGTCTAATATAGATGTACCCAACCTGTTAAGCTCGCGATAGGGAAGCATCTCATCTGTTGTATCCAAGTCCGCATTTAGTGGGCTCGTACCCAGAGCACTTCTAGTGGCCCAAGATTCGCCTGGATTTAATTCAATTGGGCCTCTGAGCCCATATCTTGACATCGATGCGGATTTGACCAGTCTTCTCTCCCATTTGCCGTACCCAACGTGCCAGAAATCGACGTCCTTTTGGCTAAATTGCTTTGTAAGGATTTTGACTGTTGGTGCCCGGAAGGGAATATCGACGGAATGTTTCGCCGACGATAACTTCAATTTACCTTTGAATTTAGCGAAATGAGTCATCTGATGCACGTTCGAGTCTGTTACCCGATAATATAACTTCCAAGGAATGGGATCTTTGAGAGAGAAGAATGATGACGAGAAATAGTGGAGATCTATGTTACATCTGATCGGAAACGTCCACGAGGCTTGTAAGGACTCATTGTCGGTCATTCGTTTATCGTGAATCTCCACTATTACTGTTCCAGATGCGTTGATAGGTACTTGTTGCCTATATTCTATGACACAATGGTCGATCTTCATACAACTCCGACTAAGTCTTGCAGTTAATTGGGAAGTAGTCGACGGAAATTGCAGAATAATTTCCGTTAAGTCGTGCGATAACTGAAATTCATCCCGACTAGACTCTATATAATTGAACGCATTCGGTGGAGGAGCTAATTGAGAACCCATTTAGAGAAACACAAATCTTGTCATGCTAATTCGGAAACGGACACTGCGTATAAATAATAATTCATGACTCGGATATGAGGAACGAAGTTTGTTAGGGTTTCAATGGCATATTTTGTAGATATGATTCGGGACACCAGGAGGAGCTCTCTCTAAAACCTATATTTGTGGTGTCCTGGTGTCCTATATATACTACAAGGCTTCTAGGAGGCTACTAGGACACCAGGGGTAAATTCGGCCATCCGCAATAATATT

NC_004732
ACCGGATGGCCGCCCTTTTTTGGTGTCCTACACTTTATCCCAGGCCCAAGCCCAAAGCAACCACAACCTTTACTTTTCTATGGGACCACTATAATTATTCCAACCTATCAAATCGCTCCAGTACAGTCTATATAATTATGCCTTGGTGAGTCAGCGTGGTCCCTATAAATGAAAGCAGTCTAAACCCATACCTCTTTAATTCGAAATGGTTAAGAGGGATGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCTCCAAGGTTTCCCGCTCTGCTAATTATTCGCCTCGTGGAGGTATGGGCCCTAAATTCAATAAGGCCGCTGCATGGGTTAATAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATTTATCGCACGTTACGAGGTCCTGACATCCCCAAAGGATGTGAAGGACCATGCAAGGTTCAATCATTTGAGCAGCGGCATGATATCTCTCATATTGGTAAGGTTATGTGTATTTCTGACGTGACGCGTGGCAATGGTATTACTCACCGCGTCGGCAAGCGTTTTTGTGTTAAGTCTGTATATATTTTAGGCAAGATATGGATGGACGAAAACATCAAGCTGAAGAATCACACAAACAGTGTGATGTTTTGGCTAGTTCGAGATCGGAGACCCTATGGCACTCCTATGGATTTCGGCCAAGTATTCAACATGTTTGACAACGAGCCTAGCACTGCAACCGTTAAGAACGATCTACGAGATCGTTATCAAGTTTTGCACAGGTTTTACGCGAAAGTCACTGGTGGTCAGTATGCTAGCAACGAACAAGCCTTGGTGAGGCGTTTTTGGAAGGTCAACAATTATGTTGTCTACAATCACCAGGAAGCAGCAAAATACGAGAATCATACGGAGAACGCTTTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCATCTAACCCTGTGTACGCGACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAATAAACGTTGAATTTTATTATATGATTCTCGATTACATAATTTACATATGAACGGTCTGTCGCCCATGATACAGCACGTATGACGTTATTGAGACCGATAACCCCTAATCTATCTAAATACAACATAACTAAATGTTTAAATCTATTTAAATAAGTCGTCCCAGAAGCTCGAATCGATTCCGTCCAGACTTGGAAGTTCAGGTATGCTTTGTGAAGATTTAGCGCTCTCCGCAGGTTGTGGTTGAATCGGATTTGTATGTGGTATATTCTTGTGTGCGTATACAGTGGATCCTCCACTTTGTATATCTTGAAATAGAGGGGATTTGGAACTTCCCAGATAAAAACGGAATTCTCCGCCTGATACACAGTGATGTCTTCCCAAGTGCGTAAATCCATTACCATTTTTTTGGCAGCTAAGATGGAGGAATATGGAACAGCCGCAGTTCAGGTCGATGCGTCTACGACGGATAGCTCTTGTTTTAGCGATCTTGTGTTGTGCTTTGATAGAGGGGGCAGTCGAGGAAGATGAATTGGGCATTTTTTAGTGTCCACTCTCTTAGTGCTGCATTTTCAGCTTTGTCGAGAAACTCTTTATAGCTGGCCCCCTCTCCGGGATTGCAAAGCACTATTGATGGGATTCCACCTTTAATTTGAACCGGCTTTCCATATTTACAGTTGGACTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCAATCAATTCTTTCCAGTGCTTTAGCTTTAAATAATGCGGAGCGACGTCATCAATGACGTTATACTTGACGTCATTTGAGAAAACCCTAGAATTGAAATCAAGGTGTCCACTCAAATAGTTATGTGGGCCTAAAGACCGAGCCCACATTGTTTTGCCCGTTCGAGAATCACCCTCAATTATTACACTAATAGGTCTATTACACACGTTATTTGATTCTTTTATTAAAAATGGCCGCGCAGCTGAACATTCATTAAAATAATGATCAGCCCAATCTTTTAACTCTTCTGGAACATTTGTAAACGAAGAAAGTTCATATGGGGGAACCCATGGCATTGGAGGTTTATGAAATAGGCGATCGACGTTAGCCGTTATGTTATGGTAACTCACTATAAACGTCTTTGGATCGCCAGCTTTTATAATGTCGAGAGCCTCTCCCGCACTTGCTGCATTGACGGCGTTGTGATAAACGTCGTCTTTATTGGACTTTGAACCCCCAGACACCTTATATTGCCCGAATTCACAATAATCACCTTCTTTGGTGATGTAATTCTTGACGGCATTGGTGTCTTTGGCAGCTTGAATATTAGGGTGAAATCGGGCAGACCTTCTTGGGTGAGTAATGTCGAAAAATCCAGCATCCTTGATGTTTGACTTGCCTGAAAGTTGAACGAGGCAGTGTAAGTGCGGGAACCCATCTGCGTGTTCCTCTCGTGCGACACGGATATATGTCGGTTTGACGACTGACCAGGATAGACCTTGCAGTATTTCAAGAACTTCATCTTTGGGAACATCGCACTTCGGATATGTTAGGAAAATATTTCTGGCAGATAAGCGGAACGATTTAGGGTTCTGTGGCATATTTTGTAAATATGAGCCGGGACACCAGGAGGAGCTCTCTCTAAAACCTATATTTGTGGTGTCCTGGTGTCCTATATATACTACAAGGCTTCTAGGAGGCTTCTAGGACACCAGGGGTAAATTCGGCCATCCGCAATAATATT

Gene Information

NCBI Accession YP_009175072.1
Location 530-1300
Gene Name BV1
Protein Name nuclear shuttle protein
Coding Region ATGTATTCGGCGAACTATAGACGTACTCGTGGGACTACCCAACGTGGTTCATATTCACGACGTCCAATATTCAAGCGTCCACATTATTTGTCTCGGTCAGATGATAAGCGTCGCACTAATTCGACTATTGTGCCTCATGCCGACACTAAGATGTTAAAACAACGGTTGCATGAGGATCAATTTGGCCCAGATTATGTTTTGTGTCATAATAGTGCGATGTCCACGTTTATTACTCTTCCTAGTCTTGGTAAGCACGAGCCCAATCGTTCAAGGTCGTTTATAAAGTTACAACGACTCCGTTACAAGGGAACTCTGAAAATTGAACGTGGACCTGGTGACACGTTCATGGAAGGTCCCACGTCAAAGGTAGAAGGCGTCTTTTCTATGGTAGTTGTGGTTGATCGTAAACCACATGTTAACCCATCTGGACGCTTACATTCCTTTGATGAGTTATTCGGCGCGCGTATCCATAGTCACGGTAATTTAGCCATAGTCCCGGCATTGAAGGAGCGTTTTTACATTCGCCACGTATTGAAACGAGTATTATCCGTCGAGAAAGACACGTTGATGGTTGATCTACATGGAACAACCGCATTATCTAATAGGCGATTCAATTGTTGGTCCTCGTTTAATGATCTTGAACGCGATTCATGTAACGGCGTTTACGCTAATATAAACAAGAACGCTCTTTTAGTTTATTATTGTTGGATGTCGGATATGCCTTCGAAGGCATCGACATATGTAACGTTTGATCTCGACTATGTCGGATAA
Protein Sequence MYSANYRRTRGTTQRGSYSRRPIFKRPHYLSRSDDKRRTNSTIVPHADTKMLKQRLHEDQFGPDYVLCHNSAMSTFITLPSLGKHEPNRSRSFIKLQRLRYKGTLKIERGPGDTFMEGPTSKVEGVFSMVVVVDRKPHVNPSGRLHSFDELFGARIHSHGNLAIVPALKERFYIRHVLKRVLSVEKDTLMVDLHGTTALSNRRFNCWSSFNDLERDSCNGVYANINKNALLVYYCWMSDMPSKASTYVTFDLDYVG

NCBI Accession YP_009175073.1
Location 1505-2386
Gene Name BC1
Protein Name movement protein
Coding Region ATGGGTTCTCAATTAGCTCCTCCACCGAATGCGTTCAATTATATAGAGTCTAGTCGGGATGAATTTCAGTTATCGCACGACTTAACGGAAATTATTCTGCAATTTCCGTCGACTACTTCCCAATTAACTGCAAGACTTAGTCGGAGTTGTATGAAGATCGACCATTGTGTCATAGAATATAGGCAACAAGTACCTATCAACGCATCTGGAACAGTAATAGTGGAGATTCACGATAAACGAATGACCGACAATGAGTCCTTACAAGCCTCGTGGACGTTTCCGATCAGATGTAACATAGATCTCCACTATTTCTCGTCATCATTCTTCTCTCTCAAAGATCCCATTCCTTGGAAGTTATATTATCGGGTAACAGACTCGAACGTGCATCAGATGACTCATTTCGCTAAATTCAAAGGTAAATTGAAGTTATCGTCGGCGAAACATTCCGTCGATATTCCCTTCCGGGCACCAACAGTCAAAATCCTTACAAAGCAATTTAGCCAAAAGGACGTCGATTTCTGGCACGTTGGGTACGGCAAATGGGAGAGAAGACTGGTCAAATCCGCATCGATGTCAAGATATGGGCTCAGAGGCCCAATTGAATTAAATCCAGGCGAATCTTGGGCCACTAGAAGTGCTCTGGGTACGAGCCCACTAAATGCGGACTTGGATACAACAGATGAGATGCTTCCCTATCGCGAGCTTAACAGGTTGGGTACATCTATATTAGACCCTGGAGAATCGGCGTCAATGGTCGGAATACAACGGTCGCAATCAAACATTACCATGTCAATGGCACAACTGAACGAATTAGTTAGATCCACCGTTCAGGAGTGCATCAAGACCAGTTGTATTCCCTCAACTCCAAAATCCTTAGGATAA
Protein Sequence MGSQLAPPPNAFNYIESSRDEFQLSHDLTEIILQFPSTTSQLTARLSRSCMKIDHCVIEYRQQVPINASGTVIVEIHDKRMTDNESLQASWTFPIRCNIDLHYFSSSFFSLKDPIPWKLYYRVTDSNVHQMTHFAKFKGKLKLSSAKHSVDIPFRAPTVKILTKQFSQKDVDFWHVGYGKWERRLVKSASMSRYGLRGPIELNPGESWATRSALGTSPLNADLDTTDEMLPYRELNRLGTSILDPGESASMVGIQRSQSNITMSMAQLNELVRSTVQECIKTSCIPSTPKSLG

NCBI Accession NP_835272.1
Location 206-961
Gene Name AV1
Protein Name coat protein
Coding Region ATGGTTAAGAGGGATGCCCCATGGCGTTTAATGGCGGGGACCTCCAAGGTTTCCCGCTCTGCTAATTATTCGCCTCGTGGAGGTATGGGCCCTAAATTCAATAAGGCCGCTGCATGGGTTAATAGGCCCATGTACAGGAAGCCCAGAATTTATCGCACGTTACGAGGTCCTGACATCCCCAAAGGATGTGAAGGACCATGCAAGGTTCAATCATTTGAGCAGCGGCATGATATCTCTCATATTGGTAAGGTTATGTGTATTTCTGACGTGACGCGTGGCAATGGTATTACTCACCGCGTCGGCAAGCGTTTTTGTGTTAAGTCTGTATATATTTTAGGCAAGATATGGATGGACGAAAACATCAAGCTGAAGAATCACACAAACAGTGTGATGTTTTGGCTAGTTCGAGATCGGAGACCCTATGGCACTCCTATGGATTTCGGCCAAGTATTCAACATGTTTGACAACGAGCCTAGCACTGCAACCGTTAAGAACGATCTACGAGATCGTTATCAAGTTTTGCACAGGTTTTACGCGAAAGTCACTGGTGGTCAGTATGCTAGCAACGAACAAGCCTTGGTGAGGCGTTTTTGGAAGGTCAACAATTATGTTGTCTACAATCACCAGGAAGCAGCAAAATACGAGAATCATACGGAGAACGCTTTATTATTGTATATGGCATGTACTCATGCATCTAACCCTGTGTACGCGACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTATGATTCGATAACAAATTAA
Protein Sequence MVKRDAPWRLMAGTSKVSRSANYSPRGGMGPKFNKAAAWVNRPMYRKPRIYRTLRGPDIPKGCEGPCKVQSFEQRHDISHIGKVMCISDVTRGNGITHRVGKRFCVKSVYILGKIWMDENIKLKNHTNSVMFWLVRDRRPYGTPMDFGQVFNMFDNEPSTATVKNDLRDRYQVLHRFYAKVTGGQYASNEQALVRRFWKVNNYVVYNHQEAAKYENHTENALLLYMACTHASNPVYATLKIRIYFYDSITN

NCBI Accession NP_835273.1
Location 958-1362
Gene Name AC3
Protein Name replicase-associated protein
Coding Region ATGGTAATGGATTTACGCACTTGGGAAGACATCACTGTGTATCAGGCGGAGAATTCCGTTTTTATCTGGGAAGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATATACAAAGTGGAGGATCCACTGTATACGCACACAAGAATATACCACATACAAATCCGATTCAACCACAACCTGCGGAGAGCGCTAAATCTTCACAAAGCATACCTGAACTTCCAAGTCTGGACGGAATCGATTCGAGCTTCTGGGACGACTTATTTAAATAGATTTAAACATTTAGTTATGTTGTATTTAGATAGATTAGGGGTTATCGGTCTCAATAACGTCATACGTGCTGTATCATGGGCGACAGACCGTTCATATGTAAATTATGTAATCGAGAATCATATAATAAAATTCAACGTTTATTAA
Protein Sequence MVMDLRTWEDITVYQAENSVFIWEVPNPLYFKIYKVEDPLYTHTRIYHIQIRFNHNLRRALNLHKAYLNFQVWTESIRASGTTYLNRFKHLVMLYLDRLGVIGLNNVIRAVSWATDRSYVNYVIENHIIKFNVY

NCBI Accession NP_835274.1
Location 1103-1498
Gene Name AC2
Protein Name transactivation protein
Coding Region ATGCCCAATTCATCTTCCTCGACTGCCCCCTCTATCAAAGCACAACACAAGATCGCTAAAACAAGAGCTATCCGTCGTAGACGCATCGACCTGAACTGCGGCTGTTCCATATTCCTCCATCTTAGCTGCCAAAAAAATGGTAATGGATTTACGCACTTGGGAAGACATCACTGTGTATCAGGCGGAGAATTCCGTTTTTATCTGGGAAGTTCCAAATCCCCTCTATTTCAAGATATACAAAGTGGAGGATCCACTGTATACGCACACAAGAATATACCACATACAAATCCGATTCAACCACAACCTGCGGAGAGCGCTAAATCTTCACAAAGCATACCTGAACTTCCAAGTCTGGACGGAATCGATTCGAGCTTCTGGGACGACTTATTTAAATAG
Protein Sequence MPNSSSSTAPSIKAQHKIAKTRAIRRRRIDLNCGCSIFLHLSCQKNGNGFTHLGRHHCVSGGEFRFYLGSSKSPLFQDIQSGGSTVYAHKNIPHTNPIQPQPAESAKSSQSIPELPSLDGIDSSFWDDLFK

NCBI Accession NP_835275.1
Location 1440-2519
Gene Name AC1
Protein Name replication-associated protein
Coding Region ATGCCACAGAACCCTAAATCGTTCCGCTTATCTGCCAGAAATATTTTCCTAACATATCCGAAGTGCGATGTTCCCAAAGATGAAGTTCTTGAAATACTGCAAGGTCTATCCTGGTCAGTCGTCAAACCGACATATATCCGTGTCGCACGAGAGGAACACGCAGATGGGTTCCCGCACTTACACTGCCTCGTTCAACTTTCAGGCAAGTCAAACATCAAGGATGCTGGATTTTTCGACATTACTCACCCAAGAAGGTCTGCCCGATTTCACCCTAATATTCAAGCTGCCAAAGACACCAATGCCGTCAAGAATTACATCACCAAAGAAGGTGATTATTGTGAATTCGGGCAATATAAGGTGTCTGGGGGTTCAAAGTCCAATAAAGACGACGTTTATCACAACGCCGTCAATGCAGCAAGTGCGGGAGAGGCTCTCGACATTATAAAAGCTGGCGATCCAAAGACGTTTATAGTGAGTTACCATAACATAACGGCTAACGTCGATCGCCTATTTCATAAACCTCCAATGCCATGGGTTCCCCCATATGAACTTTCTTCGTTTACAAATGTTCCAGAAGAGTTAAAAGATTGGGCTGATCATTATTTTAATGAATGTTCAGCTGCGCGGCCATTTTTAATAAAAGAATCAAATAACGTGTGTAATAGACCTATTAGTGTAATAATTGAGGGTGATTCTCGAACGGGCAAAACAATGTGGGCTCGGTCTTTAGGCCCACATAACTATTTGAGTGGACACCTTGATTTCAATTCTAGGGTTTTCTCAAATGACGTCAAGTATAACGTCATTGATGACGTCGCTCCGCATTATTTAAAGCTAAAGCACTGGAAAGAATTGATTGGGGCCCAAAGGGACTGGCAGTCCAACTGTAAATATGGAAAGCCGGTTCAAATTAAAGGTGGAATCCCATCAATAGTGCTTTGCAATCCCGGAGAGGGGGCCAGCTATAAAGAGTTTCTCGACAAAGCTGAAAATGCAGCACTAAGAGAGTGGACACTAAAAAATGCCCAATTCATCTTCCTCGACTGCCCCCTCTATCAAAGCACAACACAAGATCGCTAA
Protein Sequence MPQNPKSFRLSARNIFLTYPKCDVPKDEVLEILQGLSWSVVKPTYIRVAREEHADGFPHLHCLVQLSGKSNIKDAGFFDITHPRRSARFHPNIQAAKDTNAVKNYITKEGDYCEFGQYKVSGGSKSNKDDVYHNAVNAASAGEALDIIKAGDPKTFIVSYHNITANVDRLFHKPPMPWVPPYELSSFTNVPEELKDWADHYFNECSAARPFLIKESNNVCNRPISVIIEGDSRTGKTMWARSLGPHNYLSGHLDFNSRVFSNDVKYNVIDDVAPHYLKLKHWKELIGAQRDWQSNCKYGKPVQIKGGIPSIVLCNPGEGASYKEFLDKAENAALREWTLKNAQFIFLDCPLYQSTTQDR